More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4066 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_4066  dihydropyrimidinase  100 
 
 		 479 aa  978    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2099  phenylhydantoinase  35.96 
 
 		 463 aa  253  5.000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0317322  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4055  phenylhydantoinase  33.12 
 
 		 480 aa  243  7e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6385  D-hydantoinase  34.84 
 
 		 475 aa  239  9e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6618  dihydropyrimidinase  34.84 
 
 		 475 aa  239  9e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6216  dihydropyrimidinase  34.84 
 
 		 475 aa  239  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1802  phenylhydantoinase  34.06 
 
 		 496 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0952934  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0686  dihydropyrimidinase  33.84 
 
 		 469 aa  237  3e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000587372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3441  phenylhydantoinase  32.61 
 
 		 479 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546969  normal  0.472139 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3638  phenylhydantoinase  33.04 
 
 		 479 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4250  phenylhydantoinase  34.06 
 
 		 473 aa  234  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.58345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4021  phenylhydantoinase  32.56 
 
 		 481 aa  233  5e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0045  phenylhydantoinase  33.76 
 
 		 473 aa  232  9e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1836  phenylhydantoinase  33.62 
 
 		 479 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.682514  normal  0.127421 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2182  dihydropyrimidinase  34.77 
 
 		 478 aa  230  3e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.140965 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4135  phenylhydantoinase  33.41 
 
 		 471 aa  228  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4022  phenylhydantoinase  33.41 
 
 		 471 aa  228  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1684  dihydropyrimidinase  31.96 
 
 		 464 aa  226  6e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0543  phenylhydantoinase  32.32 
 
 		 499 aa  226  7e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4277  phenylhydantoinase  34.4 
 
 		 475 aa  226  9e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1997  dihydropyrimidinase  32.17 
 
 		 454 aa  225  2e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24200  dihydropyrimidinase  31.98 
 
 		 471 aa  224  3e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4992  phenylhydantoinase  31.91 
 
 		 471 aa  223  4e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.543154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0969  phenylhydantoinase  33.47 
 
 		 486 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3445  dihydropyrimidinase  30.63 
 
 		 460 aa  223  6e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00364742  normal  0.12901 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4149  phenylhydantoinase  34.75 
 
 		 483 aa  223  6e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.435965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3462  dihydropyrimidinase  32.29 
 
 		 485 aa  223  7e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3886  phenylhydantoinase  32.68 
 
 		 472 aa  223  7e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05770  phenylhydantoinase  32.1 
 
 		 479 aa  223  8e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0725  dihydropyrimidinase  34.56 
 
 		 484 aa  223  8e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5601  dihydropyrimidinase  34.97 
 
 		 484 aa  222  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1370  phenylhydantoinase  30.48 
 
 		 483 aa  220  3e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.596955 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0227  phenylhydantoinase  34.24 
 
 		 475 aa  220  5e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0770073  normal  0.255137 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3107  dihydropyrimidinase  32.08 
 
 		 485 aa  220  5e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0154348  normal  0.387617 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0551  phenylhydantoinase  34.39 
 
 		 478 aa  219  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.6357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3293  phenylhydantoinase  29.82 
 
 		 484 aa  218  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349462  normal  0.101645 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0430  dihydropyrimidinase  33.33 
 
 		 461 aa  217  4e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5170  dihydropyrimidinase  32.75 
 
 		 469 aa  216  5e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3038  phenylhydantoinase  29.39 
 
 		 484 aa  216  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6029  phenylhydantoinase  31.34 
 
 		 485 aa  216  8e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2067  dihydropyrimidinase  32.4 
 
 		 485 aa  216  9e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.265667 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6542  phenylhydantoinase  31.32 
 
 		 467 aa  216  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.517189 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2367  phenylhydantoinase  30.5 
 
 		 484 aa  215  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.040332  normal  0.334928 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3033  phenylhydantoinase  31.51 
 
 		 461 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2746  phenylhydantoinase  34.35 
 
 		 475 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0046  phenylhydantoinase  32.91 
 
 		 481 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1635  dihydropyrimidinase  33.83 
 
 		 467 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1432  dihydropyrimidinase  31.97 
 
 		 472 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.897343  normal  0.495511 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02706  dihydropyrimidinase  31.29 
 
 		 461 aa  213  7e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02668  hypothetical protein  31.29 
 
 		 461 aa  213  7e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3198  phenylhydantoinase  31.29 
 
