121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2979 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2979  hypothetical protein  100 
 
 		 314 aa  642    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.619955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2672  metallophosphoesterase  82.86 
 
 		 313 aa  525  1e-148  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0337269  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0392  metallophosphoesterase  68.15 
 
 		 313 aa  443  1e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.775359 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0341  metallophosphoesterase  69.11 
 
 		 335 aa  440  9.999999999999999e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0479119 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0783  metallophosphoesterase  70.68 
 
 		 320 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4791  metallophosphoesterase  69.81 
 
 		 319 aa  435  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.444638  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0974  metallophosphoesterase  70.55 
 
 		 318 aa  404  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4689  metallophosphoesterase  57.89 
 
 		 319 aa  369  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.596745  normal  0.125787 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5326  metallophosphoesterase  54.19 
 
 		 314 aa  343  2e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1271  hypothetical protein  53.48 
 
 		 314 aa  340  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.657925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0969  metallophosphoesterase  54.1 
 
 		 314 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.636109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4607  metallophosphoesterase  52.46 
 
 		 314 aa  332  5e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.913305 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4141  metallophosphoesterase  52.13 
 
 		 314 aa  329  4e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.506676 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3608  metallophosphoesterase  54.14 
 
 		 314 aa  328  6e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.18641  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4759  metallophosphoesterase  54.14 
 
 		 314 aa  328  6e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.218607 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5524  metallophosphoesterase  53.79 
 
 		 314 aa  326  3e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.809123 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3898  metallophosphoesterase  52.01 
 
 		 312 aa  320  3e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.5708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2524  metallophosphoesterase  45.86 
 
 		 314 aa  285  9e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135144  normal  0.43864 
 
 
-
 
NC_003296  RS02211  hypothetical protein  39.42 
 
 		 309 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.372489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2176  Ser/Thr protein phosphatase family protein  36.82 
 
 		 306 aa  170  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3409  Ser/Thr protein phosphatase family protein  36.5 
 
 		 299 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.520768  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1171  Ser/Thr protein phosphatase family protein  36.5 
 
 		 299 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.0049646  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1407  Ser/Thr protein phosphatase family protein  36.5 
 
 		 306 aa  170  4e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0774357  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2421  Ser/Thr protein phosphatase family protein family  36.5 
 
 		 306 aa  170  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1898  Ser/Thr protein phosphatase family protein  36.5 
 
 		 306 aa  170  4e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2256  Ser/Thr protein phosphatase family protein  36.5 
 
 		 306 aa  170  4e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0412874  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2295  Ser/Thr protein phosphatase family protein  36.5 
 
 		 306 aa  170  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0598  twin-arginine translocation pathway signal  38.04 
 
 		 296 aa  167  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.676514 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4252  twin-arginine translocation pathway signal  35.07 
 
 		 295 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.726059  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1617  Ser/Thr protein phosphatase family protein  34.55 
 
 		 229 aa  125  9e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.392588 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4329  metallophosphoesterase  30.47 
 
 		 374 aa  123  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2854  metallophosphoesterase  28.14 
 
 		 382 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.806939  decreased coverage  0.00466142 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1878  metallophosphoesterase  25.65 
 
 		 313 aa  69.3  0.00000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0173468 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3458  metallophosphoesterase  27.48 
 
 		 285 aa  66.6  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1664  metallophosphoesterase  29.51 
 
 		 252 aa  66.2  0.0000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.334361  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1261  metallophosphoesterase  26.32 
 
 		 286 aa  62.8  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3398  metallophosphoesterase  28.32 
 
 		 304 aa  61.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.11944 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0615  metallophosphoesterase  28.69 
 
 		 680 aa  58.5  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1299  metallophosphoesterase  25.77 
 
 		 606 aa  57.4  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3120  metallophosphoesterase  25.48 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4674  metallophosphoesterase  26.07 
 
 		 303 aa  57  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.801154  hitchhiker  0.0000113913 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6434  metallophosphoesterase  25 
 
 		 266 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6658  metallophosphoesterase  26.63 
 
 		 616 aa  55.8  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.492609 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1109  metallophosphoesterase  28.42 
 
 		 343 aa  55.1  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3861  metallophosphoesterase  23.87 
 
 		 266 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5563  metallophosphoesterase  24.47 
 
 		 239 aa  52.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.387807  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5928  metallophosphoesterase  24.47 
 
 		 239 aa  52.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0771  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  23.94 
 
 		 279 aa  51.2  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0672533  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1764  metallophosphoesterase  31.39 
 
 		 529 aa  51.6  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.305861  normal  0.143439 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1721  putative DNA repair exonuclease  27.14 
 
 		 265 aa  50.8  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0737624 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1184  purple acid phosphatase family protein  26.64 
 
