126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0824 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0824  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 		 303 aa  629  1e-179  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0941  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  96.04 
 
 		 303 aa  608  1e-173  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0386  xylose isomerase domain-containing protein  54.36 
 
 		 306 aa  358  6e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4055  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  56.7 
 
 		 297 aa  354  7.999999999999999e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1981  Myo-inosose-2 dehydratase  53.74 
 
 		 301 aa  349  3e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.162742  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2746  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  51.71 
 
 		 330 aa  327  1.0000000000000001e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.717662  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0657  Myo-inosose-2 dehydratase  49.32 
 
 		 303 aa  313  2.9999999999999996e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.700284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2490  xylose isomerase domain-containing protein  47.46 
 
 		 303 aa  299  4e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279776  normal  0.973607 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0730  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  42.86 
 
 		 295 aa  267  2e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.200556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7455  hypothetical protein  34.24 
 
 		 292 aa  184  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.652021  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3346  xylose isomerase-like TIM barrel  33.56 
 
 		 297 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0217845  normal  0.180586 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1422  xylose isomerase-like  31.86 
 
 		 297 aa  151  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0452084  normal  0.457038 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1048  Myo-inosose-2 dehydratase  30.52 
 
 		 307 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.513171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1271  xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.74 
 
 		 298 aa  141  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.713181 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50250  hypothetical protein  30.26 
 
 		 307 aa  134  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.508803  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1309  xylose isomerase domain-containing protein  27.6 
 
 		 308 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1521  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.35 
 
 		 294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4573  xylose isomerase-like TIM barrel  27.78 
 
 		 308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1348  xylose isomerase domain-containing protein  27.6 
 
 		 308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1247  putative myo-inositol catabolism protein  27.74 
 
 		 313 aa  126  6e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.537579  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3018  hypothetical protein  26.89 
 
 		 307 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.130345  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0947  xylose isomerase-like TIM barrel  26.56 
 
 		 308 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.348697  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1429  xylose isomerase domain-containing protein  26.56 
 
 		 308 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1407  xylose isomerase domain-containing protein  26.89 
 
 		 308 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.872133 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2054  xylose isomerase domain-containing protein  28.57 
 
 		 308 aa  124  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1886  xylose isomerase domain-containing protein  28.1 
 
 		 308 aa  122  9e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.206917 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1620  hypothetical protein  30.95 
 
 		 298 aa  122  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1615  hypothetical protein  30.61 
 
 		 298 aa  120  3.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1696  Myo-inosose-2 dehydratase  30.69 
 
 		 308 aa  119  4.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4190  xylose isomerase-like TIM barrel  31.99 
 
 		 371 aa  117  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.720259  hitchhiker  0.00898811 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0086  myo-inositol catabolism protein IolE  27.91 
 
 		 297 aa  104  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2612  xylose isomerase domain-containing protein  31.09 
 
 		 294 aa  100  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4013  Myo-inosose-2 dehydratase  26.71 
 
 		 297 aa  100  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1722  xylose isomerase-like TIM barrel  25.91 
 
 		 299 aa  100  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.688264  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4487  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.22 
 
 		 289 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.411638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2981  Myo-inosose-2 dehydratase  27.76 
 
 		 359 aa  93.6  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.833328 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3138  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.76 
 
 		 359 aa  93.6  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3352  Myo-inosose-2 dehydratase  26.19 
 
 		 296 aa  92.8  6e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0467219  normal  0.0568196 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3969  xylose isomerase domain-containing protein  28.62 
 
 		 290 aa  92  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0171269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1816  xylose isomerase domain-containing protein  28.29 
 
 		 304 aa  91.3  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.670883 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0303  myo-inositol catabolism protein  27.27 
 
 		 298 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2299  myo-inositol catabolism protein  27.45 
 
 		 298 aa  89.4  7e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2811  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.96 
 
 		 305 aa  88.6  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.279544  normal  0.182339 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4706  inosose dehydratase  25.85 
 
 		 301 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000727756  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8495  Myo-inosose-2 dehydratase  27.84 
 
 		 311 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.795487 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1596  xylose isomerase domain-containing protein  27.83 
 
 		 310 aa  87.8  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1362  Myo-inosose-2 dehydratase  27.54 
 
