More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6556 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_6556  chemotaxis-specific methylesterase  100 
 
 
393 aa  785    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.970962  normal  0.314489 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4244  chemotaxis-specific methylesterase  77.66 
 
 
389 aa  584  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3675  chemotaxis-specific methylesterase  76.57 
 
 
385 aa  580  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.338867  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1820  chemotaxis-specific methylesterase  77.21 
 
 
370 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.353852  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3917  chemotaxis-specific methylesterase  74.94 
 
 
388 aa  568  1e-161  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3373  chemotaxis-specific methylesterase  76.4 
 
 
381 aa  565  1e-160  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.46343  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0523  chemotaxis-specific methylesterase  69.19 
 
 
425 aa  554  1e-156  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.609449 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1812  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  49.73 
 
 
382 aa  349  6e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  hitchhiker  0.00552618  normal  0.152488 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1711  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  51.62 
 
 
382 aa  348  1e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1532  protein-glutamate methylesterase  49.73 
 
 
382 aa  348  1e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0758451 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1694  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  49.87 
 
 
389 aa  344  1e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.799107  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4835  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  47.13 
 
 
386 aa  330  3e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.643117  hitchhiker  0.00914775 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0523  chemotaxis-specific methylesterase  46.89 
 
 
387 aa  326  6e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4032  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  46.32 
 
 
405 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.688715 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0661  chemotaxis-specific methylesterase  41.97 
 
 
401 aa  272  9e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.748152 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0321  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  44.17 
 
 
419 aa  268  8e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.280129  normal  0.293184 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4227  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  40.11 
 
 
352 aa  262  6e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1528  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  42.2 
 
 
355 aa  256  7e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.308389 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5003  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  41.01 
 
 
371 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3599  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.89 
 
 
366 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.955127  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1911  Protein-glutamate methylesterase  38.68 
 
 
385 aa  243  6e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0366186  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0109  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.89 
 
 
348 aa  242  1e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00057  chemotaxis-specific methylesterase  39.31 
 
 
358 aa  239  8e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00411063  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1789  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  42.5 
 
 
379 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.352368  normal  0.727472 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1843  chemotaxis-specific methylesterase  38.89 
 
 
357 aa  233  6e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.426173 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0870  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.33 
 
 
360 aa  231  1e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2002  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.75 
 
 
385 aa  231  1e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0412053  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0162  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.84 
 
 
340 aa  230  3e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30910  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  40.16 
 
 
370 aa  229  6e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0772  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.68 
 
 
353 aa  229  8e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.446886  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4374  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.25 
 
 
366 aa  227  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.272422  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3220  chemotaxis-specific methylesterase  37.67 
 
 
363 aa  225  1e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.184496 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0702  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.99 
 
 
384 aa  224  3e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.327183 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2702  chemotaxis response regulator  40.32 
 
 
362 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1615  chemotaxis-specific methylesterase  37.14 
 
 
356 aa  223  6e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0606419 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2165  chemotaxis-specific methylesterase  38.38 
 
 
362 aa  222  9e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0526  chemotaxis-specific methylesterase  37.5 
 
 
344 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0512  chemotaxis-specific methylesterase  37.5 
 
 
344 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.252031  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1075  chemotaxis-specific methylesterase  37.23 
 
 
363 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00340521 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2321  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.92 
 
 
394 aa  221  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27980  chemotaxis response regulator; CheB  38.81 
 
 
353 aa  219  6e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.151486  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1770  chemotaxis-specific methylesterase  35.98 
 
 
344 aa  219  7e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.221833  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2020  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  39.19 
 
 
354 aa  219  7.999999999999999e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0988  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  34.65 
 
 
384 aa  219  8.999999999999998e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2454  chemotaxis-specific methylesterase  37.77 
 
 
349 aa  218  1e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.699312  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4166  chemotaxis-specific methylesterase  39.52 
 
 
375 aa  218  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.904429  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1041  chemotaxis-specific methylesterase  36.24 
 
 
363 aa  218  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4054  chemotaxis-specific methylesterase  39.52 
 
 
375 aa  218  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3363  chemotaxis-specific methylesterase  39.42 
 
 
363 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0170519  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3206  chemotaxis-specific methylesterase  37.47 
 
 
374 aa  216  4e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0659  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.57 
 