 		 281 aa  50.4  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0863816  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0574  metallophosphoesterase  25 
 
 		 470 aa  50.4  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1087  purple acid phosphatase family protein  26.64 
 
 		 281 aa  50.4  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5794  Exopolysaccharide biosynthesis protein related to N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein  24.56 
 
 		 1138 aa  50.4  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0776912 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3575  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  22.33 
 
 		 279 aa  50.1  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.245778  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0784  calcineurin phosphoesterase domain-containing protein  22.33 
 
 		 279 aa  50.1  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.611583  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0816  calcineurin phosphoesterase domain-containing protein  22.33 
 
 		 279 aa  50.1  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.103731  normal  0.395861 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0809  Calcineurin phosphoesterase domain protein  22.33 
 
 		 279 aa  50.1  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0169271  unclonable  0.00000000000233524 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2578  metallophosphoesterase  22.17 
 
 		 266 aa  49.3  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.450507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0756  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  22.58 
 
 		 279 aa  49.3  0.00009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.585298  hitchhiker  0.00582637 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2545  metallophosphoesterase  22.43 
 
 		 265 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4691  metallophosphoesterase  24.5 
 
 		 277 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0728  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  22.58 
 
 		 279 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.799636  hitchhiker  0.000852283 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3235  metallophosphoesterase  23.93 
 
 		 499 aa  48.5  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1325  metallophosphoesterase  25.71 
 
 		 270 aa  48.9  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1593  metallophosphoesterase  23.53 
 
 		 611 aa  48.9  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.245606 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3901  lacZ expression regulator  22.89 
 
 		 278 aa  47.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4844  putative metallophosphoesterase  22.98 
 
 		 290 aa  47.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.667418  normal  0.111711 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3233  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  22.12 
 
 		 279 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.848486  hitchhiker  0.00000281394 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0777  calcineurin phosphoesterase C-terminal domain-containing protein  23.29 
 
 		 279 aa  48.1  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00052744  hitchhiker  0.00000000244618 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3560  calcineurin phosphoesterase domain-containing protein  23.41 
 
 		 279 aa  48.1  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00638886  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0264  metallophosphoesterase  25.12 
 
 		 306 aa  47.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.019445 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0490  Ser/Thr protein phosphatase family protein  23.5 
 
 		 277 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_2983  predicted protein  29.7 
 
 		 312 aa  47.4  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.268797 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5275  hypothetical protein  25.9 
 
 		 496 aa  47  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0193632  normal  0.106396 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0570  Icc protein  24.2 
 
 		 266 aa  47  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1670  metallophosphoesterase  25.84 
 
 		 281 aa  46.6  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1269  metallophosphoesterase  24.24 
 
 		 275 aa  46.2  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0548527  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4297  metallophosphoesterase  22.83 
 
 		 270 aa  46.2  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0587  metallophosphoesterase  24.78 
 
 		 289 aa  45.8  0.0009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.994992  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0534  putative ICC protein  24.2 
 
 		 279 aa  45.8  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05030  predicted phosphohydrolase  25 
 
 		 726 aa  45.8  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2835  Ser/Thr protein phosphatase family protein  23.88 
 
 		 274 aa  45.8  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0298  metallophosphoesterase  24.89 
 
 		 287 aa  45.8  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0372  icc protein  25.42 
 
 		 271 aa  45.4  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0447  alkaline phosphatase  26.29 
 
 		 299 aa  45.4  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.690696  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0980  purple acid phosphatase/fibronectin domain protein  24.27 
 
 		 819 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45503  predicted protein  26.42 
 
 		 439 aa  44.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.436254  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0869  purple acid phosphatase/fibronectin domain protein  23.87 
 
 		 819 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0843  metallophosphoesterase  23.7 
 
 		 274 aa  45.1  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3342  hypothetical protein  30.43 
 
 		 574 aa  45.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1455  metallophosphoesterase  23.94 
 
 		 284 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0445506 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1539  Ser/Thr protein phosphatase family protein  22.59 
 
 		 325 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1505  metallophosphoesterase  23.91 
 
 		 275 aa  44.3  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.847027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4744  metallophosphoesterase  30.21 
 
 		 299 aa  43.9  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.158443 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3045  lacZ expression regulator  23.18 
 
 		 279 aa  43.5  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.396256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4167  Ig domain protein group 2 domain protein  25.53 
 
 		 1164 aa  43.5  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.608426  normal  0.0215824 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0436  putative calcineurin phosphoesterase  30.1 
 
 		 519 aa  43.9  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4273  metallophosphoesterase  28.45 
 
 		 680 aa  43.5  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.117744  normal  0.453222 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43500  cyclic 3,5-nucleotide monophosphate metallophosphodiesterase  26.75 
 
 		 269 aa  43.5  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.580073  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>