More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4372 on replicon NC_008538
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008538  Arth_4372  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
317 aa  656    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2811  oxidoreductase-like  73.48 
 
 
314 aa  480  1e-134  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.116586  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4444  oxidoreductase domain-containing protein  70.48 
 
 
319 aa  457  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.122065  normal  0.178322 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0981  oxidoreductase-like  69.5 
 
 
319 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.46004  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3638  oxidoreductase domain-containing protein  70.03 
 
 
318 aa  456  1e-127  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0871  oxidoreductase-like  68.87 
 
 
319 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.635047 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5184  oxidoreductase domain protein  69.18 
 
 
319 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2703  4-carboxy-2-hydroxymuconate-6-semialdehyde dehydrogenase  68.55 
 
 
319 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0171  oxidoreductase domain-containing protein  68.77 
 
 
317 aa  448  1e-125  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.111791  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3884  oxidoreductase-like  68.05 
 
 
312 aa  444  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0329  oxidoreductase-like  67.19 
 
 
318 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2026  oxidoreductase domain-containing protein  66.67 
 
 
320 aa  439  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3923  oxidoreductase domain-containing protein  62.62 
 
 
315 aa  410  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.361825  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3203  oxidoreductase domain-containing protein  52.37 
 
 
315 aa  345  6e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0286  oxidoreductase-like protein  43.89 
 
 
312 aa  258  1e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.150132  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4111  oxidoreductase-like  27.02 
 
 
360 aa  91.3  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.740502 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  34.01 
 
 
337 aa  91.7  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  26.95 
 
 
347 aa  89  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  28.13 
 
 
326 aa  88.6  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  25.82 
 
 
358 aa  86.7  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  31.47 
 
 
359 aa  86.3  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  31.47 
 
 
359 aa  86.3  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3282  oxidoreductase domain-containing protein  40.41 
 
 
342 aa  85.9  7e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120981 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  34.93 
 
 
362 aa  85.9  7e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  30.41 
 
 
381 aa  85.1  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  33.1 
 
 
356 aa  85.1  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  32.34 
 
 
353 aa  85.1  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  35.42 
 
 
370 aa  82.4  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4139  oxidoreductase-like  28.23 
 
 
357 aa  82  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162598  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  35.42 
 
 
370 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2218  oxidoreductase-like  36.11 
 
 
330 aa  80.5  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404661  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4098  oxidoreductase domain protein  35.1 
 
 
373 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  28.66 
 
 
349 aa  79.3  0.00000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4715  oxidoreductase domain protein  26.55 
 
 
352 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0294  myo-inositol 2-dehydrogenase  31.25 
 
 
350 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0803  oxidoreductase domain protein  39.01 
 
 
337 aa  77.8  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0126496 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2763  oxidoreductase domain protein  28.89 
 
 
395 aa  76.6  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.403107  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4696  oxidoreductase domain protein  26.27 
 
 
348 aa  76.3  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.928345 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1649  oxidoreductase domain protein  31.38 
 
 
388 aa  76.3  0.0000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.58008  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3468  oxidoreductase domain protein  23.98 
 
 
345 aa  76.3  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1300  WblB protein  27.06 
 
 
363 aa  75.9  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.984195  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  29.23 
 
 
381 aa  75.9  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  35.25 
 
 
313 aa  75.1  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  24.08 
 
 
329 aa  75.5  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  34.51 
 
 
337 aa  75.5  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5698  Inositol 2-dehydrogenase  31.93 
 
 
342 aa  75.5  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  36.07 
 
 
358 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1024  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  33.57 
 
 
317 aa  74.3  0.000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0401721  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3081  oxidoreductase domain protein  34.59 
 
 
356 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  37.68 
 
 
386 aa  74.3  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6514  oxidoreductase domain protein  26.23 
 
 
364 aa  74.3  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.519908  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3039  oxidoreductase domain protein  34.59 
 
 
356 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 
359 aa  73.9  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  27.99 
 
 
349 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2700  oxidoreductase domain protein  30.07 
 
 
362 aa  73.6  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.832188  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  31.65 
 
 
340 aa  73.6  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  30.28 
 
 
347 aa  73.2  0.000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  31.58 
 
 
364 aa  73.2  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  30.28 
 
 
359 aa  73.2  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6101  oxidoreductase domain protein  25.82 
 
 
365 aa  72.8  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0492878  normal  0.588599 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1672  putative oxidoreductase  32.45 
 
 
333 aa  72.8  0.000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2945  oxidoreductase domain-containing protein  24.37 
 
 
348 aa  72.8  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.196748  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3167  oxidoreductase domain protein  27.24 
 
 
386 aa  72.8  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0755  homoserine dehydrogenase, NAD-binding  29.41 
 
 
329 aa  72.8  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0316  oxidoreductase domain-containing protein  37.78 
 
 
312 aa  72.4  0.000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  23.1 
 
 
366 aa  72.4  0.000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2641  myo-inositol dehydrogenase  31.18 
 
 
345 aa  72  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.235114  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2927  putative dehydrogenase  27.27 
 
 
337 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311728  hitchhiker  0.00000297483 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  28.5 
 
 
359 aa  72.4  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4617  oxidoreductase domain protein  37.5 
 
 
397 aa  72  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4717  oxidoreductase domain-containing protein  38.46 
 
 
360 aa  72.4  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.113453  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  26.26 
 
 
345 aa  72.4  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2263  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.67 
 
 
310 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3283  inositol 2-dehydrogenase  23.64 
 
 
331 aa  71.2  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00244107 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3255  oxidoreductase domain protein  26.81 
 
 
350 aa  71.2  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2363  oxidoreductase-like  39.06 
 
 
354 aa  70.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000565136  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  26.97 
 
 
344 aa  71.2  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7457  hypothetical protein  26.67 
 
 
358 aa  70.9  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  27.32 
 
 
377 aa  71.2  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0088  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.37 
 
 
349 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  24 
 
 
331 aa  71.2  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0117  oxidoreductase domain protein  30.46 
 
 
398 aa  70.9  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14101  hypothetical protein  26.19 
 
 
370 aa  71.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0437  oxidoreductase domain protein  29.21 
 
 
441 aa  71.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.116301  normal  0.584964 
 
 
-
 
NC_004310  BR1602  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.86 
 
 
318 aa  70.5  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3414  putative oxidoreductase YgjR  34.17 
 
 
344 aa  70.5  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  34.53 
 
 
312 aa  70.9  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0307  oxidoreductase domain protein  24.56 
 
 
351 aa  70.9  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1665  oxidoreductase  26.84 
 
 
371 aa  70.9  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.351306 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4425  oxidoreductase domain protein  26.51 
 
 
355 aa  70.9  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00532668  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1809  oxidoreductase domain-containing protein  29.93 
 
 
324 aa  70.9  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.598739  normal  0.127398 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3411  putative oxidoreductase YgjR  34.17 
 
 
344 aa  70.5  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2329  inositol 2-dehydrogenase  25.16 
 
 
330 aa  70.5  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0878  oxidoreductase domain-containing protein  29.76 
 
 
310 aa  70.9  0.00000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2218  oxidoreductase domain-containing protein  32.64 
 
 
337 aa  70.5  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  26.07 
 
 
353 aa  69.7  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4428  oxidoreductase domain protein  28.26 
 
 
333 aa  69.7  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.101922  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0702  oxidoreductase domain protein  36.36 
 
 
359 aa  69.3  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.519642 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3328  oxidoreductase domain-containing protein  39.39 
 
 
359 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686493  normal  0.496755 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3580  putative oxidoreductase YgjR  34.48 
 
 
332 aa  69.3  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0908777 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>