106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6263 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3413  ATPase  82.11 
 
 		 516 aa  844    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.747505 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4482  ATPase  85.14 
 
 		 502 aa  804    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.197027 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2035  ATPase  84.74 
 
 		 506 aa  849    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.322219 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1579  ATPase-like protein  78.02 
 
 		 498 aa  742    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0994986  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6263  hypothetical protein  100 
 
 		 504 aa  1000    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.311693 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2167  AAA ATPase  86.49 
 
 		 507 aa  857    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.283139  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0592  hypothetical protein  62.65 
 
 		 498 aa  578  1e-164  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000492944 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2283  AAA ATPase  63.15 
 
 		 511 aa  576  1.0000000000000001e-163  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.635866 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7061  AAA ATPase  63.4 
 
 		 500 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0332905  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2732  hypothetical protein  61.51 
 
 		 510 aa  564  1.0000000000000001e-159  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.393853  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1483  hypothetical protein  60.08 
 
 		 511 aa  563  1.0000000000000001e-159  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16085  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1534  hypothetical protein  60.08 
 
 		 513 aa  561  1e-158  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.74675  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1632  hypothetical protein  62.89 
 
 		 514 aa  558  1e-157  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1920  hypothetical protein  59.05 
 
 		 526 aa  554  1e-156  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1515  AAA ATPase  59.6 
 
 		 504 aa  547  1e-154  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1948  AAA ATPase  59.16 
 
 		 503 aa  547  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.315114  normal  0.618024 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2157  AAA ATPase  59.8 
 
 		 504 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.969754  normal  0.641302 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6246  AAA ATPase  62.72 
 
 		 520 aa  533  1e-150  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0844208 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5552  hypothetical protein  60.16 
 
 		 498 aa  530  1e-149  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.508667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3638  hypothetical protein  60.28 
 
 		 500 aa  528  1e-148  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.689622  normal  0.0322237 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3442  hypothetical protein  60.08 
 
 		 499 aa  523  1e-147  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.41425  normal  0.022696 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3751  hypothetical protein  60.08 
 
 		 499 aa  523  1e-147  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0972722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3657  ATPase-like protein  57.69 
 
 		 490 aa  517  1.0000000000000001e-145  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.16812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0461  ATPase  55.38 
 
 		 492 aa  482  1e-135  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1720  ATPase  53.86 
 
 		 504 aa  472  1e-132  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0252  ATPase-like protein  29.07 
 
 		 537 aa  97.1  7e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3041  protein of unknown function DUF87  28.46 
 
 		 744 aa  66.2  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1865  hypothetical protein  27.54 
 
 		 655 aa  62.8  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0131162 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5115  hypothetical protein  28.63 
 
 		 595 aa  60.1  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0355  ATPase-like protein  23.72 
 
 		 250 aa  58.9  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2778  hypothetical protein  26.36 
 
 		 580 aa  57  0.0000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145513  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1112  hypothetical protein  27.71 
 
 		 524 aa  52  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1610  hypothetical protein  26.28 
 
 		 628 aa  51.2  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.891235 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2369  hypothetical protein  24.69 
 
 		 659 aa  51.2  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.70292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5533  hypothetical protein  28.35 
 
 		 608 aa  51.2  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.423742  normal  0.336707 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5935  hypothetical protein  28.35 
 
 		 608 aa  51.2  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0918921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0395  hypothetical protein  24.7 
 
 		 523 aa  50.4  0.00008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.190309  normal  0.0716823 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  28.22 
 
 		 508 aa  50.1  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0300  hypothetical protein  26.83 
 
 		 611 aa  49.7  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5114  AAA ATPase  30.57 
 
 		 1076 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078899 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4444  cell divisionFtsK/SpoIIIE  28.09 
 
 		 908 aa  49.7  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.434451  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4578  cell divisionFtsK/SpoIIIE  28.09 
 
 		 908 aa  49.7  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.211608  normal  0.637963 
 
 
-
 
NC_003296  RS01655  hypothetical protein  27.47 
 
 		 959 aa  48.9  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.273957  normal  0.0637892 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1924  cell division protein FtsK, putative  28.51 
 
 		 1725 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1032  putative cell division protein FtsK  28.51 
 
 		 1725 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0718321  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0835  putative cell division protein FtsK  28.51 
 
 		 1725 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.816405  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0315  putative cell division protein FtsK  28.51 
 
 		 1725 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.10146  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1445  DNA translocase FtsK  28.09 
 
 		 1107 aa  48.5  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.64751  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1344  hypothetical protein  28.51 
 
 		 1851 aa  48.5  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1596  DNA translocase FtsK  27.66 
 
 		 1123 aa  48.5  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.262939  normal  0.732523 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1185  DNA translocase FtsK  28.51 
 
 		 1834 aa  48.5  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1193  DNA translocase FtsK  28.51 
 
 		 1851 aa  48.5  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0443  protein of unknown function DUF87  28.93 
 