 		 461 aa  213  7e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3006  phenylhydantoinase  31.29 
 
 		 465 aa  213  7e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4163  phenylhydantoinase  31.29 
 
 		 465 aa  213  7e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0835  phenylhydantoinase  31.29 
 
 		 461 aa  213  7e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0819  dihydropyrimidinase  31.29 
 
 		 461 aa  213  7.999999999999999e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5687  dihydropyrimidinase  31.32 
 
 		 477 aa  213  7.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0293921  normal  0.131902 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0331  dihydropyrimidinase  31.39 
 
 		 479 aa  213  7.999999999999999e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1496  phenylhydantoinase  29.61 
 
 		 457 aa  213  9e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0278  phenylhydantoinase  29.67 
 
 		 489 aa  212  1e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0219  dihydropyrimidinase  33.84 
 
 		 467 aa  212  1e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0292  phenylhydantoinase  29.67 
 
 		 489 aa  212  1e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0183  phenylhydantoinase  29.72 
 
 		 501 aa  211  3e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.278441  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0931  dihydropyrimidinase  33.48 
 
 		 464 aa  211  3e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.303478 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1532  phenylhydantoinase  33.41 
 
 		 483 aa  210  4e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0729883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2864  phenylhydantoinase  32.76 
 
 		 486 aa  210  4e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2983  dihydropyrimidinase  31.81 
 
 		 477 aa  209  8e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1816  phenylhydantoinase  29.54 
 
 		 483 aa  209  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.168058  normal  0.23209 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2578  phenylhydantoinase  30.53 
 
 		 478 aa  209  1e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2687  phenylhydantoinase  31.96 
 
 		 483 aa  207  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3941  phenylhydantoinase  33.62 
 
 		 475 aa  208  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.309638  normal  0.168213 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2960  dihydropyrimidinase  29.46 
 
 		 474 aa  207  4e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1431  phenylhydantoinase  31.89 
 
 		 483 aa  206  5e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.985179 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1462  phenylhydantoinase  28.79 
 
 		 483 aa  206  9e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2214  phenylhydantoinase  30.4 
 
 		 472 aa  205  1e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4616  phenylhydantoinase  32.52 
 
 		 466 aa  206  1e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2108  dihydropyrimidinase  31.69 
 
 		 489 aa  204  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7926  phenylhydantoinase  31.18 
 
 		 474 aa  205  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245265  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0357  dihydropyrimidinase  31.98 
 
 		 457 aa  203  6e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.990091  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6658  phenylhydantoinase  32.04 
 
 		 485 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351281  normal  0.0552817 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6714  phenylhydantoinase  31.24 
 
 		 485 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5719  phenylhydantoinase  31.45 
 
 		 485 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.721044  normal  0.376698 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1593  phenylhydantoinase  31.24 
 
 		 485 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.514633  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5963  phenylhydantoinase  31.45 
 
 		 485 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417247  normal  0.398194 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6238  phenylhydantoinase  31.24 
 
 		 485 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.602815  normal  0.158251 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3457  phenylhydantoinase  27.23 
 
 		 484 aa  201  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5353  phenylhydantoinase  31.68 
 
 		 485 aa  201  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.160093 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1497  phenylhydantoinase  28.23 
 
 		 484 aa  201  3e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.204674  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0839  dihydropyrimidinase  31.39 
 
 		 473 aa  200  5e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276755  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0244  dihydropyrimidinase  30.23 
 
 		 451 aa  199  1.0000000000000001e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.20857  normal  0.276303 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1112  phenylhydantoinase  30.2 
 
 		 489 aa  199  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.728125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0347  phenylhydantoinase  28.79 
 
 		 484 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2106  dihydropyrimidinase  30.18 
 
 		 459 aa  196  6e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.645482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1888  dihydropyrimidinase  30.18 
 
 		 459 aa  196  7e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.150297  normal  0.174622 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01823  conserved hypothetical protein  31.03 
 
 		 489 aa  196  9e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1730  dihydropyrimidinase  28.95 
 
 		 451 aa  195  1e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0261  dihydropyrimidinase  28.21 
 
 		 474 aa  195  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4267  phenylhydantoinase  33.76 
 
 		 472 aa  195  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.475429  normal  0.313669 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2664  phenylhydantoinase  28.63 
 
 		 485 aa  193  5e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2543  dihydropyrimidinase  32.36 
 
 		 503 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.65839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1488  dihydropyrimidinase  33.56 
 
 		 460 aa  189  8e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.366627  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>