More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0256 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0256  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter permease  100 
 
 
303 aa  601  1.0000000000000001e-171  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0738977  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0488  putative oligopeptide ABC transporter, permease protein OppC  78.91 
 
 
330 aa  479  1e-134  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.359431 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2538  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.97 
 
 
314 aa  360  2e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000570196 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26150  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  60.69 
 
 
331 aa  352  5e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.286946  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2820  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.36 
 
 
330 aa  340  2e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.403444  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11070  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  51.84 
 
 
318 aa  316  4e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.682818  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.67 
 
 
326 aa  307  1.0000000000000001e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.205092 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3913  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.34 
 
 
316 aa  296  2e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12590  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  52.6 
 
 
347 aa  295  6e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.219021 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0954  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.55 
 
 
341 aa  284  1.0000000000000001e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.671843  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13694  dipeptide-transport integral membrane protein ABC transporter dppC  54.25 
 
 
266 aa  275  9e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0652275 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.03 
 
 
312 aa  271  7e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.736196  hitchhiker  0.00675709 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3821  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.95 
 
 
313 aa  268  7e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0857155  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4178  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.52 
 
 
322 aa  266  4e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.848155  hitchhiker  0.0018252 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8932  dipeptide ABC transporter (permease)  46.23 
 
 
308 aa  256  5e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3798  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.87 
 
 
322 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1081  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.21 
 
 
316 aa  250  2e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5514  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.26 
 
 
309 aa  248  8e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.647677 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3309  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  41.89 
 
 
314 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3152  oligopeptide ABC transporter (permease)  39.64 
 
 
296 aa  232  5e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0279701  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0678  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.01 
 
 
307 aa  230  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3660  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.03 
 
 
309 aa  229  3e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.505775  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.13 
 
 
280 aa  205  6e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.13 
 
 
280 aa  205  7e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.961775 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4142  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.46 
 
 
311 aa  202  6e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.910518  normal  0.0436133 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1137  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.43 
 
 
293 aa  202  8e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000296229  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1236  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.48 
 
 
284 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143707  normal  0.209567 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.43 
 
 
299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00209608  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2013  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.92 
 
 
285 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0208  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.25 
 
 
310 aa  196  6e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.373009  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.34 
 
 
344 aa  196  6e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.12 
 
 
303 aa  195  7e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2509  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.12 
 
 
303 aa  195  7e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0385  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.03 
 
 
343 aa  194  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.519425 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1435  peptide ABC transporter, permease protein  36.9 
 
 
282 aa  194  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.557175  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
280 aa  193  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.3 
 
 
299 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.74 
 
 
310 aa  191  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0465132  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1412  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.47 
 
 
342 aa  189  4e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1676  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.55 
 
 
494 aa  189  5e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0548  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.63 
 
 
310 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24260  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  41.44 
 
 
313 aa  188  8e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0420  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.92 
 
 
313 aa  188  8e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1543  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.34 
 
 
496 aa  187  1e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2032  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.76 
 
 
285 aa  187  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1343  peptide ABC transporter, permease protein, putative  41.7 
 
 
479 aa  187  2e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.736839  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0132  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.86 
 
 
300 aa  187  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.765267  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1644  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.09 
 
 
485 aa  186  6e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.431647  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0003  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.8 
 
 
313 aa  185  9e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.158402  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0958  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.79 
 
 
318 aa  184  1.0000000000000001e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.643704  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4391  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  36.07 
 
 
299 aa  183  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4232  oligopeptide transport system, permease  36.07 
 
 
299 aa  183  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4244  oligopeptide ABC transporter, permease  36.07 
 
 
299 aa  183  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0482  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.72 
 
 
313 aa  183  3e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1157  peptide ABC transporter, permease protein, putative  43.64 
 
 
473 aa  183  3e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4731  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  36.07 
 
 
299 aa  183  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4609  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  36.07 
 
 
299 aa  183  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1851  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  37.83 
 
 
331 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.737422 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2788  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.44 
 
 
310 aa  182  6e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0571  oligopeptide ABC transporter, permease protein  33.76 
 
 
313 aa  182  9.000000000000001e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1734  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.57 
 
 
304 aa  181  1e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.580513  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5914  ABC transporter, permease protein  38.05 
 
 
331 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0959358  normal  0.0354831 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2587  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.72 
 
 
341 aa  181  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.969826  hitchhiker  0.0068543 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1395  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  37.32 
 
 
288 aa  180  2.9999999999999997e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.064701  decreased coverage  0.00784209 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.64 
 
 
287 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.144364 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2756  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.11 
 
 
303 aa  180  2.9999999999999997e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2796  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.16 
 
 
299 aa  179  4e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0983  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.8 
 
 
495 aa  179  4e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.99676  normal  0.0550466 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0868  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.41 
 
 
314 aa  179  4e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2972  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.56 
 
 
301 aa  179  4e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2030  oligopeptide ABC transporter permease protein  33.56 
 
 
293 aa  179  4.999999999999999e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0128641  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1382  transmembrane ABC transporter protein  33.92 
 
 
299 aa  178  9e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.131281  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0986  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.51 
 
 
356 aa  178  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1005  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.51 
 
 
356 aa  178  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.724279  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1222  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.79 
 
 
310 aa  177  2e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1494  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.18 
 
 
497 aa  177  2e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.826633 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1822  oligopeptide transport integral membrane protein  34.72 
 
 
341 aa  177  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.661927  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0011  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 
307 aa  177  2e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36510  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  35.52 
 
 
322 aa  177  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.118572  normal  0.969549 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.83 
 
 
274 aa  176  3e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0146821  normal  0.125484 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4223  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.65 
 
 
301 aa  176  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1321  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.76 
 
 
299 aa  176  3e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.213083  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.42 
 
 
299 aa  176  3e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.356305  normal  0.757644 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2996  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.11 
 
 
307 aa  176  5e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.253818 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2964  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.44 
 
 
361 aa  176  5e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0758  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.48 
 
 
327 aa  174  9.999999999999999e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000093135  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1405  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.25 
 
 
542 aa  174  9.999999999999999e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.407034  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3001  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.49 
 
 
299 aa  175  9.999999999999999e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.499686  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0660  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.55 
 
 
311 aa  174  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2452  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.99 
 
 
296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0368392  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0326  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
313 aa  173  2.9999999999999996e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0216916  hitchhiker  0.00872775 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1493  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.18 
 
 
301 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1326  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.17 
 
 
303 aa  173  2.9999999999999996e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.999371 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1225  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.54 
 
 
332 aa  173  2.9999999999999996e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3739  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.03 
 
 
300 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146994  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1867  ABC-type transport system protein  34.19 
 
 
288 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0243  oligopeptide ABC transporter, permease protein  32.08 
 
 
307 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0211  oligopeptide ABC transporter, permease  32.08 
 
 
307 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1223  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.02 
 
 
296 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1924  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.42 
 
 
303 aa  172  9e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>