90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1789 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_1789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 319 aa  662    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5160  NmrA family protein  78.66 
 
 		 318 aa  524  1e-148  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2180  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.9 
 
 		 317 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2132  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60 
 
 		 317 aa  418  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2672  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.73 
 
 		 315 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.340849 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1715  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.97 
 
 		 324 aa  401  1e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0725  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.59 
 
 		 315 aa  381  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0116647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1087  hypothetical protein  53.14 
 
 		 324 aa  354  1e-96  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000930437 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18351  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  40.31 
 
 		 333 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.279534 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1016  hypothetical protein  41.12 
 
 		 339 aa  252  5.000000000000001e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0917  hypothetical protein  37.69 
 
 		 339 aa  241  7.999999999999999e-63  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.178943  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06381  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  35.91 
 
 		 327 aa  238  9e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06081  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  35.91 
 
 		 327 aa  238  1e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0582  hypothetical protein  36.22 
 
 		 327 aa  235  6e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10701  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  36.25 
 
 		 333 aa  223  4e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.638537 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0018  hypothetical protein  37.85 
 
 		 328 aa  216  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06381  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  37.23 
 
 		 328 aa  215  8e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0655453  normal  0.975907 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06471  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  34.14 
 
 		 294 aa  195  9e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.6 
 
 		 333 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1303  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.42 
 
 		 333 aa  53.1  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.956027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2037  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.5 
 
 		 299 aa  51.2  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.15 
 
 		 358 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0547255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.35 
 
 		 316 aa  51.2  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0445125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4319  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.37 
 
 		 329 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2441  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.09 
 
 		 333 aa  50.1  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.989614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13281  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  24.28 
 
 		 320 aa  49.3  0.00008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.425658  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.28 
 
 		 331 aa  49.3  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1008  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  23.64 
 
 		 338 aa  49.3  0.00009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.720845  normal  0.076451 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1267  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.35 
 
 		 330 aa  48.5  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1033  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 		 332 aa  48.1  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.19855 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2547  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.27 
 
 		 334 aa  48.5  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000238477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2289  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.56 
 
 		 351 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.881502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2018  hypothetical protein  24.08 
 
 		 294 aa  47.4  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.810011  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.81 
 
 		 333 aa  47.8  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0280203  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  29.63 
 
 		 290 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1339  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.07 
 
 		 331 aa  47.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3939  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.66 
 
 		 352 aa  47.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000297127  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.1 
 
 		 355 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.129655 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2707  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.14 
 
 		 342 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.529174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4690  NmrA family protein  26.98 
 
 		 286 aa  47  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2955  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.03 
 
 		 332 aa  46.6  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.312343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0793  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  26.78 
 
 		 331 aa  46.6  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0383  NmrA family protein  26.19 
 
 		 282 aa  46.6  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2883  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.18 
 
 		 348 aa  46.2  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0186538  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4752  NmrA family protein  26.98 
 
 		 286 aa  45.4  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0242  saccharopine dehydrogenase related protein  25.35 
 
 		 279 aa  45.8  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1672  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.44 
 
 		 349 aa  45.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.697474  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0060  hypothetical protein  23.34 
 
 		 294 aa  45.4  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1372  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.14 
 
 		 376 aa  45.4  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1488  NmrA family protein  19.43 
 
 		 300 aa  44.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3782  NmrA family protein  26.19 
 
 		 286 aa  45.1  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  27.52 
 
 		 290 aa  45.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0296  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.67 
 
 		 321 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0180  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.09 
 
 		 333 aa  44.7  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.094979  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04046  hypothetical protein  26.19 
 
 		 286 aa  44.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.288336  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.51 
 
 		 309 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.81324 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3795  NmrA family protein  26.19 
 
 		 286 aa  44.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.221042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4466  NmrA family protein  26.19 
 
 		 286 aa  45.1  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.176692  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4780  NmrA family protein  26.19 
 
 		 286 aa  45.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00502438  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0462  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.73 
 
 		 507 aa  44.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04083  NAD(P)H:quinone oxidoreductase  26.19 
 
 		 286 aa  44.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.216212  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1956  putative NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.9 
 
 		 320 aa  45.1  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.000864089  hitchhiker  0.00126231 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1474  NAD-dependent epimerase/dehydratase  20.7 
 
 		 348 aa  44.3  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0351849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2017  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  30.88 
 
 		 196 aa  44.3  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000204131  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0539  hypothetical protein  25.74 
 
 		 328 aa  44.3  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2001  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.51 
 
 		 309 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2372  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.42 
 
 		 339 aa  44.3  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3036  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.37 
 
 		 334 aa  43.5  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0768033  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6340  NmrA family protein  28.57 
 
 		 287 aa  43.9  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2584  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 		 330 aa  43.5  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.215116  normal  0.0809775 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4794  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.25 
 
 		 310 aa  43.5  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.865539  normal  0.851867 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.14 
 
 		 413 aa  43.5  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.245536  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2986  oxidoreductase, putative  29.66 
 
 		 349 aa  43.5  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0471013 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2034  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.93 
 
 		 307 aa  43.5  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1207  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.03 
 
 		 339 aa  43.1  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0228638  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1681  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.46 
 
 		 318 aa  43.1  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.514194  hitchhiker  0.0000234209 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4819  hypothetical protein  27.78 
 
 		 282 aa  43.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.130061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4669  hypothetical protein  27.78 
 
 		 282 aa  43.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4679  hypothetical protein  27.78 
 
 		 282 aa  43.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0639006  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2309  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.93 
 
 		 307 aa  43.1  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.433346  normal  0.120516 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5728  NmrA family protein  26.19 
 
 		 286 aa  43.1  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.045756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1679  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  22.18 
 
 		 294 aa  43.1  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.165214  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1422  NmrA family protein  30.38 
 
 		 293 aa  43.1  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.578575 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0002  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  21.68 
 
 		 322 aa  42.7  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.1 
 
 		 292 aa  43.1  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000135991  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1106  UDP-glucose 4-epimerase  27.12 
 
 		 337 aa  43.1  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.675883  normal  0.914714 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.26 
 
 		 243 aa  42.7  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1404  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.1 
 
 		 248 aa  42.7  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4808  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.15 
 
 		 324 aa  42.7  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.272895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2237  NmrA family protein  30.38 
 
 		 305 aa  42.4  0.01  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>