13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_5249 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0794  twin-arginine translocation pathway signal  75.11 
 
 		 659 aa  1030    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.410839 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0905  twin-arginine translocation pathway signal  79.15 
 
 		 662 aa  1090    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.486466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2905  metallophosphoesterase  54.62 
 
 		 593 aa  637    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2026  metallophosphoesterase  51.16 
 
 		 719 aa  650    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5249  metallophosphoesterase  100 
 
 		 659 aa  1357    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2486  metallophosphoesterase  49.22 
 
 		 586 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.907019  normal  0.296957 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1468  metallophosphoesterase  43.71 
 
 		 804 aa  451  1e-125  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2027  metallophosphoesterase  44.97 
 
 		 595 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1179  geranylgeranylglyceryl phosphate synthase family protein  42.15 
 
 		 506 aa  374  1e-102  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.6021  normal  0.228569 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4124  metallophosphoesterase  25.6 
 
 		 554 aa  104  4e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2843  metallophosphoesterase  22.85 
 
 		 527 aa  88.6  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00214985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3235  metallophosphoesterase  33.51 
 
 		 499 aa  85.1  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1384  metallophosphoesterase  27.55 
 
 		 546 aa  46.2  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>