33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5816 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5816  cytochrome c-552 precursor  100 
 
 		 103 aa  209  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.591248  normal  0.174311 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1945  hypothetical protein  53.54 
 
 		 111 aa  107  6e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.585194  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3207  putative cytochrome C precursor  48 
 
 		 104 aa  103  7e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.681994 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2428  cytochrome c class I  51.14 
 
 		 104 aa  97.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.49473  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2197  cytochrome c, class I  43.69 
 
 		 104 aa  93.6  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3268  cytochrome C precursor  52.38 
 
 		 104 aa  93.6  9e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3165  cytochrome c class I  40.62 
 
 		 115 aa  77  0.00000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1637  cytochrome c class I  42.17 
 
 		 111 aa  67  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.416025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0679  putative cytochrome c  46.25 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.440902 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1579  hypothetical protein  37.5 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.275291 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4698  putative cytochrome c552 precursor  32.41 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0768  putative cytochrome c552 precursor  32.67 
 
 		 115 aa  52.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0348  putative cytochrome c precursor  32.89 
 
 		 123 aa  51.6  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.198393 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1273  cytochrome c class I  33 
 
 		 115 aa  51.6  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0849  putative cytochrome c precursor (cytochrome c552)(CycB)  35.53 
 
 		 114 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2879  cytochrome c class I  32.46 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4640  putative cytochrome c552 precursor  32.67 
 
 		 115 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2628  putative cytochrome c552 precursor  29.47 
 
 		 124 aa  47  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.82926 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0428  cytochrome c class I  27.55 
 
 		 111 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1301  cytochrome c class I  30.56 
 
 		 121 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.00128002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1556  cytochrome c class I  30.86 
 
 		 108 aa  42.7  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0799874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2618  cytochrome c class I  31.18 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.235794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6928  cytochrome c class I  28.57 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.405337 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1356  cytochrome c class I  30.86 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.361491 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3893  cytochrome c class I  28.71 
 
 		 165 aa  42.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.894591  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1995  cytochrome c class I  34.41 
 
 		 293 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0213556  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0396  cytochrome c class I  33.73 
 
 		 108 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6158  cytochrome c class I  29.63 
 
 		 112 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1925  hypothetical protein  27.78 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.671288  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2568  cytochrome c class I  33.73 
 
 		 108 aa  40.8  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0421494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0438  putative cytochrome c552 precursor  28.89 
 
 		 124 aa  40.8  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1491  cytochrome c, class I  33 
 
 		 109 aa  40.4  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4714  conserved hypothetical protein; putative cytochrome c  27.55 
 
 		 105 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.361108  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>