More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1614 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1614  NADH dehydrogenase I, D subunit  100 
 
 		 414 aa  858    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0483  NADH dehydrogenase I, D subunit  62.11 
 
 		 426 aa  501  1e-141  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139003 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1541  NADH dehydrogenase I, D subunit  51.03 
 
 		 400 aa  404  1e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3352  NADH dehydrogenase I, D subunit  48.7 
 
 		 390 aa  395  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.131197  normal  0.0118999 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4241  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.67 
 
 		 390 aa  392  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0411944  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0341  NADH dehydrogenase I, D subunit  48.19 
 
 		 390 aa  393  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0211499  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1313  NADH dehydrogenase I, D subunit  48.7 
 
 		 401 aa  392  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3444  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  48.49 
 
 		 792 aa  389  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3223  NADH dehydrogenase I, D subunit  49.21 
 
 		 392 aa  391  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0966966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3923  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.93 
 
 		 389 aa  386  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.587069  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4007  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.93 
 
 		 389 aa  385  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2044e-27 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1046  NADH dehydrogenase I, D subunit  48.59 
 
 		 411 aa  384  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3135  NADH dehydrogenase I, D subunit  48.45 
 
 		 390 aa  384  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0132145  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0560  NADH dehydrogenase subunit D  47.04 
 
 		 390 aa  379  1e-104  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0153  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  46.73 
 
 		 791 aa  380  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4560  NADH dehydrogenase subunit D  47.36 
 
 		 398 aa  380  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.17714 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1321  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.58 
 
 		 417 aa  380  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.735553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0333  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  47.67 
 
 		 793 aa  378  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3632  NADH dehydrogenase subunit D  47.15 
 
 		 397 aa  379  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638594 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1927  NADH dehydrogenase subunit D  46.27 
 
 		 408 aa  376  1e-103  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.371072  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0426  NADH dehydrogenase subunit D  46.35 
 
 		 393 aa  377  1e-103  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1442  NADH dehydrogenase subunit D  46.51 
 
 		 408 aa  376  1e-103  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.331272  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3675  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.3 
 
 		 417 aa  375  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2155  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.78 
 
 		 441 aa  377  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02414  hypothetical protein similar to NADH-ubiquinone oxidoreductase 49 kDa subunit, mitochondrial precursor (Eurofung)  45.21 
 
 		 475 aa  372  1e-102  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.151267 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1280  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.3 
 
 		 414 aa  372  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.658271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0924  NADH dehydrogenase subunit D  46.39 
 
 		 406 aa  372  1e-102  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1558  NADH dehydrogenase subunit D  47.93 
 
 		 392 aa  374  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.970995  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2300  NADH dehydrogenase subunit D  49.22 
 
 		 403 aa  374  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0616  NADH dehydrogenase subunit D  45.83 
 
 		 393 aa  372  1e-102  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0389154  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1747  NADH dehydrogenase subunit D  45.76 
 
 		 408 aa  371  1e-101  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4630  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.44 
 
 		 402 aa  370  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.193494 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1715  NADH dehydrogenase subunit D  46.53 
 
 		 396 aa  369  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3620  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.13 
 
 		 404 aa  369  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.761398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2575  NADH dehydrogenase subunit D  46.21 
 
 		 401 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0392469  normal  0.134645 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0566  NADH dehydrogenase subunit D  46.07 
 
 		 388 aa  370  1e-101  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1172  NADH dehydrogenase subunit D  47.04 
 
 		 396 aa  370  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3082  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.37 
 
 		 422 aa  370  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1885  NADH dehydrogenase subunit D  45.45 
 
 		 402 aa  365  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.634993 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2420  NADH dehydrogenase subunit D  46.53 
 
 		 396 aa  366  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1561  NADH dehydrogenase subunit D  45.5 
 
 		 408 aa  368  1e-100  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0422295  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2058  NADH dehydrogenase subunit D  46.34 
 
 		 417 aa  367  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2884  NADH dehydrogenase subunit D  46.27 
 
 		 416 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.736243  normal  0.115348 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1025  NADH dehydrogenase subunit D  46.02 
 
 		 396 aa  367  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1346  NADH dehydrogenase subunit D  45.61 
 
 		 417 aa  365  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00313693  hitchhiker  0.00709586 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4518  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.36 
 
 		 415 aa  368  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.871032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1262  NADH dehydrogenase subunit D  46.27 
 
 		 396 aa  365  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3859  NADH dehydrogenase (quinone)  45.05 
 
 		 420 aa  364  1e-99  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1354  NADH dehydrogenase subunit D  46.02 
 
 		 396 aa  364  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.937388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2218  NADH dehydrogenase subunit D  45.45 
 
 		 402 aa  365  1e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.714071  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1967  NADH dehydrogenase subunit D  45.04 
 
