More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1361 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1361  radical SAM enzyme, Cfr family  100 
 
 		 372 aa  776    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28470  radical SAM enzyme, Cfr family  52.8 
 
 		 344 aa  387  1e-106  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.267861  hitchhiker  0.00294853 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3115  radical SAM enzyme, Cfr family  51.18 
 
 		 353 aa  366  1e-100  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.248396  hitchhiker  0.0000000842526 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14130  radical SAM enzyme, Cfr family  45.06 
 
 		 351 aa  310  2e-83  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1313  radical SAM enzyme, Cfr family  46.73 
 
 		 360 aa  301  1e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1065  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.45 
 
 		 364 aa  288  1e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1711  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.62 
 
 		 347 aa  285  5.999999999999999e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.294696  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1993  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.62 
 
 		 347 aa  285  8e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1955  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.32 
 
 		 365 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2310  radical SAM enzyme, Cfr family  44.88 
 
 		 349 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0772545  hitchhiker  0.000694436 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1708  radical SAM protein  41.87 
 
 		 350 aa  281  9e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1323  radical SAM enzyme, Cfr family  44.64 
 
 		 348 aa  278  1e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1758  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.61 
 
 		 361 aa  278  1e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0572  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.35 
 
 		 349 aa  277  2e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00705994  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3850  radical SAM enzyme, Cfr family  41.21 
 
 		 357 aa  276  3e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1751  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.48 
 
 		 342 aa  277  3e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.493385  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0906  hypothetical protein  43.73 
 
 		 354 aa  274  2.0000000000000002e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000883258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3687  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.74 
 
 		 362 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2516  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.38 
 
 		 362 aa  273  3e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00628508  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1302  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.03 
 
 		 364 aa  273  4.0000000000000004e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.902149  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3605  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.03 
 
 		 362 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1277  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.03 
 
 		 364 aa  273  4.0000000000000004e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0784  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.43 
 
 		 364 aa  272  8.000000000000001e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3906  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.03 
 
 		 362 aa  272  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3715  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.03 
 
 		 362 aa  272  8.000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3623  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.03 
 
 		 362 aa  272  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4002  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.03 
 
 		 362 aa  272  8.000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3878  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.03 
 
 		 362 aa  272  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42646e-19 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3912  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.03 
 
 		 362 aa  272  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00181542  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0210  radical SAM enzyme, Cfr family  41.5 
 
 		 367 aa  272  8.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.128689 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3963  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.14 
 
 		 362 aa  271  2e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1609  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.34 
 
 		 355 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00249025 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1280  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.74 
 
 		 362 aa  269  5e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0793601 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0444  hypothetical protein  42.86 
 
 		 355 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1533  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.54 
 
 		 349 aa  268  8.999999999999999e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07736  hypothetical protein  39.18 
 
 		 346 aa  268  1e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.161739  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09940  radical SAM enzyme, Cfr family  41.06 
 
 		 349 aa  268  1e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16611  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.24 
 
 		 348 aa  266  4e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.785393  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4731  radical SAM enzyme, Cfr family  39.88 
 
 		 350 aa  266  5e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.698724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0483  radical SAM enzyme, Cfr family  38.3 
 
 		 350 aa  264  2e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0926837  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1782  radical SAM protein  38.19 
 
 		 349 aa  263  3e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2488  radical SAM protein  40.59 
 
 		 356 aa  262  6e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00360289  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1227  hypothetical protein  38.4 
 
 		 357 aa  262  6.999999999999999e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.75541  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3855  radical SAM enzyme, Cfr family  39.35 
 
 		 348 aa  261  1e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.74079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0188  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.57 
 
 		 365 aa  260  2e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0906  radical SAM enzyme, Cfr family  42.63 
 
 		 356 aa  260  3e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16031  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.2 
 
 		 356 aa  258  1e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1442  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.16 
 
 		 340 aa  257  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0609  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.23 
 
 		 351 aa  257  2e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.164087  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3329  hypothetical protein  41.06 
 
