More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1691 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_1691  tryptophan synthase subunit beta  100 
 
 
393 aa  808    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1864  tryptophan synthase subunit beta  65.98 
 
 
391 aa  532  1e-150  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2482  tryptophan synthase subunit beta  65.36 
 
 
396 aa  522  1e-147  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110786  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0925  tryptophan synthase subunit beta  65.97 
 
 
396 aa  521  1e-147  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.7410900000000002e-34 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1291  tryptophan synthase subunit beta  66.41 
 
 
397 aa  523  1e-147  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3321  tryptophan synthase subunit beta  65.19 
 
 
396 aa  520  1e-146  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000386703  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3288  tryptophan synthase subunit beta  64.32 
 
 
397 aa  510  1e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0755  tryptophan synthase subunit beta  62.56 
 
 
414 aa  506  9.999999999999999e-143  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1211  tryptophan synthase subunit beta  64.58 
 
 
396 aa  504  1e-141  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1186  tryptophan synthase subunit beta  61.6 
 
 
394 aa  500  1e-140  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00284462  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0245  tryptophan synthase subunit beta  61.76 
 
 
394 aa  500  1e-140  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02120  tryptophan synthase subunit beta  63.09 
 
 
406 aa  498  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  62.08 
 
 
409 aa  495  1e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0253  tryptophan synthase subunit beta  61.46 
 
 
396 aa  494  1e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.208201  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0038  tryptophan synthase subunit beta  63.35 
 
 
402 aa  496  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.206234  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0810  tryptophan synthase subunit beta  64.16 
 
 
389 aa  498  1e-139  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11310  tryptophan synthase subunit beta  62.11 
 
 
398 aa  495  1e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000215917  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0787  tryptophan synthase subunit beta  64.16 
 
 
389 aa  498  1e-139  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3062  tryptophan synthase subunit beta  62.76 
 
 
403 aa  498  1e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00450  tryptophan synthase subunit beta  62.83 
 
 
402 aa  497  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.236429 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0328  tryptophan synthase subunit beta  62.02 
 
 
394 aa  497  1e-139  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1656  tryptophan synthase subunit beta  60.98 
 
 
394 aa  496  1e-139  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.483015  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1983  tryptophan synthase subunit beta  61.82 
 
 
403 aa  492  9.999999999999999e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00755336 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0071  tryptophan synthase subunit beta  61.18 
 
 
411 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1757  tryptophan synthase subunit beta  64.68 
 
 
402 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000013956  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  61.52 
 
 
409 aa  491  9.999999999999999e-139  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0113  tryptophan synthase subunit beta  63.09 
 
 
399 aa  492  9.999999999999999e-139  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2137  tryptophan synthase subunit beta  62.08 
 
 
397 aa  492  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22591  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0591  tryptophan synthase subunit beta  61.24 
 
 
394 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.283769  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1813  tryptophan synthase subunit beta  61.82 
 
 
397 aa  491  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1487  tryptophan synthase subunit beta  61.78 
 
 
399 aa  488  1e-137  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0083  tryptophan synthase subunit beta  62.3 
 
 
405 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0017562 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0101  tryptophan synthase subunit beta  62.04 
 
 
405 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.500434  hitchhiker  0.000655179 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4374  tryptophan synthase subunit beta  62.24 
 
 
397 aa  489  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0098  tryptophan synthase subunit beta  62.3 
 
 
405 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0098  tryptophan synthase subunit beta  62.3 
 
 
405 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000284084 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1257  tryptophan synthase beta chain  61.52 
 
 
399 aa  488  1e-137  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0839  tryptophan synthase, beta subunit  62.7 
 
 
401 aa  491  1e-137  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2069  tryptophan synthase subunit beta  60.52 
 
 
399 aa  486  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.166636  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1914  tryptophan synthase subunit beta  62.04 
 
 
399 aa  487  1e-136  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.148244  normal  0.536089 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0103  tryptophan synthase subunit beta  61.78 
 
 
410 aa  486  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1328  tryptophan synthase subunit beta  62.73 
 
 
404 aa  487  1e-136  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.000691779  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1668  tryptophan synthase subunit beta  60.89 
 
 
404 aa  487  1e-136  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000103564  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0679  tryptophan synthase subunit beta  61.76 
 
 
397 aa  484  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.614528  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1334  tryptophan synthase, beta subunit  58.59 
 
 
402 aa  485  1e-136  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.999699  normal  0.825059 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2881  tryptophan synthase subunit beta  62.76 
 
 
397 aa  486  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0438165  normal  0.707316 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1277  tryptophan synthase subunit beta  61.78 
 
 
399 aa  486  1e-136  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1727  tryptophan synthase subunit beta  60.52 
 
 
399 aa  486  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.476833  hitchhiker  0.00551797 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1208  tryptophan synthase subunit beta  61.34 
 
 
393 aa  486  1e-136  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3853  tryptophan synthase subunit beta  61.46 
 
