More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1623 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1623  putative transport protein (permease)  100 
 
 		 545 aa  1061    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0208  major facilitator transporter  65.64 
 
 		 527 aa  668    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.639267 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1814  major facilitator superfamily MFS_1  36.01 
 
 		 522 aa  299  9e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0912576 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3991  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.13 
 
 		 527 aa  268  2.9999999999999995e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6362  major facilitator transporter  36.25 
 
 		 526 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1466  major facilitator transporter  36.25 
 
 		 526 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0127999  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7029  major facilitator transporter  36.04 
 
 		 526 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.97831  normal  0.626046 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4968  major facilitator transporter  34.53 
 
 		 529 aa  247  4e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0130308 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.98 
 
 		 529 aa  230  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.378354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.14 
 
 		 527 aa  220  7e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0955  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.45 
 
 		 539 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0835  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.24 
 
 		 536 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.861502 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3278  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.54 
 
 		 539 aa  210  5e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.629429  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2303  major facilitator superfamily MFS_1  29.08 
 
 		 545 aa  205  2e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292812  normal  0.0663224 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0142  major facilitator transporter  32.2 
 
 		 511 aa  204  4e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5000  major facilitator transporter  30.12 
 
 		 535 aa  203  8e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.159102 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2527  major facilitator superfamily MFS_1  29.69 
 
 		 522 aa  201  3.9999999999999996e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27430  putative multidrug efflux MFS transporter  32.54 
 
 		 530 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0744165  normal  0.700486 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2981  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.45 
 
 		 540 aa  200  5e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1607  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.18 
 
 		 535 aa  200  6e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.798645  hitchhiker  0.000105098 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1697  major facilitator superfamily MFS_1  30.83 
 
 		 499 aa  200  7e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2500  major facilitator transporter  28.49 
 
 		 577 aa  198  2.0000000000000003e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.706515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2125  major facilitator superfamily MFS_1  30.69 
 
 		 537 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2320  major facilitator transporter  33.13 
 
 		 544 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0793665  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3453  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.31 
 
 		 519 aa  195  2e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1156  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  29.26 
 
 		 524 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.783022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2736  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.82 
 
 		 517 aa  189  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.545703 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6590  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.56 
 
 		 523 aa  188  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1991  MFS family transporter  27.71 
 
 		 519 aa  189  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.332362  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1705  major facilitator superfamily MFS_1  29.83 
 
 		 553 aa  187  3e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23520  putative MFS transporter  27.47 
 
 		 499 aa  188  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0341451 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1333  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 535 aa  185  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1876  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.02 
 
 		 516 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.803136  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1271  major facilitator transporter  32.08 
 
 		 513 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4577  major facilitator transporter  33.49 
 
 		 513 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.487464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1506  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.41 
 
 		 516 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0872  major facilitator transporter  31.66 
 
 		 513 aa  183  6e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5591  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter EmrB/QacA subfamily  27.79 
 
 		 524 aa  182  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4454  major facilitator transporter  31.27 
 
 		 513 aa  182  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.544324  normal  0.740147 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1975  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.41 
 
 		 516 aa  180  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.211725  hitchhiker  0.00374336 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3785  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.41 
 
 		 516 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0929459  normal  0.428314 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46380  major facilitator superfamily protein  29.58 
 
 		 518 aa  178  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00900  inner membrane multidrug resistance transmembrane protein  31.81 
 
 		 498 aa  177  3e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.976104 
 
 
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NC_011312  VSAL_I2017  MFS transporter  23.19 
 
 		 534 aa  178  3e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.775296  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3380  major facilitator superfamily MFS_1  31.02 
 
 		 509 aa  173  5.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.188058 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3676  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.85 
 
 		 504 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2067  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.64 
 
 		 527 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.851411 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4495  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.04 
 
 		 526 aa  169  9e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0608194  normal  0.157501 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4488  major facilitator transporter  28.62 
 
 		 541 aa  168  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008543  Bcen2424_3754  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.53 
 
 		 524 aa  167  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.118599 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4609  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.53 
 
 		 524 aa  167  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4286  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.29 
 
 		 527 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.146244  normal  0.252791 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2113  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.42 
 
 		 514 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3193  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.56 
 
 		 527 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4967  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.56 
 
 		 527 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.13795  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48300  putative MFS transporter  28.03 
 
 		 503 aa  164  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.966541  normal  0.132172 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4417  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.05 
 
 		 523 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.022578  normal  0.743863 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3769  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.52 
 
 		 524 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172392 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3361  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.61 
 
 		 535 aa  163  6e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182834  hitchhiker  0.000000000000491163 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3631  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.14 
 
 		 524 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.184046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00460  transport protein  25.84 
 
 		 528 aa  162  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0564548  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3405  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.1 
 
 		 538 aa  162  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0500  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.67 
 
 		 543 aa  161  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.667013  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5485  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.94 
 
 		 524 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.928776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2345  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.93 
 
 		 524 aa  160  8e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0524  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.8 
 
 		 535 aa  157  7e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3508  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25 
 
 		 535 aa  157  7e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.87525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.8 
 
 		 535 aa  155  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0737  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  26.79 
 
 		 523 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.299859  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4976  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.1 
 
 		 524 aa  155  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0403  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  26.21 
 
 		 529 aa  155  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3900  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.8 
 
 		 528 aa  154  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.645893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3627  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.8 
 
 		 528 aa  154  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.126338  normal  0.617009 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4466  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.8 
 
 		 528 aa  154  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.87368  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4522  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.72 
 
 		 526 aa  154  5e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.121498 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2927  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.25 
 
 		 530 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.401426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3842  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.2 
 
 		 542 aa  153  8e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3786  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.2 
 
 		 542 aa  152  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3968  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.2 
 
 		 542 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0483  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.2 
 
 		 542 aa  152  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0525  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  24.85 
 
 		 539 aa  151  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4683  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.57 
 
 		 529 aa  151  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.20572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2192  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.96 
 
 		 528 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.024166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3794  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.59 
 
 		 528 aa  145  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.354181 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3275  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.38 
 
 		 528 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0453  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.16 
 
 		 526 aa  143  7e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7472  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.98 
 
 		 543 aa  143  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011894  Mnod_6435  major facilitator superfamily MFS_1  27.55 
 
 		 509 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011365  Gdia_1820  putative transporter protein  27.21 
 
 		 457 aa  139  1e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.398976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4652  putative drug resistance transporter  24.45 
 
 		 508 aa  138  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.357628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4512  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.93 
 
 		 523 aa  137  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal  0.994671 
 
 
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NC_007794  Saro_1714  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25 
 
 		 532 aa  135  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
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NC_003295  RSc2727  multidrug resistance transmembrane protein  25.85 
 
 		 511 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010117  COXBURSA331_A1151  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  21.46 
 
 		 526 aa  132  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.96 
 
 		 520 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
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NC_009727  CBUD_0865  multidrug resistance protein B  21.46 
 
 		 526 aa  130  4.0000000000000003e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007643  Rru_A0157  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.52 
 
 		 524 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.506571  n/a   
 
 
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NC_009636  Smed_2794  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.28 
 
 		 529 aa  130  6e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.574057 
 
 
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NC_013132  Cpin_5006  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.23 
 
 		 513 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.328138  hitchhiker  0.00378398 
 
 
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NC_008783  BARBAKC583_1089  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.75 
 
 		 525 aa  127  5e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.831472  n/a   
 
 
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