263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_R0015 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_R0015  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  163  8.000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0181398  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0050  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  163  8.000000000000001e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.167619  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0031  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 84 bp  119  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.045624  normal  0.187566 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0028  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 82 bp  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0033  tRNA-Leu  94.05 
 
 		 87 bp  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0031  tRNA-Leu  94.05 
 
 		 87 bp  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000305297  normal  0.643449 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0022  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 84 bp  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0039  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 84 bp  87.7  4e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000063325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0019  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  81.8  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0357055  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0055  tRNA-Leu  90.77 
 
 		 82 bp  81.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.143811  hitchhiker  0.0000015114 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0066  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.557427  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0054  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  75.8  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0022  tRNA-Leu  96 
 
 		 87 bp  75.8  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0017  tRNA-Leu  97.56 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0020  tRNA-Leu  97.56 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0381951  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1580  tRNA-Leu  97.44 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1615  tRNA-Leu  97.44 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.622416 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0006  tRNA-Leu  97.44 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0789376  normal  0.851363 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0035  tRNA-Leu  97.44 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.986583  normal  0.610194 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0004  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 82 bp  67.9  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.446366  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0002  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 82 bp  67.9  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.318863  normal  0.56109 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0058  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000819667  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0033  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0025  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000000676753  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0070  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0094  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0049  tRNA-Leu  87.69 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.172845  normal  0.818722 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0040  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 81 bp  61.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0015  tRNA-Leu  91.49 
 
 		 82 bp  61.9  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.134139  normal  0.0596328 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0024  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 81 bp  61.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0705568 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0005  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 84 bp  61.9  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0022  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 86 bp  61.9  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000969844  normal  0.805987 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0027  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0042  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 82 bp  60  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105612  normal  0.123579 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0073  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.218287  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0030  tRNA-Leu  86.15 
 
 		 82 bp  58  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0035  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 88 bp  58  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0023  tRNA-Leu  86.15 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.184177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0045  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 89 bp  58  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.259532  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20010  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 82 bp  58  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.108491  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0027  tRNA-Leu  89.58 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000026445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0030  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000143039  normal  0.038652 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0033  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 90 bp  54  0.000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.37116 
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.0000012405  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0036  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0019  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.531024  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0022  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0031  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0030  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0041  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0841981  normal  0.0137689 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0031  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00794076  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0032  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000644155  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0033  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000241168  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0049  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0102657  normal  0.539349 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0050  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0025278  normal  0.537231 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0003  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 84 bp  54  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0026  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243318 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0057  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0404485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6050  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.981043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0067  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.07892  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0068  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.46503  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0076  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000528748  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0032  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 83 bp  54  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1890  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0027  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0005  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.886135  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09040  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00190056  normal  0.352495 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0044  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000291154  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0045  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11710  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.35262 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna148  tRNA-Leu  87.04 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000790983  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.1151  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0014  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.20516  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna140  tRNA-Leu  87.04 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000833162  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0002  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0074  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.313873  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna133  tRNA-Leu  87.04 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000824514  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna151  tRNA-Leu  87.04 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000109594  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNALeuVIMSS1309257  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0564631 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna142  tRNA-Leu  87.04 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000867918  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01233  tRNA-Leu  87.04 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01236  tRNA-Leu  87.04 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01237  tRNA-Leu  87.04 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01239  tRNA-Leu  87.04 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01242  tRNA-Leu  87.04 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna138  tRNA-Leu  87.04 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000894739  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna136  tRNA-Leu  87.04 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000736232  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna146  tRNA-Leu  87.04 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000807662  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna144  tRNA-Leu  87.04 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000990562  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0058  tRNA-Leu  85.25 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0724128 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0086  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 89 bp  50.1  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0072  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 89 bp  50.1  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0034  tRNA-Leu  84.62 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.501303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0024  tRNA-Leu  84.62 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.348047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0559  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 82 bp  50.1  0.00008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2172  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 82 bp  50.1  0.00008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.204006  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0063  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 89 bp  50.1  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.727445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0030  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0290157  normal  0.678466 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16310  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 86 bp  50.1  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.352958  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4916  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000645766  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>