More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1830 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1830  orotate phosphoribosyltransferase  100 
 
 
185 aa  358  2e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.131476  normal  0.0283563 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4354  orotate phosphoribosyltransferase  76.74 
 
 
179 aa  236  2e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.405155  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0559  orotate phosphoribosyltransferase  61.93 
 
 
178 aa  202  2e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6071  orotate phosphoribosyltransferase  62.72 
 
 
175 aa  199  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0690  orotate phosphoribosyltransferase  53.33 
 
 
180 aa  176  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0532  orotate phosphoribosyltransferase  53.33 
 
 
180 aa  174  5e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00117498  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0750  orotate phosphoribosyltransferase  52.73 
 
 
180 aa  174  7e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6143  orotate phosphoribosyltransferase  55.29 
 
 
176 aa  172  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.360288  normal  0.0393494 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0532  orotate phosphoribosyltransferase  52.12 
 
 
188 aa  171  5.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1199  pyrE protein  48.85 
 
 
178 aa  149  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2302  orotate phosphoribosyltransferase  43.86 
 
 
178 aa  110  9e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.875367  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0849  orotate phosphoribosyltransferase  42.33 
 
 
186 aa  108  4.0000000000000004e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.198231  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0584  orotate phosphoribosyltransferase  42.04 
 
 
191 aa  104  6e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.306687 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3515  orotate phosphoribosyltransferase  38.71 
 
 
187 aa  102  5e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.066849  normal  0.969303 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2783  orotate phosphoribosyltransferase  41.83 
 
 
174 aa  99  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1784  orotate phosphoribosyltransferase  42.95 
 
 
215 aa  98.6  5e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.474409  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1052  orotate phosphoribosyltransferase  37.24 
 
 
182 aa  97.1  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2358  orotate phosphoribosyltransferase  36.26 
 
 
206 aa  95.5  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0140374  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1170  orotate phosphoribosyltransferase  36.88 
 
 
166 aa  95.1  5e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4002  orotate phosphoribosyltransferase  34.9 
 
 
176 aa  94.7  7e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00738468  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0561  orotate phosphoribosyltransferase  33.54 
 
 
179 aa  92  4e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.643948  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1182  orotate phosphoribosyltransferase  35.58 
 
 
185 aa  91.7  6e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.382161  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0953  orotate phosphoribosyltransferase  39.22 
 
 
183 aa  90.5  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0085  orotate phosphoribosyltransferase  34.97 
 
 
185 aa  90.1  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0955  orotate phosphoribosyltransferase  36.36 
 
 
187 aa  89  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0736  orotate phosphoribosyltransferase  34.97 
 
 
185 aa  89  4e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.555923 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4858  orotate phosphoribosyltransferase  36.97 
 
 
187 aa  88.6  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.684444 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0847  orotate phosphoribosyltransferase  36.97 
 
 
187 aa  88.2  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0210  orotate phosphoribosyltransferase  41.62 
 
 
178 aa  88.2  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0565  orotate phosphoribosyltransferase  34.62 
 
 
181 aa  87.8  8e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00922313 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1965  orotate phosphoribosyltransferase  35.9 
 
 
191 aa  87.4  1e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5205  orotate phosphoribosyltransferase  37.35 
 
 
187 aa  86.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0451  orotate phosphoribosyltransferase  35.76 
 
 
213 aa  87  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0506  orotate phosphoribosyltransferase  37.58 
 
 
193 aa  86.7  2e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.179703 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1148  orotate phosphoribosyltransferase  37.5 
 
 
173 aa  85.5  4e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7360  orotate phosphoribosyltransferase  37.11 
 
 
185 aa  84.7  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1651  orotate phosphoribosyltransferase  35.67 
 
 
208 aa  84.3  8e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.394829  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3646  orotate phosphoribosyltransferase  40.88 
 
 
188 aa  84  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0957  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  31.71 
 
 
477 aa  83.2  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.434428  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0317  orotate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
169 aa  82  0.000000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0801  orotate phosphoribosyltransferase  32.5 
 
 
185 aa  82.4  0.000000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0153  orotate phosphoribosyltransferase  33.53 
 
 
187 aa  82  0.000000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.909719 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1121  orotate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
203 aa  82  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0263  orotate phosphoribosyltransferase  30.32 
 
 
211 aa  81.3  0.000000000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6419  orotate phosphoribosyltransferase  39.52 
 
 
174 aa  80.5  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0503  orotate phosphoribosyltransferase  39.18 
 
 
187 aa  79.7  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3012  orotate phosphoribosyltransferase  34.71 
 
 
186 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.678971  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1671  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  29.01 
 
 
482 aa  79  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1001  orotate phosphoribosyltransferase  36.13 
 
 
170 aa  79  0.00000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.106165  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02991  orotate phosphoribosyltransferase  32.08 
 
 
186 aa  79  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.734545  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0006  orotate phosphoribosyltransferase  37.42 
 
 
198 aa  78.6  0.00000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.292815  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10387  orotate phosphoribosyltransferase  37.14 
 
