226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0747 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0747  aspartate decarboxylase  100 
 
 
112 aa  229  9e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0199  aspartate alpha-decarboxylase  46.09 
 
 
149 aa  107  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.630189  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0195  aspartate 1-decarboxylase  46.55 
 
 
141 aa  103  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0992718  normal  0.129309 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1112  aspartate 1-decarboxylase  47.32 
 
 
154 aa  102  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.26125  normal  0.677083 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4486  aspartate 1-decarboxylase  44.83 
 
 
150 aa  101  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0633  aspartate 1-decarboxylase  43.48 
 
 
141 aa  100  8e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0364  aspartate 1-decarboxylase  47.75 
 
 
135 aa  99.8  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1841  aspartate alpha-decarboxylase  45.95 
 
 
114 aa  99  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0900  aspartate alpha-decarboxylase  42.24 
 
 
126 aa  98.6  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4717  aspartate alpha-decarboxylase  40.52 
 
 
141 aa  98.2  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106997 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1803  aspartate alpha-decarboxylase  50 
 
 
114 aa  97.8  5e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0386  aspartate 1-decarboxylase  46.02 
 
 
125 aa  97.4  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000166101  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0089  aspartate 1-decarboxylase  42.24 
 
 
150 aa  97.8  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.719828  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1979  aspartate 1-decarboxylase  44.57 
 
 
128 aa  97.4  6e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0802  aspartate alpha-decarboxylase  51.72 
 
 
124 aa  95.5  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000217258  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2150  aspartate alpha-decarboxylase  40.87 
 
 
128 aa  95.5  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0212  L-aspartate 1-decarboxylase  45.22 
 
 
136 aa  95.5  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.10689 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0326  aspartate 1-decarboxylase  40 
 
 
156 aa  94.7  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.437116  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4282  aspartate alpha-decarboxylase  48.89 
 
 
142 aa  94.4  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4761  aspartate alpha-decarboxylase  50 
 
 
135 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4847  aspartate alpha-decarboxylase  50 
 
 
135 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.102672  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5147  aspartate alpha-decarboxylase  50 
 
 
135 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1425  aspartate alpha-decarboxylase  40.52 
 
 
134 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.84513  normal  0.243105 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3533  aspartate alpha-decarboxylase  48.18 
 
 
131 aa  94  6e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00679712  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0408  aspartate alpha-decarboxylase  48.89 
 
 
128 aa  94  6e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.293009  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13633  aspartate alpha-decarboxylase  42.24 
 
 
139 aa  94  7e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.73195e-57  hitchhiker  0.00713008 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2095  aspartate 1-decarboxylase  37.93 
 
 
145 aa  93.6  8e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_706  aspartate 1-decarboxylase  50.57 
 
 
127 aa  93.6  8e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.455647  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0142  aspartate alpha-decarboxylase  44.14 
 
 
128 aa  93.2  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4051  L-aspartate 1-decarboxylase  39.64 
 
 
131 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2619  aspartate alpha-decarboxylase  41.74 
 
 
127 aa  93.2  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2673  aspartate alpha-decarboxylase  41.74 
 
 
127 aa  93.2  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35540  L-aspartate 1-decarboxylase  39.66 
 
 
165 aa  92.4  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.154487  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2856  aspartate alpha-decarboxylase  50.59 
 
 
133 aa  92.4  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3688  aspartate alpha-decarboxylase  46.49 
 
 
114 aa  92.4  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.177527 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4194  aspartate 1-decarboxylase  38.74 
 
 
131 aa  92.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15572  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4167  aspartate 1-decarboxylase  38.74 
 
 
131 aa  92.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1422  aspartate alpha-decarboxylase  39.64 
 
 
116 aa  92.4  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.200169 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0726  aspartate alpha-decarboxylase  50.57 
 
 
127 aa  92  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00148061  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0425  aspartate 1-decarboxylase  41.44 
 
 
117 aa  92  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8382  aspartate 1-decarboxylase  41.38 
 
 
139 aa  91.7  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.722771  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0412  aspartate alpha-decarboxylase  41.96 
 
 
127 aa  91.7  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.615997 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3010  aspartate alpha-decarboxylase  52.94 
 
 
134 aa  91.3  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1240  aspartate alpha-decarboxylase  52.94 
 
 
134 aa  90.9  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.05325e-17 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0465  aspartate 1-decarboxylase  47.25 
 
 
125 aa  90.9  5e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2996  aspartate alpha-decarboxylase  49.41 
 
 
133 aa  90.5  7e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0162  aspartate 1-decarboxylase  40.35 
 
 
127 aa  90.5  7e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0964577  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2220  aspartate 1-decarboxylase  43.96 
 
 
128 aa  90.1  8e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000163866  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01435  aspartate 1-decarboxylase precursor  40.87 
 
 
116 aa  90.1  9e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1645  aspartate 1-decarboxylase  47.78 
 
 
131 aa  90.1  9e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.204596  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0169  aspartate alpha-decarboxylase  38.6 
 