 		 428 aa  256  3e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4986  radical SAM enzyme, Cfr family  39.36 
 
 		 349 aa  257  3e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.323052  hitchhiker  0.00454129 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0928  radical SAM enzyme, Cfr family  40.87 
 
 		 364 aa  256  4e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.947592  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5856  radical SAM enzyme, Cfr family  39.15 
 
 		 378 aa  256  5e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2928  radical SAM protein  40.59 
 
 		 345 aa  256  5e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.333944  normal  0.253326 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2063  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.47 
 
 		 351 aa  255  9e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.029616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1468  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.85 
 
 		 340 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2783  radical SAM enzyme, Cfr family  42.06 
 
 		 408 aa  255  1.0000000000000001e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1043  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.92 
 
 		 341 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2229  radical SAM enzyme, Cfr family  40 
 
 		 372 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1660  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.47 
 
 		 389 aa  253  3e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2804  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.03 
 
 		 355 aa  253  5.000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.745253 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1631  hypothetical protein  39.71 
 
 		 372 aa  252  7e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.212269  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2317  radical SAM enzyme, Cfr family  39.41 
 
 		 372 aa  252  8.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.144753  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18821  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.86 
 
 		 359 aa  251  1e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3577  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.67 
 
 		 421 aa  251  2e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1327  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.09 
 
 		 353 aa  251  2e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0458  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.32 
 
 		 368 aa  250  3e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4182  radical SAM protein  40.5 
 
 		 374 aa  250  3e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1427  radical SAM enzyme, Cfr family  37.78 
 
 		 362 aa  249  4e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3124  hypothetical protein  37.39 
 
 		 365 aa  248  9e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.347966 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10170  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.33 
 
 		 429 aa  248  1e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16851  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.76 
 
 		 348 aa  248  1e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0683  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.77 
 
 		 365 aa  247  2e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.882739  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1012  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.24 
 
 		 359 aa  248  2e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1574  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.24 
 
 		 348 aa  247  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0426  radical SAM enzyme, Cfr family  38.51 
 
 		 359 aa  248  2e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4305  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.26 
 
 		 363 aa  248  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3404  radical SAM enzyme, Cfr family  38.96 
 
 		 388 aa  246  4e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00306025  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1235  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.88 
 
 		 380 aa  244  9.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.478405  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1124  radical SAM protein  37.21 
 
 		 369 aa  244  1.9999999999999999e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.371918  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1536  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.17 
 
 		 395 aa  243  3e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0799869 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16721  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.37 
 
 		 347 aa  243  3.9999999999999997e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1249  radical SAM protein  38.05 
 
 		 360 aa  241  1e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14830  hypothetical protein  37.86 
 
 		 379 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1414  radical SAM enzyme, Cfr family  35.67 
 
 		 361 aa  241  2e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2203  radical SAM enzyme, Cfr family  40.3 
 
 		 388 aa  241  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00426672  normal  0.359249 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04411  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.16 
 
 		 356 aa  241  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1403  radical SAM enzyme, Cfr family  39.71 
 
 		 371 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2180  radical SAM protein  39.53 
 
 		 377 aa  240  4e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2505  radical SAM protein  39.49 
 
 		 391 aa  239  5.999999999999999e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.282858  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0732  radical SAM enzyme, Cfr family  36.71 
 
 		 377 aa  239  8e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1308  hypothetical protein  37.79 
 
 		 378 aa  239  8e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0825  hypothetical protein  38.68 
 
 		 366 aa  238  1e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3311  radical SAM enzyme  39.33 
 
 		 406 aa  238  1e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.853243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0427  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.24 
 
 		 347 aa  238  1e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.273579  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_3052  predicted protein  38.9 
 
 		 378 aa  238  1e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.100127  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1087  radical SAM enzyme, Cfr family  40 
 
 		 383 aa  238  2e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.486861  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1167  radical SAM protein  40 
 
 		 374 aa  238  2e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1436  radical SAM enzyme, Cfr family  36.31 
 
 		 348 aa  237  2e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1011  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.57 
 
 		 343 aa  236  3e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>