37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4332 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4332  hypothetical protein  100 
 
 		 285 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.318075  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1036  hypothetical protein  65.85 
 
 		 285 aa  378  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1147  hypothetical protein  65.72 
 
 		 285 aa  358  5e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0434891 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3322  hypothetical protein  41.99 
 
 		 286 aa  194  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.470211  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2750  hypothetical protein  45.3 
 
 		 282 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0283  hypothetical protein  40.61 
 
 		 302 aa  143  4e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2890  hypothetical protein  39.52 
 
 		 281 aa  142  6e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.105579 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2976  hypothetical protein  33.78 
 
 		 286 aa  105  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.514057  normal  0.101883 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2355  hypothetical protein  35.96 
 
 		 300 aa  96.3  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.555476  normal  0.544076 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1805  hypothetical protein  36.84 
 
 		 262 aa  95.5  9e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0989937  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1825  hypothetical protein  33.51 
 
 		 278 aa  95.1  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3085  hypothetical protein  33.51 
 
 		 287 aa  92.4  8e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.422699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5820  hypothetical protein  35.63 
 
 		 270 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.330441  normal  0.0260789 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2476  hypothetical protein  32.53 
 
 		 291 aa  87  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.372575 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4201  hypothetical protein  28.47 
 
 		 290 aa  79  0.00000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.602002 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0511  hypothetical protein  30.05 
 
 		 297 aa  75.9  0.0000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.252109 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1792  hypothetical protein  27.15 
 
 		 298 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0409814  hitchhiker  0.00116581 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2785  hypothetical protein  30.59 
 
 		 289 aa  69.3  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0719299  normal  0.726284 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3224  hypothetical protein  30.5 
 
 		 297 aa  67  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.643218  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2821  hypothetical protein  31.69 
 
 		 289 aa  65.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.612498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2106  hypothetical protein  28.7 
 
 		 283 aa  64.3  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0523  hypothetical protein  30.35 
 
 		 244 aa  62  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0104  methylmalonyl-CoA epimerase  35.92 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0218  hypothetical protein  29.23 
 
 		 240 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1070  hypothetical protein  26.71 
 
 		 296 aa  54.3  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.12114  normal  0.566405 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1018  hypothetical protein  27.61 
 
 		 263 aa  53.1  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1599  hypothetical protein  25.77 
 
 		 298 aa  52.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.647468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1361  methylmalonyl-CoA epimerase  30.39 
 
 		 129 aa  48.5  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.7651e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4087  hypothetical protein  25.61 
 
 		 338 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2920  hypothetical protein  25.97 
 
 		 260 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496773  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2381  hypothetical protein  31.39 
 
 		 266 aa  47.4  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2364  methylmalonyl-CoA epimerase  34.38 
 
 		 135 aa  45.8  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0773  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.78 
 
 		 289 aa  44.3  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1167  methylmalonyl-CoA epimerase  32.69 
 
 		 135 aa  43.5  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.217696  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5823  methylmalonyl-CoA epimerase  25.96 
 
 		 135 aa  43.1  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.609352 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1341  methylmalonyl-CoA epimerase  23.58 
 
 		 136 aa  42.4  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.886384  normal  0.16528 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1151  hypothetical protein  25.11 
 
 		 257 aa  42.4  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>