 
126 aa  89.7  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00266138 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2890  aspartate 1-decarboxylase  39.66 
 
 
126 aa  89.4  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792566  normal  0.392966 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0242  aspartate 1-decarboxylase  35.09 
 
 
127 aa  89.7  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.301817  normal  0.802334 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0182  aspartate alpha-decarboxylase  38.6 
 
 
126 aa  89.7  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00439449  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0379  aspartate alpha-decarboxylase  46.15 
 
 
129 aa  90.1  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0867961 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0106  aspartate alpha-decarboxylase  41.74 
 
 
116 aa  89.4  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1264  aspartate alpha-decarboxylase  40.87 
 
 
127 aa  89.7  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.943489  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20270  L-aspartate 1-decarboxylase  38.26 
 
 
145 aa  88.6  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3887  aspartate alpha-decarboxylase  40.91 
 
 
142 aa  89.4  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.80012  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3676  aspartate alpha-decarboxylase  40.91 
 
 
141 aa  88.6  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2080  aspartate alpha-decarboxylase  41.82 
 
 
132 aa  89  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.14084  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0377  aspartate 1-decarboxylase  41.82 
 
 
131 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.181374  normal  0.0242417 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4376  aspartate alpha-decarboxylase  46.09 
 
 
160 aa  88.6  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.35901  normal  0.433163 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1790  aspartate 1-decarboxylase  39.47 
 
 
127 aa  88.2  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1670  aspartate alpha-decarboxylase  37.93 
 
 
127 aa  87.8  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1597  aspartate alpha-decarboxylase  37.93 
 
 
127 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.105293  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1769  aspartate alpha-decarboxylase  45.74 
 
 
128 aa  87.4  5e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.25333 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0310  aspartate alpha-decarboxylase  44.21 
 
 
128 aa  87.4  5e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.454763  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3748  aspartate alpha-decarboxylase  37.07 
 
 
127 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1450  aspartate alpha-decarboxylase  39.29 
 
 
129 aa  87.4  6e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3013  aspartate alpha-decarboxylase  37.07 
 
 
126 aa  87.4  6e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.128431 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1451  aspartate alpha-decarboxylase  37.93 
 
 
127 aa  87  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1423  aspartate alpha-decarboxylase  37.93 
 
 
127 aa  87  7e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1424  aspartate alpha-decarboxylase  37.93 
 
 
127 aa  87  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1862  aspartate alpha-decarboxylase  50 
 
 
137 aa  87  7e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0137344  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1708  aspartate alpha-decarboxylase  37.93 
 
 
127 aa  87  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000361196  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1564  aspartate alpha-decarboxylase  37.93 
 
 
127 aa  87  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.572975  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0568  aspartate 1-decarboxylase  38.94 
 
 
135 aa  87.4  7e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.327581  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1466  aspartate alpha-decarboxylase  37.93 
 
 
127 aa  87  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1635  aspartate alpha-decarboxylase  37.93 
 
 
127 aa  87  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0211436 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5363  aspartate alpha-decarboxylase  45.56 
 
 
135 aa  87  8e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.306466  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1828  aspartate alpha-decarboxylase  46.67 
 
 
131 aa  86.7  9e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.683514  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4006  aspartate 1-decarboxylase  43.86 
 
 
144 aa  86.7  9e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1114  aspartate alpha-decarboxylase  47.25 
 
 
118 aa  86.3  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0135  aspartate 1-decarboxylase  43.33 
 
 
116 aa  86.3  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0379  aspartate alpha-decarboxylase  44.21 
 
 
131 aa  86.3  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.172281  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4391  aspartate 1-decarboxylase  45.65 
 
 
138 aa  86.3  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.472386  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0284  aspartate alpha-decarboxylase  40.37 
 
 
119 aa  86.3  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000351643  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9159  Aspartate 1-decarboxylase  39.13 
 
 
142 aa  85.9  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835034  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0461  L-aspartate 1-decarboxylase  37.84 
 
 
135 aa  85.5  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.646862  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1519  aspartate 1-decarboxylase  47.25 
 
 
134 aa  85.9  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2108  aspartate alpha-decarboxylase  37.72 
 
 
126 aa  85.9  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0321908  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0636  aspartate 1-decarboxylase  37.84 
 
 
155 aa  85.1  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.395847  normal  0.464671 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0298  aspartate 1-decarboxylase  48.35 
 
 
135 aa  84.3  5e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.385124  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0566  aspartate alpha-decarboxylase  37.72 
 
 
126 aa  84.3  5e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000545672 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32000  L-aspartate 1-decarboxylase  38.32 
 
 
151 aa  84.3  5e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3536  aspartate alpha-decarboxylase  41.11 
 
 
118 aa  84.3  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.620572 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2358  aspartate alpha-decarboxylase  38.26 
 
 
128 aa  84  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480424  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2490  aspartate alpha-decarboxylase  38.26 
 
 
128 aa  84  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0103  aspartate 1-decarboxylase  41.3 
 
 
118 aa  83.6  8e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.673145  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>