More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1199 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1199  pyrE protein  100 
 
 		 178 aa  359  9e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0690  orotate phosphoribosyltransferase  49.4 
 
 		 180 aa  165  4e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6071  orotate phosphoribosyltransferase  51.2 
 
 		 175 aa  164  6.9999999999999995e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0750  orotate phosphoribosyltransferase  62.18 
 
 		 180 aa  164  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0532  orotate phosphoribosyltransferase  48.8 
 
 		 188 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0532  orotate phosphoribosyltransferase  60.5 
 
 		 180 aa  159  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00117498  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0559  orotate phosphoribosyltransferase  50.6 
 
 		 178 aa  159  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6143  orotate phosphoribosyltransferase  47.9 
 
 		 176 aa  154  9e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.360288  normal  0.0393494 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4354  orotate phosphoribosyltransferase  52.98 
 
 		 179 aa  148  4e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.405155  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2302  orotate phosphoribosyltransferase  45.71 
 
 		 178 aa  127  9.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.875367  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1830  orotate phosphoribosyltransferase  57.26 
 
 		 185 aa  117  7e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.131476  normal  0.0283563 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0584  orotate phosphoribosyltransferase  36.88 
 
 		 191 aa  94.4  7e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.306687 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1052  orotate phosphoribosyltransferase  35.71 
 
 		 182 aa  94  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0849  orotate phosphoribosyltransferase  36.59 
 
 		 186 aa  92.8  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.198231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4002  orotate phosphoribosyltransferase  42.48 
 
 		 176 aa  92  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00738468  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1784  orotate phosphoribosyltransferase  44.35 
 
 		 215 aa  90.5  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.474409  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3515  orotate phosphoribosyltransferase  34.62 
 
 		 187 aa  87.4  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.066849  normal  0.969303 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2358  orotate phosphoribosyltransferase  35.8 
 
 		 206 aa  87.4  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0140374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0085  orotate phosphoribosyltransferase  34.62 
 
 		 185 aa  83.2  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1182  orotate phosphoribosyltransferase  34.62 
 
 		 185 aa  82.4  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.382161  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1148  orotate phosphoribosyltransferase  36.43 
 
 		 173 aa  82.4  0.000000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0736  orotate phosphoribosyltransferase  33.97 
 
 		 185 aa  79.7  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.555923 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1170  orotate phosphoribosyltransferase  30.72 
 
 		 166 aa  79  0.00000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1965  orotate phosphoribosyltransferase  28.39 
 
 		 191 aa  77.4  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0561  orotate phosphoribosyltransferase  40.35 
 
 		 179 aa  77  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.643948  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1001  orotate phosphoribosyltransferase  40.95 
 
 		 170 aa  76.6  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.106165  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1325  orotate phosphoribosyltransferase  32.78 
 
 		 185 aa  76.3  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2462  orotate phosphoribosyltransferase  32.2 
 
 		 208 aa  76.3  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1121  orotate phosphoribosyltransferase  36.09 
 
 		 203 aa  75.1  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0317  orotate phosphoribosyltransferase  34.64 
 
 		 169 aa  75.1  0.0000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0153  orotate phosphoribosyltransferase  32.73 
 
 		 187 aa  75.1  0.0000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.909719 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0801  orotate phosphoribosyltransferase  39.29 
 
 		 185 aa  74.7  0.0000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0953  orotate phosphoribosyltransferase  34.64 
 
 		 183 aa  74.3  0.0000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3008  orotate phosphoribosyltransferase  35 
 
 		 177 aa  73.6  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0210  orotate phosphoribosyltransferase  34.86 
 
 		 178 aa  73.6  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3572  orotate phosphoribosyltransferase  37.06 
 
 		 201 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2463  orotate phosphoribosyltransferase  32.2 
 
 		 188 aa  73.2  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0081584 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2541  orotate phosphoribosyltransferase  33.53 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.536465  normal  0.0846935 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2783  orotate phosphoribosyltransferase  33.99 
 
 		 174 aa  72.8  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3708  orotate phosphoribosyltransferase  32.93 
 
 		 190 aa  71.2  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.684552  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0506  orotate phosphoribosyltransferase  33.97 
 
 		 193 aa  71.2  0.000000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.179703 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0460  orotate phosphoribosyltransferase  34.81 
 
 		 204 aa  70.9  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.249088  normal  0.2022 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2976  orotate phosphoribosyltransferase  30.43 
 
 		 191 aa  69.7  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5160  orotate phosphoribosyltransferase  32.94 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3012  orotate phosphoribosyltransferase  32.2 
 
