14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2486 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2486  metallophosphoesterase  100 
 
 		 586 aa  1203    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.907019  normal  0.296957 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1468  metallophosphoesterase  56.23 
 
 		 804 aa  615  1e-175  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5249  metallophosphoesterase  49.22 
 
 		 659 aa  515  1e-144  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0905  twin-arginine translocation pathway signal  47.93 
 
 		 662 aa  487  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.486466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2027  metallophosphoesterase  46.27 
 
 		 595 aa  484  1e-135  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2026  metallophosphoesterase  46.29 
 
 		 719 aa  476  1e-133  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0794  twin-arginine translocation pathway signal  47.25 
 
 		 659 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.410839 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2905  metallophosphoesterase  51.99 
 
 		 593 aa  470  1.0000000000000001e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1179  geranylgeranylglyceryl phosphate synthase family protein  43.89 
 
 		 506 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.6021  normal  0.228569 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3235  metallophosphoesterase  26.4 
 
 		 499 aa  140  7.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4124  metallophosphoesterase  27.11 
 
 		 554 aa  114  4.0000000000000004e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2843  metallophosphoesterase  23.9 
 
 		 527 aa  107  6e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00214985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1384  metallophosphoesterase  24.11 
 
 		 546 aa  60.1  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  23.88 
 
 		 3977 aa  48.1  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>