162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2197 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2197  hypothetical protein  100 
 
 
243 aa  486  1e-136  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.123697  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1938  hypothetical protein  58.22 
 
 
232 aa  241  9e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000329837 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04540  hypothetical protein  55.45 
 
 
237 aa  224  8e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2808  hypothetical protein  59.03 
 
 
248 aa  223  3e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0677099  normal  0.911187 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18910  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  52.65 
 
 
268 aa  205  5e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.07476  normal  0.315555 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1026  Methyltransferase type 11  29.7 
 
 
235 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3234  Methyltransferase type 11  29.21 
 
 
235 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18721  hypothetical protein  30 
 
 
239 aa  79  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.377095 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3795  SAM-dependent methyltransferase  25 
 
 
230 aa  75.5  0.0000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.200041 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3186  Methyltransferase type 12  26.85 
 
 
245 aa  71.6  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.458893  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3807  methyltransferase type 12  25.24 
 
 
237 aa  71.2  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5034  Methyltransferase type 12  27.65 
 
 
237 aa  71.2  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.244151 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1341  hypothetical protein  30.1 
 
 
238 aa  70.9  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10913  hypothetical protein  22.71 
 
 
236 aa  70.1  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127289  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0419  hypothetical protein  27.49 
 
 
230 aa  65.1  0.0000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.271566 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4711  methyltransferase type 12  33.71 
 
 
217 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0254  methyltransferase type 11  25.88 
 
 
230 aa  62.8  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.753586 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2113  Methyltransferase type 12  31.31 
 
 
240 aa  61.6  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.294106  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1187  methyltransferase type 12  29.66 
 
 
236 aa  60.8  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.683233 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2036  Methyltransferase type 12  24.19 
 
 
231 aa  58.5  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.916897  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1686  SAM-dependent methyltransferase  20.8 
 
 
263 aa  55.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0634865 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2534  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  24.68 
 
 
241 aa  54.7  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.115173 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0252  hypothetical protein  29.14 
 
 
301 aa  54.3  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1603  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  31.45 
 
 
251 aa  52.8  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.905646  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3086  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  31.82 
 
 
247 aa  52.4  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0869216  normal  0.516357 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  28.74 
 
 
194 aa  52.4  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1175  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.54 
 
 
247 aa  51.6  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.125464  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2837  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.54 
 
 
247 aa  52  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2768  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.67 
 
 
247 aa  51.6  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6087  Methyltransferase type 12  38.1 
 
 
263 aa  50.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2534  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.48 
 
 
254 aa  50.8  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1796  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.19 
 
 
316 aa  51.2  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.508174  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9984  predicted protein  32.59 
 
 
249 aa  50.1  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0507609  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1199  hypothetical protein  29.73 
 
 
223 aa  50.1  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.105724  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2728  SAM-dependent methyltransferase  20.63 
 
 
252 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1982  Methyltransferase type 12  27.7 
 
 
311 aa  49.3  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0266324  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2130  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.26 
 
 
241 aa  48.9  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.874721 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00659  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1,4- benzoquinol methylase  29.27 
 
 
250 aa  48.9  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3896  Methyltransferase type 11  26.36 
 
 
175 aa  48.9  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2906  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.13 
 
 
247 aa  48.9  0.00008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0391  methyltransferase type 11  34.15 
 
 
278 aa  48.5  0.00008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4744  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  31.71 
 
 
249 aa  48.9  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.752989  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0442  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.58 
 
 
277 aa  48.5  0.00009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0910  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32 
 
 
247 aa  48.1  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4275  methyltransferase type 11  38.14 
 
 
251 aa  48.5  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3527  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.63 
 
 
252 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.204476  normal  0.816598 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0742  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.39 
 
 
249 aa  47.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.170942  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2462  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.38 
 
 
237 aa  47.4  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.331199 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3306  Methyltransferase type 11  37.63 
 
 
249 aa  47.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1398  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.38 
 
 
237 aa  47.4  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0350  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.33 
 
 
391 aa  46.6  0.0003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.19303  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  27.94 
 
 
258 aa  46.6  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0942  Methyltransferase type 11  36.56 
 
 
249 aa  47  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000927283 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0492  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.85 
 
 
428 aa  47  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2559  methyltransferase type 11  31.63 
 
 
228 aa  47  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  24.81 
 
 
263 aa  47  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1352  hypothetical protein  24.06 
 
 
206 aa  46.6  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2879  transcriptional regulator, ArsR family  30.14 
 
 
341 aa  47  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22791  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1459  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
250 aa  46.6  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2186  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.06 
 
 
239 aa  46.2  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0852291  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0108  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  30.72 
 
 
249 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2589  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.58 
 
 
262 aa  46.6  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.672659 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0681  Methyltransferase type 11  25 
 
 
243 aa  46.6  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1197  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.71 
 
 
277 aa  46.2  0.0004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44851  predicted protein  37.04 
 
 
249 aa  46.2  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1267  MCP methyltransferase, CheR-type  30.49 
 
 
274 aa  46.2  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1576  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.52 
 
 
229 aa  46.2  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0819441  unclonable  0.000000165496 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1038  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  31.13 
 
 
244 aa  46.2  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1719  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.6 
 
 
234 aa  46.2  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.815395  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2926  transcriptional regulator ArsR family  31.11 
 
 
341 aa  46.2  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3819  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.83 
 
 
248 aa  45.8  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3550  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.46 
 
 
248 aa  45.8  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2011  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  29.38 
 
 
253 aa  45.8  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.3567 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0726  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.86 
 
 
242 aa  45.4  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643352  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0502  Methyltransferase type 12  24.62 
 
 
299 aa  45.4  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.510695 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6874  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
260 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.413969  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0134  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  29.6 
 
 
253 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.200688  normal  0.270855 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1317  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  31.71 
 
 
229 aa  45.8  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124117  hitchhiker  3.42912e-24 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0934  methyltransferase type 12  36.71 
 
 
228 aa  45.4  0.0009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2494  hypothetical protein  22.94 
 
 
194 aa  45.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00130351  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  38.54 
 
 
296 aa  44.7  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2619  transcriptional regulator, ArsR family  29.45 
 
 
341 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38929  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1088  Methyltransferase type 11  34.29 
 
 
251 aa  44.7  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0908  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase /2-octaprenyl-6-hydroxy phenol methylase  28.76 
 
 
260 aa  45.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1312  methyltransferase type 11  38.1 
 
 
257 aa  45.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.728077  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4895  methyltransferase type 11  30.97 
 
 
242 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00265389 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0549  hypothetical protein  27.88 
 
 
226 aa  43.9  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1872  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.67 
 
 
248 aa  43.9  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.466783  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0342  Methyltransferase type 11  25.51 
 
 
252 aa  44.3  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1561  Methyltransferase type 11  38.1 
 
 
283 aa  43.9  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0194  UbiE/COQ5 methyltransferase  25 
 
 
253 aa  44.3  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.920302  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2150  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.26 
 
 
236 aa  44.3  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1306  hypothetical protein  24.16 
 
 
297 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.782095 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0491  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  31.71 
 
 
229 aa  43.9  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372241  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15760  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.97 
 
 
232 aa  43.9  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2117  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.42 
 
 
262 aa  43.9  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
285 aa  44.3  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4499  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  27.91 
 
 
266 aa  44.3  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000152328 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4141  methyltransferase type 11  31.88 
 
 
273 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.160628 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2577  Methyltransferase type 11  28.44 
 
 
227 aa  43.9  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>