More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_1434 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_1434  DNA replication protein DnaC, putative  100 
 
 		 259 aa  534  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0137  IstB domain protein ATP-binding protein  36.44 
 
 		 284 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.118943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1277  IstB domain protein ATP-binding protein  36.44 
 
 		 284 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0461295 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1319  IstB ATP binding domain-containing protein  39.36 
 
 		 257 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1566  DNA replication protein DnaC, putative  36.03 
 
 		 286 aa  162  7e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0658558  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3956  IstB ATP binding domain-containing protein  35.94 
 
 		 260 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1255  putative replication protein DnaC  35.97 
 
 		 276 aa  154  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0168344  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3438  IstB ATP binding domain-containing protein  37.85 
 
 		 268 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228593  unclonable  9.96626e-17 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0638  IstB ATP binding domain-containing protein  36.86 
 
 		 257 aa  151  1e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.965458  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1552  IstB domain protein ATP-binding protein  37.1 
 
 		 234 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000031305 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1054  putative replication protein  41.83 
 
 		 249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.547763  hitchhiker  0.000000820302 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1084  putative replication protein  41.83 
 
 		 249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.372508  hitchhiker  0.0000157316 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2283  putative replication protein  41.83 
 
 		 249 aa  145  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0552648  normal  0.146717 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4129  IstB ATP binding domain-containing protein  36.18 
 
 		 264 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.695799 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04238  DNA biosynthesis protein  37.89 
 
 		 245 aa  130  3e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000679952  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3636  AAA ATPase  37.89 
 
 		 245 aa  130  3e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000285217  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4797  DNA replication protein DnaC  38.95 
 
 		 245 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.849133 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04204  hypothetical protein  37.89 
 
 		 245 aa  130  3e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000534515  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5874  DNA replication protein DnaC  37.89 
 
 		 245 aa  130  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000300612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4864  DNA replication protein DnaC  38.95 
 
 		 245 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4906  DNA replication protein DnaC  37.89 
 
 		 245 aa  130  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000177661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3694  DNA replication protein DnaC  37.89 
 
 		 245 aa  130  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000380442  hitchhiker  0.00426992 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4954  DNA replication protein DnaC  37.89 
 
 		 245 aa  130  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163404  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2275  putative replication protein  38.92 
 
 		 246 aa  130  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00200673  hitchhiker  0.0000000000000951726 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4901  DNA replication protein DnaC  37.89 
 
 		 245 aa  130  3e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000247783  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4951  DNA replication protein DnaC  38.95 
 
 		 245 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4898  DNA replication protein DnaC  38.95 
 
 		 245 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.953972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4593  DNA replication protein DnaC  37.89 
 
 		 245 aa  130  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000805827  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4957  DNA replication protein DnaC  38.95 
 
 		 245 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.178341  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2283  IstB domain protein ATP-binding protein  37.44 
 
 		 248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.681758  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1153  putative replication protein  38.42 
 
 		 248 aa  126  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.255011 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1434  putative replication protein  37.93 
 
 		 248 aa  125  5e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00253442  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0516  DNA replication protein DnaC  36.84 
 
 		 245 aa  125  8.000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00591707 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1260  putative replication protein  36.95 
 
 		 248 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000160786  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0425  hypothetical protein  31.78 
 
 		 267 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0439  hypothetical protein  31.78 
 
 		 267 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00568017  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3827  hypothetical protein  31.78 
 
 		 267 aa  109  5e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.745457  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4120  hypothetical protein  31.78 
 
 		 267 aa  109  5e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4023  hypothetical protein  31.79 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2486  hypothetical protein  30.53 
 
 		 261 aa  89.4  6e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1289  AAA ATPase  28.72 
 
 		 247 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.36867 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0041  hypothetical protein  30.32 
 
 		 241 aa  79  0.00000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4220  IstB domain protein ATP-binding protein  28.17 
 
 		 261 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2785  IstB domain protein ATP-binding protein  28.34 
 
 		 275 aa  73.2  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1702  IstB domain protein ATP-binding protein  26.92 
 
 		 245 aa  72.8  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0058  IS21 family transposition helper protein  34.46 
 
 		 265 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23130  AAA ATPase  25.93 
 
 		 348 aa  71.6  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1147  IstB ATP binding domain-containing protein  29.83 
 
 		 263 aa  70.9  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000971836  decreased coverage  0.00111999 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1184  IstB-like ATP-binding protein  26.29 
 
