More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0242 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0242  ABC transporter related  100 
 
 
377 aa  775    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1925  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  75.27 
 
 
377 aa  595  1e-169  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0474  ABC-type sugar transport system, ATPase component  72.61 
 
 
378 aa  575  1.0000000000000001e-163  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0218  ABC-type sugar transport system, ATPase component  63.56 
 
 
367 aa  497  1e-139  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0122274  hitchhiker  0.000000441743 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1117  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  60.11 
 
 
366 aa  457  1e-127  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000190219  normal  0.407597 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4122  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  59.84 
 
 
366 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0138965  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  59.84 
 
 
366 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  59.57 
 
 
366 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  59.57 
 
 
366 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000074393  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1897  multiple sugar-binding transport ATP-binding protein  60.11 
 
 
367 aa  449  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105891  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  59.57 
 
 
366 aa  450  1e-125  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  59.57 
 
 
366 aa  450  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1632  multiple sugar-binding transport, ATP-binding protein  60.11 
 
 
367 aa  448  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  59.57 
 
 
366 aa  450  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4232  sugar ABC transporter ATP-binding protein  59.57 
 
 
366 aa  450  1e-125  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4035  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  59.57 
 
 
366 aa  450  1e-125  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  59.57 
 
 
366 aa  451  1e-125  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  59.84 
 
 
370 aa  448  1e-125  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2099  sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein UgpC  60.64 
 
 
367 aa  451  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0157125  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  57.98 
 
 
370 aa  436  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  56.73 
 
 
384 aa  425  1e-118  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  57.85 
 
 
370 aa  424  1e-117  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1651  ABC-type sugar transport system, ATPase component  54.38 
 
 
402 aa  419  1e-116  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1862  ABC transporter related protein  56.73 
 
 
370 aa  414  9.999999999999999e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  55.41 
 
 
374 aa  412  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  56.12 
 
 
369 aa  411  1e-114  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  55.85 
 
 
369 aa  409  1e-113  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  55.79 
 
 
370 aa  411  1e-113  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01295  putative sugar transport protein  56.12 
 
 
360 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.215586  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01306  hypothetical protein  56.12 
 
 
360 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.157147  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1529  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  56.65 
 
 
360 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1804  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  56.38 
 
 
360 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.438286  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2307  ABC transporter related  56.12 
 
 
360 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.384254  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  55.64 
 
 
372 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1433  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  55.85 
 
 
360 aa  403  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1963  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  56.12 
 
 
360 aa  404  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.70286 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0907  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  55.05 
 
 
375 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0858146  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2157  beta-phosphoglucomutase  55.32 
 
 
585 aa  400  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  54.09 
 
 
367 aa  397  1e-109  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  53.3 
 
 
369 aa  397  1e-109  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  56.2 
 
 
363 aa  396  1e-109  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  54.09 
 
 
367 aa  397  1e-109  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0198  ABC transporter related  55.38 
 
 
365 aa  395  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0274814  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0204  ABC transporter related  55.38 
 
 
365 aa  395  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  54.01 
 
 
370 aa  388  1e-106  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0120  ABC transporter related protein  54.69 
 
 
366 aa  385  1e-106  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  52.65 
 
 
380 aa  387  1e-106  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0259  ABC transporter related protein  54.69 
 
 
366 aa  385  1e-106  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1671  ABC transporter related  52.15 
 
 
373 aa  381  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0955  ABC transporter related  52.36 
 
 
365 aa  384  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.370442  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0496  ABC transporter related  50.13 
 
 
371 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0408811 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  53.52 
 
 
372 aa  382  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  52.24 
 
 
364 aa  383  1e-105  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1769  ABC transporter related  52.38 
 
 
366 aa  383  1e-105  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0692  ABC transporter related protein  52.23 
 
 
364 aa  378  1e-104  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0366  ABC transporter related protein  52.65 
 
 
364 aa  379  1e-104  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.173433  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4055  ABC transporter related protein  52.23 
 
 
364 aa  380  1e-104  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1059  ABC transporter related  54.79 
 
 
402 aa  377  1e-103  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649165  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1522  ABC transporter related protein  51.97 
 
 
364 aa  378  1e-103  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000622253  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  50.79 
 
 
367 aa  372  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  50.26 
 
 
367 aa  372  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  52.23 
 
 
367 aa  374  1e-102  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1671  ABC transporter related  52.24 
 
 
366 aa  369  1e-101  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2366  ABC transporter-like protein  52.76 
 
 
381 aa  371  1e-101  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1992  ABC transporter related  49.17 
 
 
426 aa  366  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  50 
 
 
368 aa  367  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0777  ABC transporter related  48.68 
 
 
367 aa  363  3e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540961  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1143  ABC transporter related  49.35 
 
 
376 aa  361  1e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.402141  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6524  ABC transporter related  49.87 
 
 
366 aa  360  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.113539 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0287  ABC transporter related protein  49.34 
 
 
371 aa  358  9e-98  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0901665  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0312  ABC transporter related  47.92 
 
 
363 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.982046  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0238  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.83 
 
 
363 aa  357  2.9999999999999997e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  48.28 
 
 
363 aa  355  7.999999999999999e-97  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2142  ABC transporter related  49.61 
 
 
365 aa  353  2e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0488971  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1240  ABC transporter related  50.27 
 
 
360 aa  353  2.9999999999999997e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1532  ABC transporter related protein  48.41 
 
 
404 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.427318  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2164  ABC transporter related  50.52 
 
 
392 aa  352  4e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2549  ABC transporter related  49.73 
 
 
366 aa  353  4e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.071435  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2907  ABC transporter related  50 
 
 
366 aa  352  7e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.147416  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6516  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.78 
 
 
406 aa  350  2e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.268585 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0231  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.3 
 
 
363 aa  350  3e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3994  ABC transporter related  47.65 
 
 
405 aa  348  6e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.73747  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3980  ABC transporter related  47.65 
 
 
405 aa  348  7e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4054  ABC transporter related  47.65 
 
 
405 aa  348  7e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.955986 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11263  sugar-transport ATP-binding protein ABC transporter sugC  47.78 
 
 
393 aa  348  8e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00178586 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3866  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.41 
 
 
356 aa  348  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3745  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.41 
 
 
356 aa  347  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.387597  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0237  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.14 
 
 
357 aa  347  2e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.35763 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3396  ABC transporter related  49.08 
 
 
364 aa  347  2e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.304213  normal  0.67181 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4747  ABC transporter related  49.87 
 
 
356 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.155462 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4614  ABC transporter related  48.28 
 
 
398 aa  346  3e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  46.98 
 
 
374 aa  346  4e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1098  ABC transporter related  48.55 
 
 
352 aa  345  6e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0329  ABC transporter related  48.13 
 
 
379 aa  345  6e-94  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.939732 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3925  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.15 
 
 
356 aa  345  7e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2331  ABC transporter related protein  45.04 
 
 
404 aa  345  8e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.048634  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4976  ABC transporter related  47.63 
 
 
365 aa  345  8.999999999999999e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0894214 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3928  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.15 
 
 
356 aa  345  1e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5050  ABC transporter related  48.69 
 
 
369 aa  344  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251909  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0607  ABC transporter related  48.29 
 
 
355 aa  344  1e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000630486 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>