24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3235 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_3235  metallophosphoesterase  100 
 
 
499 aa  1021    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4124  metallophosphoesterase  39.47 
 
 
554 aa  313  5.999999999999999e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2843  metallophosphoesterase  37.64 
 
 
527 aa  283  4.0000000000000003e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00214985  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1384  metallophosphoesterase  31.89 
 
 
546 aa  182  1e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1468  metallophosphoesterase  32.13 
 
 
804 aa  176  6e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1179  geranylgeranylglyceryl phosphate synthase family protein  28.54 
 
 
506 aa  150  4e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.6021  normal  0.228569 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2027  metallophosphoesterase  27.76 
 
 
595 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2486  metallophosphoesterase  26.4 
 
 
586 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.907019  normal  0.296957 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2905  metallophosphoesterase  28.97 
 
 
593 aa  139  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0905  twin-arginine translocation pathway signal  29.01 
 
 
662 aa  123  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.486466  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0794  twin-arginine translocation pathway signal  26.57 
 
 
659 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.410839 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2026  metallophosphoesterase  25.83 
 
 
719 aa  107  7e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5249  metallophosphoesterase  33.68 
 
 
659 aa  87.8  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3120  metallophosphoesterase  30.48 
 
 
286 aa  52  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3458  metallophosphoesterase  30.09 
 
 
285 aa  50.8  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4791  metallophosphoesterase  30.09 
 
 
319 aa  50.8  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.444638  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2979  hypothetical protein  23.93 
 
 
314 aa  48.5  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.619955  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2672  metallophosphoesterase  23.11 
 
 
313 aa  46.2  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0337269  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1261  metallophosphoesterase  28.57 
 
 
286 aa  46.2  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4158  metallophosphoesterase  23.18 
 
 
364 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0783  metallophosphoesterase  26.55 
 
 
320 aa  45.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0574  metallophosphoesterase  27.13 
 
 
470 aa  44.7  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4689  metallophosphoesterase  26.45 
 
 
319 aa  43.9  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.596745  normal  0.125787 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0847  metallophosphoesterase  28.46 
 
 
281 aa  43.5  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.802404 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>