 		 417 aa  364  1e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0788296 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0800  NADH dehydrogenase subunit D  46.79 
 
 		 396 aa  363  2e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.331726  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5574  NADH dehydrogenase subunit D  46.1 
 
 		 417 aa  364  2e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0121919  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3297  NADH dehydrogenase subunit D  46.27 
 
 		 402 aa  363  2e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3834  NADH dehydrogenase subunit D  46.53 
 
 		 396 aa  363  2e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.74836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3211  NADH dehydrogenase subunit D  45.12 
 
 		 417 aa  363  2e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1634  NADH dehydrogenase subunit D  46.1 
 
 		 417 aa  364  2e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.166476  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2246  NADH dehydrogenase subunit D  46.1 
 
 		 417 aa  364  2e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105278  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0805  NADH dehydrogenase subunit D  46.79 
 
 		 396 aa  363  3e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0798929  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4393  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.76 
 
 		 396 aa  363  3e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0182447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1745  NADH dehydrogenase subunit D  45.12 
 
 		 417 aa  363  3e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2211  NADH dehydrogenase subunit D  45.04 
 
 		 417 aa  363  4e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.518232 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1888  NADH dehydrogenase subunit D  45.37 
 
 		 417 aa  363  4e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0184  NADH dehydrogenase subunit D  44.99 
 
 		 408 aa  362  5.0000000000000005e-99  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1308  NADH dehydrogenase subunit D  45.64 
 
 		 418 aa  362  8e-99  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.652404  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2284  NADH dehydrogenase subunit D  45.61 
 
 		 417 aa  362  9e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0248166  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2163  NADH dehydrogenase subunit D  45.28 
 
 		 417 aa  361  1e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.549103  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2059  NADH dehydrogenase subunit D  44.39 
 
 		 417 aa  361  1e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.102892  normal  0.0817308 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1145  NADH dehydrogenase subunit D  45.37 
 
 		 417 aa  361  1e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2270  NADH dehydrogenase subunit D  45.85 
 
 		 417 aa  361  1e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0316798  normal  0.103385 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1064  NADH dehydrogenase subunit D  45.28 
 
 		 417 aa  361  1e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240648  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2404  NADH dehydrogenase subunit D  46.02 
 
 		 396 aa  361  1e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00163945 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3253  NADH dehydrogenase subunit D  44.31 
 
 		 417 aa  361  1e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.626895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2985  NADH dehydrogenase subunit D  46.51 
 
 		 406 aa  361  1e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0128464  normal  0.286368 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1031  NADH dehydrogenase subunit D  45.52 
 
 		 417 aa  361  1e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0235722  normal  0.1717 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2627  NADH dehydrogenase subunit D  44.71 
 
 		 417 aa  361  2e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2254  NADH dehydrogenase subunit D  44.71 
 
 		 417 aa  361  2e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154911 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1826  NADH dehydrogenase subunit D  45.28 
 
 		 417 aa  360  3e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1293  NADH dehydrogenase subunit D  45.28 
 
 		 417 aa  360  3e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1438  NADH dehydrogenase subunit D  45.28 
 
 		 417 aa  360  3e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.09225  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1133  NADH dehydrogenase subunit D  45.28 
 
 		 417 aa  360  3e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.154075  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0416  NADH dehydrogenase subunit D  45.28 
 
 		 417 aa  360  3e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1874  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.97 
 
 		 415 aa  360  3e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.598165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1302  NADH dehydrogenase subunit D  45.28 
 
 		 417 aa  360  3e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2006  NADH dehydrogenase subunit D  44.55 
 
 		 417 aa  360  3e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000196393  normal  0.17064 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0734  NADH dehydrogenase subunit D  45.28 
 
 		 417 aa  360  3e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.301756  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68160  NADH-ubiquinone oxidoreductase 49 kDa subunit, mitochondrial precursor  45.05 
 
 		 474 aa  359  4e-98  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4129  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.99 
 
 		 396 aa  359  5e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5101  NADH dehydrogenase (quinone)  45.48 
 
 		 410 aa  358  6e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2057  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.5 
 
 		 396 aa  358  7e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.320233  normal  0.342596 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1082  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.99 
 
 		 396 aa  358  7e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.129082 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1357  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  44.76 
 
 		 587 aa  358  8e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0206  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  46.34 
 
 		 794 aa  358  8e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000609108  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1211  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.99 
 
 		 396 aa  358  8e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1094  NADH dehydrogenase subunit D  44.39 
 
 		 417 aa  358  9e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.402289  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2833  NADH dehydrogenase subunit D  44.55 
 
 		 417 aa  358  9.999999999999999e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0178  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  46.37 
 
 		 794 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0989  NADH dehydrogenase subunit D  45.12 
 
 		 417 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.287966  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2921  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.53 
 
 		 394 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1942  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  44.9 
 
 		 787 aa  357  1.9999999999999998e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.699659 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>