More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_B0304 on replicon NC_007410
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007410  Ava_B0304  aminotransferase, class V  100 
 
 		 395 aa  807    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1092  Cysteine desulfurase  42.75 
 
 		 388 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.793736 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1063  aminotransferase class V  42.75 
 
 		 388 aa  296  3e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1563  cysteine desulfurase IscS  43.34 
 
 		 403 aa  296  5e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0229  Cysteine desulfurase  42.64 
 
 		 405 aa  292  9e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  41.3 
 
 		 417 aa  291  2e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0627  cysteine desulfurase  40.84 
 
 		 404 aa  290  2e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0592  cysteine desulfurase  40.84 
 
 		 404 aa  290  3e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4051  Cysteine desulfurase  42.86 
 
 		 380 aa  287  2e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0863916  normal  0.93961 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0618  cysteine desulfurase  40.58 
 
 		 404 aa  287  2e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5192  aminotransferase class V  42.6 
 
 		 392 aa  286  4e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.34588 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0637  cysteine desulfurase  40.84 
 
 		 404 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.273964 
 
 
-
 
NC_002978  WD0997  cysteine desulfurase  41.25 
 
 		 415 aa  284  2.0000000000000002e-75  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0437  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  41.88 
 
 		 388 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00696357  normal  0.223385 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0716  aminotransferase class V  42.82 
 
 		 387 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3062  cysteine desulfurase IscS  40.26 
 
 		 403 aa  281  1e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.635367  unclonable  0.000000859331 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1132  cysteine desulfurase  41.67 
 
 		 404 aa  281  2e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0410  cysteine desulfurase  40.78 
 
 		 422 aa  281  2e-74  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2190  Cysteine desulfurase  41.1 
 
 		 406 aa  278  1e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.980213  normal  0.0116553 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2264  cysteine desulfurase  41.15 
 
 		 404 aa  275  8e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0629  cysteine desulfurase  40.26 
 
 		 410 aa  275  8e-73  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1551  aminotransferase class V  41.25 
 
 		 383 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3449  cysteine desulfurase  39.37 
 
 		 389 aa  274  2.0000000000000002e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  40.16 
 
 		 382 aa  272  6e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0281  cysteine desulfurase  40.36 
 
 		 404 aa  272  9e-72  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.910551  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1950  cysteine desulfurase IscS  40.31 
 
 		 405 aa  271  1e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000000843977  normal  0.404205 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2558  cysteine desulfurase NifS  41.05 
 
 		 388 aa  271  1e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.947611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2317  cysteine desulfurase  39.58 
 
 		 404 aa  271  2e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.459864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0303  cysteine desulfurase  39.16 
 
 		 402 aa  270  4e-71  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  40.21 
 
 		 414 aa  269  5e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1371  aminotransferase class V  42.9 
 
 		 387 aa  270  5e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00447816  normal  0.862029 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  39.84 
 
 		 394 aa  269  5.9999999999999995e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1819  cysteine desulfurase  40.36 
 
 		 404 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00929317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2280  cysteine desulfurase  40.36 
 
 		 404 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0344556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0673  cysteine desulfurase IscS  37.96 
 
 		 407 aa  268  8.999999999999999e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.752721  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0041  aminotransferase class V  41.56 
 
 		 389 aa  268  8.999999999999999e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0822  cysteine desulfurase IscS  37.96 
 
 		 421 aa  268  1e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.02372  normal  0.880264 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1739  cysteine desulfurase  40.36 
 
 		 404 aa  268  1e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1776  cysteine desulfurase  40.36 
 
 		 404 aa  268  2e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.743071  hitchhiker  0.0000439392 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004360  cysteine desulfurase  38.8 
 
 		 404 aa  267  2e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.591204  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0717  cysteine desulfurase  39.58 
 
 		 406 aa  268  2e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  38.54 
 
 		 404 aa  267  2e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02508  cysteine desulfurase, alanine biosynthesis, putative (Eurofung)  40.71 
 
 		 507 aa  266  4e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  40.62 
 
 		 384 aa  266  4e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1058  cysteine desulfurase  39.01 
 
 		 405 aa  266  4e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0834623  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1493  cysteine desulfurase IscS  38.74 
 
 		 419 aa  266  4e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  40.36 
 
 		 384 aa  266  5e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  39.63 
 
 		 394 aa  266  5e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1458  cysteine desulfurase  38.8 
 
