48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_16560 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_16560  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  240  6e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24710  Transposase, IS4  75.26 
 
 		 335 aa  151  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49770  IS4 family transposase  73.2 
 
 		 335 aa  150  8e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36450  Transposase, IS4  73.2 
 
 		 335 aa  150  8e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26840  Transposase, IS4  73.2 
 
 		 335 aa  150  8e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24660  Transposase, IS4  73.2 
 
 		 335 aa  150  8e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16640  Transposase, IS4  73.2 
 
 		 335 aa  150  8e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0318  transposase IS4 family protein  56.38 
 
 		 314 aa  111  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.356657  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0337  transposase IS4 family protein  54.26 
 
 		 345 aa  110  9e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0260  transposase IS4 family protein  54.26 
 
 		 345 aa  110  9e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1943  transposase IS4 family protein  54.26 
 
 		 345 aa  108  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0044381  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0479  transposase IS4 family protein  54.26 
 
 		 345 aa  108  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3123  transposase IS4 family protein  48.39 
 
 		 360 aa  76.3  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0955  transposase IS4 family protein  48.39 
 
 		 360 aa  76.3  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0147  IS5 family transposase  40.66 
 
 		 316 aa  68.9  0.00000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2708  hypothetical protein  42.67 
 
 		 101 aa  68.2  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.482278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1747  transposase IS4 family protein  40 
 
 		 359 aa  67.4  0.00000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.25501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2450  transposase IS4 family protein  36.73 
 
 		 348 aa  65.5  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.348584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2324  transposase IS4 family protein  36.73 
 
 		 348 aa  65.5  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.552067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1361  transposase IS4 family protein  35.71 
 
 		 240 aa  63.9  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.873798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4812  transposase IS4 family protein  38.27 
 
 		 363 aa  62.8  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2457  transposase IS4 family protein  34.44 
 
 		 338 aa  60.8  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000063174  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2638  transposase IS4 family protein  34.44 
 
 		 338 aa  60.8  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0500483  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3091  transposase IS4 family protein  34.44 
 
 		 338 aa  60.8  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1665  transposase IS4 family protein  40.23 
 
 		 367 aa  58.9  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.114037  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0712  transposase IS4 family protein  34.02 
 
 		 352 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.147808 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0829  transposase IS4 family protein  34.02 
 
 		 352 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0222  transposase IS4 family protein  32.99 
 
 		 348 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5319  transposase IS4 family protein  39.53 
 
 		 353 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.316405 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2611  integrase catalytic subunit  52.54 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.176576 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2227  insertion element hypothetical protein  92 
 
 		 58 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00152933  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0919  putative transposase protein  92 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1950  integrase core subunit  92 
 
 		 229 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00677093  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0554  integrase core subunit  92 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1888  integrase core subunit  92 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.932176  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0893  transposase  88 
 
 		 58 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.252263  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1595  integrase core subunit  88 
 
 		 289 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.191885  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1776  integrase core subunit  88 
 
 		 273 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000934851  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1196  IS5 family transposase  38.46 
 
 		 334 aa  53.5  0.0000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.107807  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2759  transposase (class II)  35.48 
 
 		 174 aa  51.2  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.195506  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2023  integrase catalytic subunit  83.33 
 
 		 273 aa  50.8  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.15416  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2971  IS1246 transposase  62.16 
 
 		 280 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0864617 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0396  transposase IS116/IS110/IS902  35.63 
 
 		 370 aa  49.7  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.29591 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5109  IS4 family transposase  32.56 
 
 		 358 aa  48.9  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0975401  normal  0.0840327 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00288  transposase  51.28 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0187246  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0887  ISMca7, transposase  37.31 
 
 		 316 aa  43.5  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.718258  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02984  integrase core domain protein  64 
 
 		 233 aa  40.8  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4041  transposase, IS4  28.57 
 
 		 445 aa  40.8  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.923218  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>