 		 270 aa  70.9  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.580215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0514  IstB ATP binding domain-containing protein  32.19 
 
 		 469 aa  70.5  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3988  IstB ATP binding domain-containing protein  26.1 
 
 		 263 aa  70.5  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332304 
 
 
-
 
NC_002936  DET0538  ATP-binding protein  30.56 
 
 		 426 aa  70.5  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.436507  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0018  IS21 family transposition helper protein  33.11 
 
 		 264 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0341022  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0042  IS21 family transposition helper protein  33.11 
 
 		 264 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.932139  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0885  phage DnaC-like protein  27.92 
 
 		 259 aa  70.1  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2922  IS21 family transposition helper protein  33.11 
 
 		 264 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3339  IS21 family transposition helper protein  33.11 
 
 		 264 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0035  IS21 family transposition helper protein  33.11 
 
 		 264 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0995  IS21 family transposition helper protein  33.11 
 
 		 264 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0868  DNA replication protein-like protein  27.92 
 
 		 259 aa  70.1  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.752635  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2227  IS21 family transposition helper protein  33.11 
 
 		 264 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.703207  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5107  IstB ATP binding domain-containing protein  33.11 
 
 		 285 aa  70.1  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.269436  normal  0.115979 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1458  IstB-like ATP-binding protein  33.11 
 
 		 285 aa  69.7  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4929  IstB ATP binding domain-containing protein  33.11 
 
 		 285 aa  70.1  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.155263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1816  IstB domain protein ATP-binding protein  29.05 
 
 		 280 aa  69.7  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1864  IstB domain protein ATP-binding protein  29.41 
 
 		 270 aa  68.6  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1404  IstB ATP binding domain-containing protein  27.38 
 
 		 267 aa  67.4  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0211  transposition helper protein, IS21 family  31.82 
 
 		 252 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233513 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2340  IstB domain protein ATP-binding protein  29.75 
 
 		 241 aa  67  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0243849  decreased coverage  0.0019144 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2013  AAA ATPase  24.68 
 
 		 283 aa  67  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0083652  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1802  hypothetical protein  24.56 
 
 		 275 aa  65.5  0.0000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0785  IstB domain protein ATP-binding protein  25.32 
 
 		 264 aa  64.7  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.910617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3709  DNA replication protein-like protein  31.54 
 
 		 293 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.860458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0893  IstB ATP binding domain-containing protein  25.7 
 
 		 241 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1499  IstB domain protein ATP-binding protein  26.87 
 
 		 247 aa  64.7  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0674056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9616  IS21 family transposase  33.11 
 
 		 195 aa  64.3  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0788142  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2418  DNA replication protein DnaC  34.11 
 
 		 347 aa  63.9  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.132459  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0089  IstB ATP binding domain-containing protein  27.85 
 
 		 266 aa  63.5  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1082  IstB domain protein ATP-binding protein  30.52 
 
 		 258 aa  63.2  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0856572  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0118  IstB domain protein ATP-binding protein  30.52 
 
 		 258 aa  63.2  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0604  IstB-like ATP-binding protein  28.86 
 
 		 277 aa  62.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1001  IstB-like ATP-binding protein  28.86 
 
 		 277 aa  62.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045417 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3060  IstB-like ATP-binding protein  28.86 
 
 		 277 aa  62.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.509299  normal  0.0540885 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4491  IstB-like ATP-binding protein  28.86 
 
 		 277 aa  62.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.182494 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0134  IstB domain protein ATP-binding protein  30.41 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1848  IstB domain protein ATP-binding protein  30.41 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5620  IstB ATP binding domain-containing protein  32 
 
 		 283 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.124688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5533  IstB ATP binding domain-containing protein  32.48 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2797  IstB ATP binding domain-containing protein  32.48 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1509  IstB ATP binding domain-containing protein  32.48 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1463  IstB ATP binding domain-containing protein  32.48 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4701  IstB ATP binding domain-containing protein  32.48 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.193012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0060  DNA replication protein, DNAC-like  31.29 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7012  hypothetical protein  32.48 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3887  IstB ATP binding domain-containing protein  32.48 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6915  IstB ATP binding domain-containing protein  32.48 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2451  IstB ATP binding domain-containing protein  32.48 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.212902 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3170  DNA replication protein-like protein  29.63 
 
 		 249 aa  62  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2615  DNA replication protein-like protein  23.18 
 
 		 234 aa  62  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00158711  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0503  hypothetical protein  26.22 
 
 		 280 aa  61.6  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000358381  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>