284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_05380 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_05380  Polysaccharide export protein  100 
 
 
334 aa  674    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.273333  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2021  polysaccharide export protein  50.88 
 
 
341 aa  325  7e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5485  polysaccharide export protein  28.78 
 
 
384 aa  100  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2881  polysaccharide export protein  30.3 
 
 
229 aa  86.3  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0979  polysaccharide export protein  28.32 
 
 
234 aa  75.9  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2833  polysaccharide export protein  31.69 
 
 
192 aa  73.2  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2738  polysaccharide export protein  31.69 
 
 
192 aa  73.2  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1528  polysaccharide export protein  30.23 
 
 
246 aa  72.8  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2650  polysaccharide export protein  31.69 
 
 
192 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28267  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2909  polysaccharide export protein  27.03 
 
 
446 aa  71.2  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723004  hitchhiker  0.000339784 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  29.66 
 
 
205 aa  70.9  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2618  polysaccharide export protein  30.28 
 
 
193 aa  70.1  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.676482  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1525  polysaccharide export protein  34.43 
 
 
243 aa  68.6  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2586  polysaccharide export protein  30.2 
 
 
184 aa  68.6  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.693737  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1691  polysaccharide export protein  27.68 
 
 
244 aa  66.2  0.0000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000171908  normal  0.0125517 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3071  polysaccharide export protein  29 
 
 
268 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1482  polysaccharide export protein  30.61 
 
 
270 aa  65.1  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.242862  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1538  GumB protein  29.93 
 
 
249 aa  65.1  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3311  polysaccharide export protein  29.59 
 
 
324 aa  64.3  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.328062 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1011  polysaccharide export protein  27.57 
 
 
388 aa  63.2  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.192426  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1296  polysaccharide export protein  28.26 
 
 
378 aa  62.8  0.000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.660258  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1444  polysaccharide export protein  25.53 
 
 
252 aa  62.8  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2475  polysaccharide export protein  27.1 
 
 
283 aa  62.8  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3192  polysaccharide export protein  26.35 
 
 
227 aa  62  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1470  polysaccharide export protein  30.11 
 
 
828 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.270093  normal  0.749053 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2671  polysaccharide export protein  29.93 
 
 
919 aa  62  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3035  polysaccharide export protein  30.11 
 
 
828 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.636336  normal  0.407015 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0619  polysaccharide export protein  25.44 
 
 
376 aa  62.4  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112684  normal  0.159669 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2193  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.71 
 
 
378 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000597973  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2894  polysaccharide export protein  30.43 
 
 
377 aa  61.2  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0993342  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2264  ClpX, ATPase regulatory subunit  30.66 
 
 
827 aa  60.8  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000642696  decreased coverage  0.000131264 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2717  polysaccharide export protein  28.99 
 
 
379 aa  61.2  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.335454  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00687  hypothetical protein  29.5 
 
 
897 aa  60.8  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4309  polysaccharide export protein  23.47 
 
 
495 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2590  polysaccharide export protein  29.58 
 
 
185 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  30 
 
 
205 aa  60.1  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0827  polysaccharide export protein  25.69 
 
 
456 aa  60.1  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.895511  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4916  polysaccharide export protein  34.29 
 
 
397 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.713407  hitchhiker  0.000554375 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2730  polysaccharide export protein  29.58 
 
 
185 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1114  polysaccharide export protein  31.43 
 
 
431 aa  60.1  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0366205  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3126  polysaccharide export protein  29.58 
 
 
185 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0860  polysaccharide export protein  30.21 
 
 
437 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2676  polysaccharide export protein  28.05 
 
 
379 aa  60.1  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.259667 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16271  hypothetical protein  22.7 
 
 
577 aa  59.7  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1369  capsular polysaccharide export protein, putative  24.54 
 
 
362 aa  59.7  0.00000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.361316  normal  0.297509 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2344  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.05 
 
 
379 aa  59.7  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.675285  normal  0.855008 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2365  polysaccharide export protein  24.33 
 
 
282 aa  59.7  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2458  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.05 
 
