41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0610 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0610  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 316 aa  644    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.313511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3602  TPR repeat-containing protein  27.64 
 
 		 345 aa  104  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.310162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2065  putative lipoprotein  28.49 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6164  hypothetical protein  27.44 
 
 		 297 aa  55.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0345463 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1060  putative lipoprotein  24.73 
 
 		 298 aa  55.1  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.648337 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3430  tetratricopeptide domain-containing protein  28.28 
 
 		 258 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3296  putative lipoprotein  24.69 
 
 		 289 aa  53.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3100  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  25.6 
 
 		 306 aa  50.1  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.425844  normal  0.735542 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3384  putative lipoprotein  24.07 
 
 		 301 aa  50.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.321347  normal  0.0271451 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2006  putative lipoprotein  23.46 
 
 		 301 aa  49.3  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.47311 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1288  putative lipoprotein  24.39 
 
 		 325 aa  48.1  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.571416  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4038  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  23.46 
 
 		 302 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.890375  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0545  DNA uptake lipoprotein  28.67 
 
 		 264 aa  47.4  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.686095  normal  0.234082 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6695  putative lipoprotein  29.03 
 
 		 298 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0726  hypothetical protein  26.75 
 
 		 496 aa  47  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0262817  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3366  TPR repeat-containing protein  24.44 
 
 		 262 aa  46.6  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.052626  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0757  TPR repeat-containing protein  29.29 
 
 		 264 aa  46.2  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1778  TPR repeat-containing protein  21.36 
 
 		 452 aa  45.8  0.0009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0755  DNA uptake lipoprotein-like protein  28.57 
 
 		 315 aa  45.4  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3466  TPR repeat-containing protein  27.6 
 
 		 1191 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3402  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.6 
 
 		 1192 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.215973  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0330  putative lipoprotein  23.48 
 
 		 284 aa  44.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.654849  normal  0.880482 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3512  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  23.14 
 
 		 262 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.256611  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2038  TPR repeat-containing protein  22.56 
 
 		 1024 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.144797 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2055  DNA uptake lipoprotein-like protein  24.55 
 
 		 255 aa  44.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000188643  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3322  TPR repeat-containing protein  27.6 
 
 		 1193 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1457  DNA uptake lipoprotein-like protein  27.85 
 
 		 261 aa  44.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1651  TPR domain-containing protein  24.84 
 
 		 995 aa  43.9  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.874566 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2843  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  26.09 
 
 		 281 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0736024  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3448  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  23.14 
 
 		 262 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3178  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  29.03 
 
 		 291 aa  43.5  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.121746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1732  DNA uptake lipoprotein  24.81 
 
 		 268 aa  43.9  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0494603  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2951  putative lipoprotein  29.03 
 
 		 291 aa  43.5  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0171054 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2584  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  25.36 
 
 		 281 aa  43.5  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000140761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1378  putative competence protein ComL  28.29 
 
 		 287 aa  43.5  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.374682  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0985  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.48 
 
 		 311 aa  43.5  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.233637  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1422  competence protein ComL, putative  28.29 
 
 		 287 aa  43.5  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.225309  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0705  tetratricopeptide TPR_2  27.17 
 
 		 924 aa  43.1  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2383  TPR domain-containing protein  21.72 
 
 		 245 aa  42.7  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.28487e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7434  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  25.81 
 
 		 299 aa  42.4  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0308132  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0276  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.33 
 
 		 624 aa  42.4  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>