24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4124 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_4124  metallophosphoesterase  100 
 
 
554 aa  1129    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3235  metallophosphoesterase  39.47 
 
 
499 aa  303  6.000000000000001e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2843  metallophosphoesterase  32.72 
 
 
527 aa  227  5.0000000000000005e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00214985  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1468  metallophosphoesterase  29.78 
 
 
804 aa  145  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1179  geranylgeranylglyceryl phosphate synthase family protein  26.53 
 
 
506 aa  128  3e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.6021  normal  0.228569 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2027  metallophosphoesterase  27.57 
 
 
595 aa  128  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1384  metallophosphoesterase  27.08 
 
 
546 aa  120  9e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2486  metallophosphoesterase  27.37 
 
 
586 aa  118  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.907019  normal  0.296957 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0794  twin-arginine translocation pathway signal  26.99 
 
 
659 aa  117  6e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.410839 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0905  twin-arginine translocation pathway signal  26.82 
 
 
662 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.486466  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5249  metallophosphoesterase  25.48 
 
 
659 aa  114  5e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2026  metallophosphoesterase  24.9 
 
 
719 aa  105  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2905  metallophosphoesterase  24.74 
 
 
593 aa  95.9  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4158  metallophosphoesterase  27.22 
 
 
364 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1048  metallophosphoesterase  29.22 
 
 
357 aa  51.2  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00210125 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1562  metallophosphoesterase  28.57 
 
 
369 aa  51.2  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3458  metallophosphoesterase  30.25 
 
 
285 aa  49.7  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3826  metallophosphoesterase  29.45 
 
 
366 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3391  metallophosphoesterase  30.23 
 
 
363 aa  49.7  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.119138  normal  0.040425 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3876  metallophosphoesterase  29.45 
 
 
366 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4297  metallophosphoesterase  34.62 
 
 
270 aa  46.2  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2477  metallophosphoesterase  29.91 
 
 
301 aa  44.7  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0215204 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1405  Ser/Thr protein phosphatase family protein  36.11 
 
 
275 aa  44.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2547  metallophosphoesterase  29.91 
 
 
306 aa  43.9  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>