More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1006 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1006  MalG-type ABC sugar transport system permease component  100 
 
 
335 aa  678    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.541487  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0927  MalG-type ABC sugar transport systems permease component  86.27 
 
 
335 aa  593  1e-168  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0503767  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4418  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.24 
 
 
301 aa  393  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.77 
 
 
283 aa  380  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.267777  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0103  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.78 
 
 
300 aa  363  3e-99  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0577921 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06570  carbohydrate ABC transporter membrane protein  56.86 
 
 
322 aa  352  4e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04090  carbohydrate ABC transporter membrane protein  43.11 
 
 
315 aa  282  7.000000000000001e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3302  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 
313 aa  276  4e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.757671  normal  0.0135011 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1456  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.78 
 
 
286 aa  268  8e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.32 
 
 
278 aa  254  1.0000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66981  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03900  carbohydrate ABC transporter membrane protein  41.86 
 
 
302 aa  249  4e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.232057 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0380  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.23 
 
 
301 aa  246  4.9999999999999997e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04020  carbohydrate ABC transporter membrane protein  45.82 
 
 
307 aa  246  6e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1929  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.04 
 
 
280 aa  242  6e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0242548  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17040  carbohydrate ABC transporter membrane protein  44.27 
 
 
299 aa  233  3e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0241392  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5097  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.38 
 
 
301 aa  232  5e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00257008  normal  0.121163 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0308  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.35 
 
 
276 aa  232  8.000000000000001e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.136285  normal  0.16361 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.23 
 
 
297 aa  230  3e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4190  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.39 
 
 
309 aa  228  9e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0132992  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4057  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.6 
 
 
277 aa  223  3e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1764  MalG-type ABC sugar transport system permease component  37.65 
 
 
316 aa  210  4e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.335496  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4953  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.87 
 
 
316 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.482882  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3148  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.86 
 
 
311 aa  160  3e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00417428  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
281 aa  159  5e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2681  Monosaccharide-transporting ATPase  40.09 
 
 
278 aa  158  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.515759  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11620  ABC-type sugar transport system, permease component  29.94 
 
 
306 aa  154  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00242068  normal  0.0915178 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0497  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.34 
 
 
306 aa  154  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000825086 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21170  carbohydrate ABC transporter membrane protein  31.92 
 
 
302 aa  154  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.281989  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00882  L-arabinose transport system permease protein AraQ  37.56 
 
 
278 aa  152  8e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0407955  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2135  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.85 
 
 
296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
278 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.519096  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.11 
 
 
298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.7 
 
 
277 aa  147  3e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000457855  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3639  monosaccharide-transporting ATPase  34.64 
 
 
292 aa  146  6e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2199  monosaccharide-transporting ATPase  33.7 
 
 
269 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.139368  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1021  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.97 
 
 
246 aa  145  8.000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0036  sugar ABC transporter, permease protein  31.48 
 
 
276 aa  144  1e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.385725  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7904  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.29 
 
 
271 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4881  monosaccharide-transporting ATPase  33.84 
 
 
269 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.196924  normal  0.0342078 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2646  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
275 aa  145  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2744  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
269 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.573578  normal  0.782231 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.48 
 
 
270 aa  143  4e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.668515  normal  0.267306 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3574  Monosaccharide-transporting ATPase  35.27 
 
 
290 aa  143  4e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.156852  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1881  monosaccharide-transporting ATPase  30.36 
 
 
297 aa  143  4e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.39074 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.58 
 
 
275 aa  142  6e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06939  hypothetical protein  33.21 
 
 
294 aa  142  6e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3994  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.89 
 
 
303 aa  142  8e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.947348 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.22 
 
 
294 aa  141  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000948808  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2894  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.36 
 
 
297 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.341182  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.52 
 
 
295 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0166625  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.3 
 
 
270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4567  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.44 
 
 
299 aa  140  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.62 
 
 
277 aa  140  3e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2662  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.04 
 
 
304 aa  140  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1550  MalG-type ABC sugar transport system permease component  31.27 
 
 
308 aa  139  4.999999999999999e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2716  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  31.1 
 
 
293 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.684184  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3150  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.83 
 
 
278 aa  139  6e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.198934  normal  0.328694 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.59 
 
 
269 aa  139  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.28 
 
 
299 aa  139  6e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0163331  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5763  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  34.62 
 
 
350 aa  139  7e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.411796  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0175  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.39 
 
 
278 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.419307  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.84 
 
 
297 aa  139  7.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.807172 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.88 
 
 
324 aa  139  7.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.051903  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2724  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.03 
 
 
290 aa  138  1e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.191447  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.54 
 
 
297 aa  138  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6730  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.58 
 
 
287 aa  138  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0110581  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05240  carbohydrate ABC transporter membrane protein  31.79 
 
 
312 aa  138  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
722 aa  138  1e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0626826  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0255  ABC-type maltose transport system, permease component  30.69 
 
 
276 aa  137  2e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.4 
 
 
283 aa  138  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0788706  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3104  ABC transporter, permease component  33.84 
 
 
292 aa  138  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0591  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.96 
 
 
300 aa  137  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.303793  normal  0.0150565 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1548  monosaccharide-transporting ATPase  34.46 
 
 
278 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2094  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.35 
 
 
279 aa  136  5e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179988  hitchhiker  0.00000184258 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1605  ABC transporter sugar permease  34.46 
 
 
278 aa  136  5e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.732965  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29030  carbohydrate ABC transporter membrane protein  31.41 
 
 
275 aa  135  8e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.77 
 
 
280 aa  135  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3122  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.03 
 
 
305 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.290341 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0554  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.74 
 
 
296 aa  134  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0552972  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05440  carbohydrate ABC transporter membrane protein  28.25 
 
 
307 aa  135  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.050978  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1524  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.78 
 
 
298 aa  135  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2847  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.94 
 
 
277 aa  135  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.525559  normal  0.0514603 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2023  Monosaccharide-transporting ATPase  33.09 
 
 
295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000143411  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.36 
 
 
275 aa  134  3e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.18 
 
 
273 aa  134  3e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.63 
 
 
275 aa  134  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29880  carbohydrate ABC transporter membrane protein  35.07 
 
 
304 aa  134  3e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2834  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.15 
 
 
275 aa  133  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3322  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.96 
 
 
309 aa  133  5e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0903437  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2194  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.07 
 
 
296 aa  132  6e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.982521  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4986  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.33 
 
 
301 aa  132  6.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00963253  hitchhiker  0.006941 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1700  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.1 
 
 
281 aa  132  7.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06320  carbohydrate ABC transporter membrane protein  28.9 
 
 
298 aa  132  7.999999999999999e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3989  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.51 
 
 
324 aa  132  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.44 
 
 
308 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.408611  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3392  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  31.8 
 
 
278 aa  132  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.196448  normal  0.954202 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
298 aa  131  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.2 
 
 
268 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146401  normal  0.117975 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0320  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.77 
 
 
300 aa  130  3e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.37 
 
 
284 aa  130  3e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.354053  normal  0.174244 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>