 
379 aa  59.7  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0550214 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1395  polysaccharide export protein  27.45 
 
 
931 aa  59.3  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0391429  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2351  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.05 
 
 
351 aa  59.7  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2300  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.05 
 
 
348 aa  59.3  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.631767  normal  0.480899 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2243  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.05 
 
 
348 aa  59.3  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1430  capsular polysaccharide export protein, putative  25.86 
 
 
333 aa  58.9  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3036  polysaccharide export protein  27.54 
 
 
378 aa  58.5  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2473  polysaccharide export protein  34.31 
 
 
379 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0662836  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4409  polysaccharide export protein  26.39 
 
 
368 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1651  polysaccharide export protein  26.81 
 
 
915 aa  57.8  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.530434  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4275  polysaccharide export protein  26.04 
 
 
368 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1842  polysaccharide export protein  26.34 
 
 
379 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.185865  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1069  polysaccharide export protein  25.75 
 
 
227 aa  58.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01391  exopolysaccharide xanthan biosynthesis export protein GumB  26.72 
 
 
232 aa  57.4  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0242  polysaccharide export protein  28.57 
 
 
264 aa  57  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1712  polysaccharide export protein  29.63 
 
 
386 aa  57.4  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69321  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1658  polysaccharide export protein  25 
 
 
277 aa  56.6  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00056738  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2543  polysaccharide export protein  28.99 
 
 
919 aa  56.6  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.941823  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1013  hypothetical protein  27.15 
 
 
191 aa  56.6  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.528873  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3692  polysaccharide export protein  32.32 
 
 
348 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.427794  normal  0.965292 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2257  putative outer membrane polysaccharide exporter  32.06 
 
 
384 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4430  polysaccharide export protein  26.04 
 
 
368 aa  56.6  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.756533  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2920  polysaccharide export protein  28.17 
 
 
185 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.157284 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2734  capsular polysaccharide export protein, putative  31.16 
 
 
276 aa  56.2  0.0000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0365414 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  28.21 
 
 
270 aa  56.2  0.0000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4819  polysaccharide export protein  29.91 
 
 
200 aa  56.2  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00986  predicted exopolysaccharide export protein  27.54 
 
 
379 aa  55.8  0.0000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2660  polysaccharide export protein  27.54 
 
 
379 aa  55.8  0.0000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  29.93 
 
 
264 aa  56.2  0.0000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2478  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  24.9 
 
 
268 aa  55.8  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1669  polysaccharide export protein  26.62 
 
 
347 aa  55.8  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00993  hypothetical protein  27.54 
 
 
379 aa  55.8  0.0000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1219  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  27.54 
 
 
379 aa  55.8  0.0000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2332  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  27.54 
 
 
386 aa  55.8  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.132677  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1099  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  27.54 
 
 
386 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0031657  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2613  polysaccharide export protein  27.54 
 
 
379 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.139508 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06665  hypothetical protein  29.2 
 
 
373 aa  55.5  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3701  polysaccharide export protein  32.86 
 
 
392 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4540  polysaccharide export protein  32.86 
 
 
387 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169971  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2843  polysaccharide export protein  27.45 
 
 
910 aa  55.5  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427616  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1092  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  27.54 
 
 
386 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1769  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  24.81 
 
 
268 aa  55.5  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3823  polysaccharide export protein  32.86 
 
 
387 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87104  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2192  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  31.62 
 
 
429 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3193  polysaccharide biosynthesis protein  27.54 
 
 
921 aa  55.1  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4429  polysaccharide export protein  23.5 
 
 
374 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.145769  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1463  putative polysaccharide export protein  28.46 
 
 
352 aa  55.1  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.24713e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0647  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  31.62 
 
 
429 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.377734  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2893  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  31.62 
 
 
429 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6022  polysaccharide export protein  32.06 
 
 
384 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113173  normal  0.244063 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2515  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  31.62 
 
 
429 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0689  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  25.65 
 
 
268 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.659999 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0661  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  31.62 
 
 
429 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.520209  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>