 		 360 aa  48.5  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0177789  normal  0.220913 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0976  cell division protein FtsK  28.09 
 
 		 1784 aa  48.1  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2164  hypothetical protein  30.84 
 
 		 582 aa  47.8  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000710411 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3486  ATPase-like protein  27.49 
 
 		 574 aa  47.8  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.123894  normal  0.207133 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5744  hypothetical protein  33.33 
 
 		 590 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575418 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1764  cell divisionFtsK/SpoIIIE  26.83 
 
 		 763 aa  47.8  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.947558  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0358  hypothetical protein  24.76 
 
 		 605 aa  47.4  0.0006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3925  protein of unknown function DUF87  29.63 
 
 		 581 aa  47.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1772  cell division protein FtsK, putative  26.69 
 
 		 928 aa  47.4  0.0007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00023204  hitchhiker  0.00368766 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2759  cell division protein FtsK  27.2 
 
 		 879 aa  46.2  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5663  DNA translocase FtsK  27.94 
 
 		 1673 aa  46.2  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.793927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5073  ATPase-like  27.22 
 
 		 567 aa  46.6  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1709  cell divisionFtsK/SpoIIIE  27.94 
 
 		 1527 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1795  cell divisionFtsK/SpoIIIE  30.71 
 
 		 884 aa  46.6  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00936905  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2321  cell divisionFtsK/SpoIIIE  27.94 
 
 		 1527 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.800211  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1385  protein of unknown function DUF87  26.88 
 
 		 496 aa  46.2  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.177775  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0956  cell divisionFtsK/SpoIIIE  27.66 
 
 		 1707 aa  46.6  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.810802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2344  cell divisionFtsK/SpoIIIE  27.94 
 
 		 1527 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0427458 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2089  cell division FtsK/SpoIIIE  27.54 
 
 		 1369 aa  46.6  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.123454 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0482  protein of unknown function DUF87  26.28 
 
 		 577 aa  46.2  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1870  protein of unknown function DUF87  32.23 
 
 		 559 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.853161  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2260  cell divisionFtsK/SpoIIIE  25.4 
 
 		 1174 aa  46.6  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.535537  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2306  cell division protein FtsK, putative  26.51 
 
 		 911 aa  45.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1743  cell divisionFtsK/SpoIIIE  25.9 
 
 		 932 aa  45.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000155833  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3208  hypothetical protein  37.5 
 
 		 579 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.454829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0983  hypothetical protein  26.06 
 
 		 616 aa  45.8  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.495624  hitchhiker  0.0000164054 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1821  hypothetical protein  26.06 
 
 		 608 aa  45.8  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1987  cell divisionFtsK/SpoIIIE  25.79 
 
 		 1145 aa  45.8  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.252325  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2360  cell divisionFtsK/SpoIIIE  25 
 
 		 1202 aa  45.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.647961  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1719  cell divisionFtsK/SpoIIIE  25.4 
 
 		 1157 aa  45.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1450  protein of unknown function DUF87  28.3 
 
 		 581 aa  45.1  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0452751  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2360  cell divisionFtsK/SpoIIIE  27.23 
 
 		 1640 aa  45.1  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2156  cell divisionFtsK/SpoIIIE  26.91 
 
 		 917 aa  45.1  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000852872  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2240  cell divisionFtsK/SpoIIIE  27.23 
 
 		 1610 aa  45.1  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.751818 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1100  HAD family hydrolase  29.73 
 
 		 554 aa  44.7  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.261757  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1117  HAD family hydrolase  29.73 
 
 		 554 aa  44.7  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.293003  normal  0.951396 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2323  cell divisionFtsK/SpoIIIE  26.91 
 
 		 917 aa  44.7  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000157277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2465  protein of unknown function DUF87  29.5 
 
 		 600 aa  44.7  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2191  cell divisionFtsK/SpoIIIE  26.91 
 
 		 917 aa  44.7  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000178712  normal  0.118465 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2011  cell divisionFtsK/SpoIIIE  26.91 
 
 		 896 aa  44.3  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000146975  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2215  cell divisionFtsK/SpoIIIE  26.91 
 
 		 917 aa  44.3  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000327747  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2596  DNA translocase FtsK  26.59 
 
 		 1310 aa  44.3  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  0.0000000000551266  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1613  DNA translocase FtsK  26.59 
 
 		 1299 aa  44.3  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00457522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2013  DNA translocase FtsK  26.51 
 
 		 913 aa  43.9  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00817822  normal  0.0372318 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1423  HAD family hydrolase  33.85 
 
 		 550 aa  44.3  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2685  cell divisionFtsK/SpoIIIE  26.59 
 
 		 1310 aa  44.3  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00501186  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1002  DNA translocase FtsK  24.79 
 
 		 757 aa  43.9  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0837246  normal  0.0587694 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1963  DNA translocase FtsK  26.51 
 
 		 914 aa  43.9  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000218677  normal  0.918259 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>