 		 404 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.586038  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  40.42 
 
 		 400 aa  265  1e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1293  cysteine desulfurase  39.32 
 
 		 404 aa  265  1e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0405061 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  37.7 
 
 		 400 aa  265  1e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2149  cysteine desulfurase  40.62 
 
 		 404 aa  265  1e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00291634  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05560  cysteine desulfhydrase, putative  40.1 
 
 		 502 aa  264  2e-69  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1277  cysteine desulfurase  40.36 
 
 		 396 aa  264  2e-69  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  38.54 
 
 		 396 aa  264  2e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4044  aminotransferase, class V  39.43 
 
 		 389 aa  264  2e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.159236 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1228  cysteine desulfurase  40.36 
 
 		 396 aa  264  2e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.72712  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0469  cysteine desulfurase IscS  38.9 
 
 		 419 aa  263  3e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00221025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4665  cysteine desulfurase IscS  39.4 
 
 		 436 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3698  cysteine desulfurase IscS  39.4 
 
 		 436 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.789582  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5326  aminotransferase, class V  37.7 
 
 		 387 aa  263  3e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.121125 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2424  cysteine desulfurase  39.58 
 
 		 404 aa  263  4e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0356  aminotransferase, class V  42.23 
 
 		 390 aa  263  4e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.230832 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01055  cysteine desulfurase  39.69 
 
 		 404 aa  263  4.999999999999999e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  40.31 
 
 		 392 aa  262  6e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3823  cysteine desulfurase IscS  39.4 
 
 		 403 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474065 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1164  cysteine desulfurase IscS  39.48 
 
 		 402 aa  261  2e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000196201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  37.76 
 
 		 384 aa  261  2e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34119  precursor of desulfurase cysteine desulfurase IscS  37.4 
 
 		 400 aa  261  2e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.275152  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6331  cysteine desulfurase IscS  38.48 
 
 		 405 aa  260  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.134755  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1144  cysteine desulfurase  38.74 
 
 		 407 aa  260  3e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282524  normal  0.237339 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2412  cysteine desulfurase IscS  39.13 
 
 		 403 aa  260  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2871  cysteine desulfurase  39.58 
 
 		 404 aa  260  3e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000328828 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  37.17 
 
 		 392 aa  259  4e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0616  aminotransferase class V  38.46 
 
 		 408 aa  259  5.0000000000000005e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.327538  normal  0.0437001 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1553  cysteine desulfurase  37.96 
 
 		 407 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0484493  normal  0.0430953 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2205  cysteine desulfurase IscS  39.27 
 
 		 403 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00230458  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  39.37 
 
 		 394 aa  259  6e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1961  cysteine desulfurase  40.36 
 
 		 404 aa  259  6e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.037165  hitchhiker  0.00267346 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  37.01 
 
 		 388 aa  259  8e-68  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1488  cysteine desulfurase  39.84 
 
 		 404 aa  258  1e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.645778  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2502  cysteine desulfurase  40.1 
 
 		 404 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00893038  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2386  cysteine desulfurase  40.1 
 
 		 404 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000240874  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2397  cysteine desulfurase  40.1 
 
 		 404 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0798953  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1351  aminotransferase class V  38.02 
 
 		 384 aa  258  1e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000567164 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0277  cysteine desulfurase  39.27 
 
 		 404 aa  258  2e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0284858  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  38.96 
 
 		 379 aa  257  2e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  38.64 
 
 		 404 aa  258  2e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45194  predicted protein  36.07 
 
 		 395 aa  258  2e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0622302  normal  0.609433 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1025  cysteine desulfurase  38.05 
 
 		 406 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00998384  normal  0.30784 
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  39.27 
 
 		 383 aa  256  3e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  37.37 
 
 		 400 aa  257  3e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.702313 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2579  cysteine desulfurase  37.43 
 
 		 407 aa  256  3e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120053  hitchhiker  0.000683499 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2059  cysteine desulfurase IscS  37.76 
 
 		 407 aa  256  4e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0733618  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0006  cysteine desulfurase  39.48 
 
 		 384 aa  256  4e-67  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  38.85 
 
 		 398 aa  256  4e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  37.53 
 
 		 402 aa  256  5e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0808  cysteine desulfurase IscS  38.22 
 
 		 405 aa  256  5e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000772731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  36.65 
 
 		 400 aa  256  5e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>