13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2026 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_0794  twin-arginine translocation pathway signal  52.62 
 
 
659 aa  653    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.410839 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0905  twin-arginine translocation pathway signal  54.47 
 
 
662 aa  694    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.486466  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2026  metallophosphoesterase  100 
 
 
719 aa  1489    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5249  metallophosphoesterase  51.16 
 
 
659 aa  652    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2905  metallophosphoesterase  56.5 
 
 
593 aa  626  1e-178  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2486  metallophosphoesterase  47.71 
 
 
586 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.907019  normal  0.296957 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2027  metallophosphoesterase  44.96 
 
 
595 aa  449  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1468  metallophosphoesterase  44.43 
 
 
804 aa  438  1e-121  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1179  geranylgeranylglyceryl phosphate synthase family protein  41.26 
 
 
506 aa  335  2e-90  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.6021  normal  0.228569 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3235  metallophosphoesterase  25.69 
 
 
499 aa  105  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4124  metallophosphoesterase  24.9 
 
 
554 aa  105  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2843  metallophosphoesterase  21.75 
 
 
527 aa  95.9  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00214985  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1384  metallophosphoesterase  22.4 
 
 
546 aa  54.3  0.000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>