 
179 aa  78.6  0.00000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.32666e-16  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2296  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  29.27 
 
 
479 aa  77.8  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2347  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  29.27 
 
 
479 aa  77.8  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.159703  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2462  orotate phosphoribosyltransferase  32.14 
 
 
208 aa  78.2  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2976  orotate phosphoribosyltransferase  37.87 
 
 
191 aa  78.2  0.00000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4631  orotate phosphoribosyltransferase  40.37 
 
 
177 aa  77.8  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.472051 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5160  orotate phosphoribosyltransferase  39.18 
 
 
192 aa  77.8  0.00000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1693  orotate phosphoribosyltransferase  35.71 
 
 
192 aa  77.4  0.0000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.165076  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02981  orotate phosphoribosyltransferase  31.45 
 
 
186 aa  76.3  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25780  orotate phosphoribosyltransferase  40.62 
 
 
199 aa  76.6  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2592  orotate phosphoribosyltransferase  37.16 
 
 
202 aa  76.3  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.989423 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1205  orotate phosphoribosyltransferase  30.97 
 
 
210 aa  76.3  0.0000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.118025  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0181  orotate phosphoribosyltransferase  40.24 
 
 
178 aa  76.3  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_19418  Uridine 5'- monophosphate synthase  33.54 
 
 
474 aa  75.5  0.0000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0102475  normal  0.110461 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0460  orotate phosphoribosyltransferase  33.71 
 
 
204 aa  75.5  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.249088  normal  0.2022 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2463  orotate phosphoribosyltransferase  33.52 
 
 
188 aa  75.1  0.0000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0081584 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0289  orotate phosphoribosyltransferase  30.52 
 
 
201 aa  75.5  0.0000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000476622 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0566  orotate phosphoribosyltransferase  35.76 
 
 
242 aa  75.5  0.0000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0277  orotate phosphoribosyltransferase  30.19 
 
 
186 aa  74.7  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0125  orotate phosphoribosyltransferase  42.76 
 
 
179 aa  73.9  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3950  orotate phosphoribosyltransferase  37.36 
 
 
213 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4786  orotate phosphoribosyltransferase  40.36 
 
 
199 aa  73.9  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.288171  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3932  orotate phosphoribosyltransferase  37.36 
 
 
213 aa  73.2  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0874196  hitchhiker  0.000146436 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4013  orotate phosphoribosyltransferase  37.36 
 
 
213 aa  73.2  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62397  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4059  orotate phosphoribosyltransferase  37.36 
 
 
213 aa  73.2  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3008  orotate phosphoribosyltransferase  39.51 
 
 
177 aa  73.6  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01980  orotate phosphoribosyltransferase  37.97 
 
 
195 aa  73.6  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4120  orotate phosphoribosyltransferase  37.36 
 
 
213 aa  73.2  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4186  orotate phosphoribosyltransferase  37.16 
 
 
191 aa  73.6  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0376  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  27.85 
 
 
500 aa  73.2  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1777  orotate phosphoribosyltransferase  35.58 
 
 
192 aa  72.8  0.000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000386496 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4394  orotate phosphoribosyltransferase  37.14 
 
 
213 aa  72.4  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000864609  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2541  orotate phosphoribosyltransferase  31.87 
 
 
201 aa  72  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.536465  normal  0.0846935 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4105  orotate phosphoribosyltransferase  40 
 
 
213 aa  72.4  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00891654  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4143  orotate phosphoribosyltransferase  35.8 
 
 
213 aa  72  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00122436  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3977  orotate phosphoribosyltransferase  36.52 
 
 
213 aa  72  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.143581  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3572  orotate phosphoribosyltransferase  31.87 
 
 
201 aa  72  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03081  orotate phosphoribosyltransferase  30.19 
 
 
192 aa  72  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.691934  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02932  orotate phosphoribosyltransferase  35.5 
 
 
233 aa  72  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.434684  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03499  orotate phosphoribosyltransferase  36.52 
 
 
213 aa  71.6  0.000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0295894  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0063  orotate phosphoribosyltransferase  36.52 
 
 
213 aa  71.6  0.000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.160441  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03451  hypothetical protein  36.52 
 
 
213 aa  71.6  0.000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0214857  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1463  orotate phosphoribosyltransferase  33.59 
 
 
221 aa  71.6  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.66413 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3851  orotate phosphoribosyltransferase  36.52 
 
 
213 aa  71.6  0.000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000380668  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0069  orotate phosphoribosyltransferase  36.52 
 
 
213 aa  71.6  0.000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000170079  unclonable  0.00000000943905 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1310  orotate phosphoribosyltransferase  35.16 
 
 
219 aa  71.2  0.000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4067  orotate phosphoribosyltransferase  36.52 
 
 
213 aa  71.2  0.000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00621989  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5012  orotate phosphoribosyltransferase  36.52 
 
 
213 aa  71.2  0.000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.127395  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1469  orotate phosphoribosyltransferase  35.5 
 
 
186 aa  70.5  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.980339 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>