46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0945 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0945  ATPase  100 
 
 
448 aa  899    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0181  ATPase  65.36 
 
 
457 aa  565  1e-160  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.269249  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0629  AAA ATPase  49.25 
 
 
446 aa  403  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0859  putative excinuclease ATPase subunit  50.43 
 
 
450 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1645  ATPase  45.63 
 
 
451 aa  344  2e-93  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0103  ATPase  38.8 
 
 
423 aa  282  1e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3206  ATPase  33.05 
 
 
443 aa  226  9e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0853  ATPase  31.73 
 
 
445 aa  222  9e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2919  putative ATPase  28.01 
 
 
427 aa  167  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.741445  hitchhiker  0.00681239 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1634  ATPase  42.59 
 
 
94 aa  89.7  8e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2482  putative ABC transporter, ATP-binding domain  26.67 
 
 
976 aa  63.5  0.000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.169992  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7321  AAA ATPase  40.85 
 
 
455 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0541267 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4526  hypothetical protein  46.58 
 
 
452 aa  60.8  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2487  hypothetical protein  30.63 
 
 
336 aa  59.3  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0753624  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3922  hypothetical protein  30 
 
 
440 aa  56.6  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.658608 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0733  hypothetical protein  35.14 
 
 
461 aa  56.2  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.987867  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1859  hypothetical protein  31.88 
 
 
464 aa  54.3  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0493  hypothetical protein  38.96 
 
 
532 aa  53.9  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068743  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2504  hypothetical protein  40.58 
 
 
176 aa  53.5  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1004  hypothetical protein  40 
 
 
567 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0319616 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0524  hypothetical protein  35.71 
 
 
251 aa  51.2  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2264  hypothetical protein  36.62 
 
 
457 aa  50.8  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402442  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3577  hypothetical protein  34.12 
 
 
458 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.292222 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3405  ATP-binding protein  33.06 
 
 
454 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00177365  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1513  hypothetical protein  36.25 
 
 
444 aa  48.5  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1735  AAA ATPase  38.16 
 
 
484 aa  47.8  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.331613 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49480  hypothetical protein  32 
 
 
595 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000071972  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0029  ABC transporter ATP-binding protein  37.97 
 
 
431 aa  47  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1454  ATPase  38.46 
 
 
597 aa  46.6  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1601  ABC transporter related  38.03 
 
 
238 aa  46.6  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122919  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2959  hypothetical protein  35.8 
 
 
533 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3230  hypothetical protein  41.3 
 
 
451 aa  46.6  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4238  ABC transporter  30.77 
 
 
588 aa  45.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3524  hypothetical protein  27.93 
 
 
228 aa  45.8  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0111  hypothetical protein  39.39 
 
 
368 aa  45.1  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4743  hypothetical protein  40.74 
 
 
478 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00311034 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3955  AAA ATPase  31.3 
 
 
642 aa  45.1  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262295  hitchhiker  0.00100841 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3546  AAA ATPase  25.21 
 
 
573 aa  45.1  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0847793  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3044  ABC transporter related  30.11 
 
 
239 aa  44.3  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0211  ATPase  31.25 
 
 
586 aa  44.7  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0158049  hitchhiker  0.00000676149 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0509  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  39.44 
 
 
256 aa  43.9  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2422  hypothetical protein  35.56 
 
 
442 aa  43.9  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0732  hypothetical protein  43.64 
 
 
399 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.699164  normal  0.348353 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0446  ABC transporter related  37.31 
 
 
266 aa  43.1  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3137  ATPas  29.47 
 
 
449 aa  43.1  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2431  ABC transporter related  29.03 
 
 
246 aa  43.1  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000823093  decreased coverage  0.000192607 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>