 
377 aa  216  4e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.792305  normal  0.0269811 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0187  chemotaxis-specific methylesterase  38.32 
 
 
363 aa  216  4e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0174  chemotaxis-specific methylesterase  38.32 
 
 
360 aa  216  4e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.51198  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3499  protein-glutamate methylesterase  38.24 
 
 
339 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2213  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.27 
 
 
351 aa  215  9e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0182  protein-glutamate methylesterase  35.68 
 
 
345 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0046  chemotaxis-specific methylesterase  35.47 
 
 
345 aa  214  1.9999999999999998e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000324346  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0571  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.65 
 
 
373 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.691339  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1370  chemotaxis-specific methylesterase  36.81 
 
 
374 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0836133 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2621  chemotaxis-specific methylesterase  37.5 
 
 
349 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000506638 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0293  protein-glutamate methylesterase  37.86 
 
 
362 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.279829  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0758  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  33.33 
 
 
376 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1544  chemotaxis-specific methylesterase  37.5 
 
 
350 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.381226  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3060  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.44 
 
 
370 aa  213  4.9999999999999996e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.652621  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1757  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.96 
 
 
349 aa  213  5.999999999999999e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.416964  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1859  chemotaxis-specific methylesterase  36.41 
 
 
350 aa  213  5.999999999999999e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1301  chemotaxis-specific methylesterase  37.23 
 
 
349 aa  213  5.999999999999999e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00345426 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01854  chemotaxis-specific methylesterase  37.23 
 
 
349 aa  212  9e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1749  chemotaxis-specific methylesterase  37.23 
 
 
349 aa  212  9e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01843  hypothetical protein  37.23 
 
 
349 aa  212  9e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.80551  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1979  chemotaxis-specific methylesterase  37.23 
 
 
349 aa  212  9e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1645  chemotaxis-specific methylesterase  36.96 
 
 
349 aa  211  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1757  chemotaxis-specific methylesterase  36.96 
 
 
349 aa  211  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.982649  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3519  chemotaxis-specific methylesterase  36.96 
 
 
349 aa  211  1e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.480358 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0068  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  34.57 
 
 
368 aa  211  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1886  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.27 
 
 
351 aa  212  1e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.187524 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1458  chemotaxis-specific methylesterase  37.47 
 
 
375 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1363  chemotaxis-specific methylesterase  36.27 
 
 
374 aa  211  1e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0222536 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2172  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.3 
 
 
368 aa  212  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294286  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2116  chemotaxis-specific methylesterase  36.96 
 
 
349 aa  211  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.823717  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2607  chemotaxis-specific methylesterase  36.41 
 
 
350 aa  211  2e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.701564  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1516  chemotaxis-specific methylesterase  36.68 
 
 
350 aa  211  2e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2088  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.27 
 
 
351 aa  211  2e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3786  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.9 
 
 
370 aa  211  2e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1523  chemotaxis-specific methylesterase  36.77 
 
 
379 aa  210  3e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4423  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.36 
 
 
357 aa  210  3e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1403  chemotaxis-specific methylesterase  38.38 
 
 
381 aa  210  4e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.551695  normal  0.0191361 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2915  chemotaxis-specific methylesterase  37.1 
 
 
375 aa  210  4e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.72739  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2555  chemotaxis-specific methylesterase  36.63 
 
 
372 aa  210  4e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.766083  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3047  chemotaxis-specific methylesterase  37.47 
 
 
375 aa  210  4e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.375886 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2980  chemotaxis-specific methylesterase  36.94 
 
 
349 aa  210  4e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1417  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  34.66 
 
 
365 aa  209  7e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.433973 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2176  chemotaxis-specific methylesterase  36.96 
 
 
349 aa  209  7e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3177  chemotaxis-specific methylesterase  36.94 
 
 
364 aa  209  8e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2160  chemotaxis-specific methylesterase  36.68 
 
 
349 aa  209  8e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2072  chemotaxis-specific methylesterase  36.19 
 
 
349 aa  209  9e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.959311  hitchhiker  0.000931228 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2077  chemotaxis-specific methylesterase  36.41 
 
 
349 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000138075 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2132  chemotaxis-specific methylesterase  36.41 
 
 
349 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000304139 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1205  chemotaxis-specific methylesterase  36.41 
 
 
349 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1303  chemotaxis-specific methylesterase  36.55 
 
 
372 aa  207  2e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>