More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3576 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_3576  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
256 aa  507  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.397005  normal  0.706787 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3943  enoyl-CoA hydratase  70.31 
 
 
256 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3304  enoyl-CoA hydratase  67.97 
 
 
256 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2115  enoyl-CoA hydratase  69.14 
 
 
281 aa  361  6e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.322248 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5245  enoyl-CoA hydratase  58.33 
 
 
258 aa  288  5.0000000000000004e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5107  enoyl-CoA hydratase  54.94 
 
 
258 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014973  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4225  enoyl-CoA hydratase  52.48 
 
 
267 aa  259  4e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.123849  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4618  enoyl-CoA hydratase  49.2 
 
 
264 aa  243  3e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.246511  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1660  enoyl-CoA hydratase  51.24 
 
 
254 aa  240  2e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0508475  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0802  enoyl-CoA hydratase  50 
 
 
262 aa  220  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0224  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.13 
 
 
258 aa  142  4e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00100177  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.75 
 
 
261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.02 
 
 
260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  33.47 
 
 
260 aa  137  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.67 
 
 
260 aa  135  7.000000000000001e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  30.52 
 
 
258 aa  132  6.999999999999999e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  29.46 
 
 
262 aa  131  9e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.37 
 
 
259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  31.88 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.92 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1936  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  33.2 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.64 
 
 
260 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.13 
 
 
260 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.13 
 
 
260 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.95 
 
 
260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.82 
 
 
268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  32.5 
 
 
260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.29 
 
 
265 aa  126  3e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
259 aa  126  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  35.55 
 
 
258 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  36.03 
 
 
256 aa  125  5e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.209168 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2029  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.83 
 
 
269 aa  125  6e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  34.26 
 
 
258 aa  124  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.3 
 
 
269 aa  124  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 
260 aa  123  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.29 
 
 
267 aa  124  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2792  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.23 
 
 
259 aa  123  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.552079 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1713  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.66 
 
 
252 aa  122  5e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1271  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.56 
 
 
262 aa  122  5e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0748368  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1595  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.85 
 
 
265 aa  122  5e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0960  enoyl-CoA hydratase  30.08 
 
 
261 aa  122  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0584352  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0914  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.02 
 
 
269 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1046  enoyl-CoA hydratase  30.08 
 
 
261 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2191  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.12 
 
 
260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.572895  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4505  enoyl-CoA hydratase  32.52 
 
 
278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.289171  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  31.95 
 
 
260 aa  120  3e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2283  enoyl-CoA hydratase  29.69 
 
 
261 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.12 
 
 
260 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  29.8 
 
 
260 aa  120  3e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4849  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.4 
 
 
257 aa  119  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1717  enoyl-CoA hydratase  30.74 
 
 
264 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.45767  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1666  short chain enoyl-CoA hydratase  35.12 
 
 
260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  28.93 
 
 
260 aa  118  7e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.05 
 
 
259 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.29 
 
 
261 aa  117  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.37 
 
 
260 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28460  short chain enoyl-CoA hydratase  38.46 
 
 
259 aa  117  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.528871  normal  0.841191 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3750  short chain enoyl-CoA hydratase  32.5 
 
 
257 aa  117  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1484  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  29.46 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.17 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1462  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.4 
 
 
259 aa  116  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2301  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.26 
 
 
272 aa  116  3e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1966  enoyl-CoA hydratase  31.33 
 
 
264 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.489089  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.54 
 
 
260 aa  116  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4259  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.75 
 
 
269 aa  117  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03685  Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  31.02 
 
 
260 aa  116  3e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.675482  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1099  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.79 
 
 
257 aa  115  6e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0490806  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00240  enoyl-CoA hydratase, putative  32.93 
 
 
283 aa  115  6e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0589051  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2812  enoyl-CoA hydratase  31.85 
 
 
272 aa  115  6.9999999999999995e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.213847 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1716  short chain enoyl-CoA hydratase  33.06 
 
 
260 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.923335  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.47 
 
 
261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.95 
 
 
267 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.05 
 
 
261 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0224  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.48 
 
 
254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.287006  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  30.71 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3489  enoyl-CoA hydratase  30.92 
 
 
264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168411  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  29.54 
 
 
259 aa  113  3e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1206  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.58 
 
 
257 aa  113  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3446  enoyl-CoA hydratase  30.52 
 
 
264 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1377  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  29.25 
 
 
260 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0932  hypothetical protein  29.92 
 
 
258 aa  113  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2165  enoyl-CoA hydratase  32.28 
 
 
280 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4077  enoyl-CoA hydratase  30.33 
 
 
290 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0558  enoyl-CoA hydratase  31.4 
 
 
262 aa  112  5e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  29.75 
 
 
260 aa  112  5e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4289  enoyl-CoA hydratase  30.33 
 
 
290 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0901  hypothetical protein  29.92 
 
 
258 aa  112  6e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0017  enoyl-CoA hydratase  27.91 
 
 
261 aa  112  7.000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3974  enoyl-CoA hydratase  30.4 
 
 
264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563062  normal  0.377725 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.82 
 
 
260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2717  enoyl-CoA hydratase  27.13 
 
 
265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1196  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.81 
 
 
261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1316  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.07 
 
 
260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.200035  normal  0.304816 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2165  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.98 
 
 
258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192446  normal  0.593108 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0597  short chain enoyl-CoA hydratase  36.51 
 
 
262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00392493  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1122  short chain enoyl-CoA hydratase  34 
 
 
262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3884  enoyl-CoA hydratase  28.28 
 
 
272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192414  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2902  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  31.58 
 
 
650 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  27.8 
 
 
262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3997  enoyl-CoA hydratase  28.28 
 
 
272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>