 
397 aa  484  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3348  tryptophan synthase subunit beta  61.46 
 
 
397 aa  485  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0451347  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2726  tryptophan synthase subunit beta  62.2 
 
 
409 aa  486  1e-136  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.521455  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2307  tryptophan synthase subunit beta  60.98 
 
 
397 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2495  tryptophan synthase subunit beta  59.95 
 
 
405 aa  484  1e-135  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0158  tryptophan synthase, beta subunit  61.26 
 
 
409 aa  481  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.994719  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0769  tryptophan synthase subunit beta  60.98 
 
 
397 aa  482  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2125  tryptophan synthase subunit beta  61.24 
 
 
397 aa  483  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  decreased coverage  0.00480263 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6842  tryptophan synthase subunit beta  61.98 
 
 
397 aa  482  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.726467  normal  0.411948 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0666  tryptophan synthase subunit beta  61.44 
 
 
406 aa  484  1e-135  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4622  tryptophan synthase subunit beta  60.98 
 
 
397 aa  483  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227508  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1858  tryptophan synthase subunit beta  60.98 
 
 
397 aa  480  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.308005  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0529  tryptophan synthase subunit beta  60.98 
 
 
397 aa  480  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1135  tryptophan synthase subunit beta  62.04 
 
 
397 aa  478  1e-134  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1721  tryptophan synthase subunit beta  60.98 
 
 
397 aa  480  1e-134  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0034  tryptophan synthase subunit beta  60.47 
 
 
409 aa  478  1e-134  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2128  tryptophan synthase, beta subunit  60.42 
 
 
394 aa  479  1e-134  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1649  tryptophan synthase subunit beta  60.98 
 
 
397 aa  480  1e-134  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0803  tryptophan synthase subunit beta  60 
 
 
401 aa  478  1e-134  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.118728  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3954  tryptophan synthase subunit beta  60.78 
 
 
406 aa  478  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.291144  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2467  tryptophan synthase subunit beta  60.94 
 
 
407 aa  479  1e-134  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.379928 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3570  tryptophan synthase subunit beta  60.98 
 
 
397 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266435  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4409  tryptophan synthase subunit beta  60.98 
 
 
397 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1159  tryptophan synthase subunit beta  59.79 
 
 
418 aa  479  1e-134  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.445238  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3958  tryptophan synthase subunit beta  60.98 
 
 
397 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1296  tryptophan synthase subunit beta  61.78 
 
 
397 aa  478  1e-134  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1398  tryptophan synthase subunit beta  61.78 
 
 
397 aa  478  1e-134  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.369323  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2042  tryptophan synthase subunit beta  61.46 
 
 
403 aa  481  1e-134  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.104617  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2445  tryptophan synthase subunit beta  60.98 
 
 
397 aa  480  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.844513  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1149  tryptophan synthase subunit beta  61.78 
 
 
397 aa  480  1e-134  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1361  tryptophan synthase subunit beta  61.26 
 
 
397 aa  476  1e-133  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3237  tryptophan synthase subunit beta  60.99 
 
 
406 aa  476  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1161  tryptophan synthase subunit beta  61.78 
 
 
397 aa  478  1e-133  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1141  tryptophan synthase subunit beta  61.78 
 
 
397 aa  478  1e-133  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1268  tryptophan synthase subunit beta  60.99 
 
 
399 aa  475  1e-133  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1157  tryptophan synthase subunit beta  62.5 
 
 
395 aa  477  1e-133  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0870  tryptophan synthase subunit beta  61.2 
 
 
399 aa  475  1e-133  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00318108 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1412  tryptophan synthase subunit beta  60.89 
 
 
394 aa  475  1e-133  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00140909  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2306  tryptophan synthase subunit beta  60.68 
 
 
397 aa  476  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1253  tryptophan synthase subunit beta  61.78 
 
 
397 aa  478  1e-133  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4281  tryptophan synthase subunit beta  59.69 
 
 
406 aa  476  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.486908  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3427  tryptophan synthase subunit beta  59.95 
 
 
408 aa  476  1e-133  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.76011  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4373  tryptophan synthase subunit beta  60.72 
 
 
399 aa  475  1e-133  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0020  tryptophan synthase subunit beta  60 
 
 
406 aa  475  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1064  tryptophan synthase subunit beta  60.98 
 
 
410 aa  476  1e-133  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1049  tryptophan synthase subunit beta  59.9 
 
 
397 aa  477  1e-133  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.548234 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1074  tryptophan synthase subunit beta  59.13 
 
 
425 aa  475  1e-133  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.32093  normal  0.660313 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01811  tryptophan synthase subunit beta  60.26 
 
 
416 aa  476  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0720607  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1558  tryptophan synthase subunit beta  58.96 
 
 
406 aa  475  1e-133  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1120  tryptophan synthase subunit beta  60.88 
 
 
389 aa  475  1e-133  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4048  tryptophan synthase subunit beta  61.52 
 
 
397 aa  476  1e-133  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>