 		 186 aa  70.1  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.678971  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8390  orotate phosphoribosyltransferase  33.88 
 
 		 191 aa  69.7  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.353067 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2347  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  32.03 
 
 		 479 aa  68.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.159703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2296  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  32.03 
 
 		 479 aa  68.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3646  orotate phosphoribosyltransferase  30.94 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0294  orotate phosphoribosyltransferase  32.22 
 
 		 219 aa  68.6  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0710399 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1777  orotate phosphoribosyltransferase  30.32 
 
 		 192 aa  68.6  0.00000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000386496 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3634  orotate phosphoribosyltransferase  33.73 
 
 		 189 aa  67.8  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.274017  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0565  orotate phosphoribosyltransferase  26.95 
 
 		 181 aa  67  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00922313 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0096  orotate phosphoribosyltransferase  33.9 
 
 		 193 aa  67  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0503  orotate phosphoribosyltransferase  33.7 
 
 		 187 aa  67.4  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25780  orotate phosphoribosyltransferase  31.18 
 
 		 199 aa  67  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1651  orotate phosphoribosyltransferase  33.95 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.394829  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02991  orotate phosphoribosyltransferase  28.32 
 
 		 186 aa  66.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.734545  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0277  orotate phosphoribosyltransferase  27.75 
 
 		 186 aa  66.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0263  orotate phosphoribosyltransferase  29.37 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0981  orotate phosphoribosyltransferase  39.53 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02981  orotate phosphoribosyltransferase  28.32 
 
 		 186 aa  65.9  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2592  orotate phosphoribosyltransferase  38.39 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.989423 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1693  orotate phosphoribosyltransferase  29.22 
 
 		 192 aa  65.9  0.0000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.165076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6419  orotate phosphoribosyltransferase  33.76 
 
 		 174 aa  66.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01980  orotate phosphoribosyltransferase  29.95 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1108  orotate phosphoribosyltransferase  34.94 
 
 		 172 aa  65.5  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.10081  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0181  orotate phosphoribosyltransferase  31.84 
 
 		 178 aa  65.1  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1381  orotate phosphoribosyltransferase  27.67 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000390068  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1196  orotate phosphoribosyltransferase  27.67 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100317  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10387  orotate phosphoribosyltransferase  30.05 
 
 		 179 aa  65.1  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.32666e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1046  orotate phosphoribosyltransferase  39.53 
 
 		 209 aa  64.7  0.0000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0756339  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1159  orotate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 209 aa  64.7  0.0000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.712635  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1679  orotate phosphoribosyltransferase  35.14 
 
 		 195 aa  64.3  0.0000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1310  orotate phosphoribosyltransferase  31.2 
 
 		 219 aa  64.3  0.0000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1921  orotate phosphoribosyltransferase  32.26 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3568  orotate phosphoribosyltransferase  32.53 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0180203  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4858  orotate phosphoribosyltransferase  30.39 
 
 		 187 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.684444 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4631  orotate phosphoribosyltransferase  33.97 
 
 		 177 aa  63.9  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.472051 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0289  orotate phosphoribosyltransferase  29.82 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000476622 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0006  orotate phosphoribosyltransferase  28.16 
 
 		 198 aa  63.9  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.292815  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0425  orotate phosphoribosyltransferase  32.4 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4069  orotate phosphoribosyltransferase  34.13 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.269841  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0231  orotate phosphoribosyltransferase  28.18 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0847  orotate phosphoribosyltransferase  30.73 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0955  orotate phosphoribosyltransferase  30.91 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4186  orotate phosphoribosyltransferase  30.61 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1671  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  32.43 
 
 		 482 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03081  orotate phosphoribosyltransferase  28.12 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.691934  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0957  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  30.16 
 
 		 477 aa  62.4  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.434428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5205  orotate phosphoribosyltransferase  30.17 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24961  orotate phosphoribosyltransferase  32.93 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1456  orotate phosphoribosyltransferase  29.78 
 
 		 183 aa  62.8  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000351938  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1205  orotate phosphoribosyltransferase  30.23 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.118025  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2123  orotate phosphoribosyltransferase  38.58 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1589  orotate phosphoribosyltransferase  34.91 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2662  orotate phosphoribosyltransferase  30.33 
 
 		 207 aa  62  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1463  orotate phosphoribosyltransferase  33.65 
 
 		 221 aa  61.6  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.66413 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3147  orotate phosphoribosyltransferase  30.6 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2703  orotate phosphoribosyltransferase  29.78 
 
 		 183 aa  61.6  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>