 		 294 aa  87.8  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2531  putative IolE protein  27.12 
 
 		 298 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.32551e-17 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3595  Myo-inosose-2 dehydratase  29.03 
 
 		 297 aa  87.8  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6852  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.47 
 
 		 284 aa  87.4  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0571066  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0043  xylose isomerase domain-containing protein  29.08 
 
 		 308 aa  86.7  5e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7800  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.24 
 
 		 301 aa  85.9  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2255  myo-inositol catabolism protein  26.71 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0939  xylose isomerase-like TIM barrel  26.41 
 
 		 309 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00907131  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1421  xylose isomerase domain-containing protein  26.41 
 
 		 309 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2932  xylose isomerase domain-containing protein  25.96 
 
 		 308 aa  84  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688703 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5694  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.36 
 
 		 300 aa  84  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.986609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0078  hypothetical protein  28.92 
 
 		 300 aa  83.2  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1399  xylose isomerase domain-containing protein  26.15 
 
 		 309 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1238  putative myo-inositol catabolism protein  25.35 
 
 		 309 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1324  putative myo-inositol catabolism LolE protein  25.26 
 
 		 308 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1301  xylose isomerase domain-containing protein  25.8 
 
 		 309 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5562  Myo-inosose-2 dehydratase  26.12 
 
 		 281 aa  81.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1340  xylose isomerase domain-containing protein  25.44 
 
 		 309 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0067  xylose isomerase domain-containing protein  26.86 
 
 		 318 aa  80.1  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0290166  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1342  Myo-inosose-2 dehydratase  27.15 
 
 		 296 aa  79.7  0.00000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3839  xylose isomerase domain-containing protein  27.53 
 
 		 300 aa  79  0.00000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4565  xylose isomerase-like TIM barrel  25.44 
 
 		 309 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0833957  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2336  hypothetical protein  30.12 
 
 		 237 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5448  Myo-inosose-2 dehydratase  27.24 
 
 		 295 aa  77.8  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.10992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0486  putative myo-inositol catabolism protein  24.52 
 
 		 297 aa  78.2  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425956  normal  0.198393 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1894  xylose isomerase domain-containing protein  25.44 
 
 		 309 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.21993 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2995  Myo-inosose-2 dehydratase  27.15 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4213  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.74 
 
 		 340 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0986  xylose isomerase domain-containing protein  29.02 
 
 		 273 aa  75.5  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1602  xylose isomerase domain-containing protein  24.35 
 
 		 306 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.334485  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3333  Myo-inosose-2 dehydratase  26.03 
 
 		 296 aa  73.6  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5989  xylose isomerase domain-containing protein  24.92 
 
 		 312 aa  72  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63499  normal  0.171061 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1346  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.97 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3316  xylose isomerase domain-containing protein  25.44 
 
 		 309 aa  70.9  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4656  xylose isomerase domain-containing protein  23.41 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2414  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.21 
 
 		 924 aa  70.1  0.00000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3079  Myo-inosose-2 dehydratase  25 
 
 		 287 aa  69.7  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.977094  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0911  hypothetical protein  24.63 
 
 		 306 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1442  AP endonuclease  24.63 
 
 		 306 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.609184  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0438  hypothetical protein  24.63 
 
 		 306 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1653  AP endonuclease  24.63 
 
 		 306 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.959785  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0724  AP endonuclease  24.63 
 
 		 306 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.367793  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1829  hypothetical protein  24.63 
 
 		 306 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0766527  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1675  AP endonuclease  24.63 
 
 		 306 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.173299  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2835  xylose isomerase domain-containing protein  26.43 
 
 		 310 aa  65.1  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.840707  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50050  2-keto-myo-inositol dehydratase  23.08 
 
 		 303 aa  65.5  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.602375  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0715  hypothetical protein  25 
 
 		 300 aa  63.9  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2649  hypothetical protein  24.63 
 
 		 306 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0432409  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0671  hypothetical protein  25 
 
 		 300 aa  63.9  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3273  AP endonuclease  22.84 
 
 		 301 aa  62  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0853475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3285  sugar phosphate isomerase/epimerase, IolE  29.36 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4017  xylose isomerase domain-containing protein  23.9 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3499  iolE protein  22.15 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1674  xylose isomerase domain-containing protein  26.18 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>