64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4180 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4180  D-aspartate oxidase  100 
 
 		 315 aa  592  1e-168  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.251055  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3505  D-aspartate oxidase  58.09 
 
 		 306 aa  262  6e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4657  D-aspartate oxidase  49.84 
 
 		 320 aa  254  2.0000000000000002e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.29884  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0526  D-amino acid oxidase  47.81 
 
 		 326 aa  229  4e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3499  D-amino-acid oxidase  42.99 
 
 		 305 aa  182  7e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1780  D-amino-acid oxidase  45.57 
 
 		 310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.763397  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1168  D-aspartate oxidase  36.66 
 
 		 318 aa  151  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.680607 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11934  D-amino acid oxidase aao  38.24 
 
 		 320 aa  150  3e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09913  putative D-amino acid oxidase  30.03 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.196189  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_5336  predicted protein  38.24 
 
 		 310 aa  136  4e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00372413  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00174  D-amino acid oxidase (AFU_orthologue; AFUA_5G11290)  32.01 
 
 		 364 aa  117  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10863  FAD dependent oxidoreductase superfamily (AFU_orthologue; AFUA_5G13940)  29.17 
 
 		 347 aa  90.9  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00330  conserved hypothetical protein  28.61 
 
 		 373 aa  82.4  0.000000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00932753  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00410  conserved hypothetical protein  30.08 
 
 		 392 aa  80.5  0.00000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01770  conserved hypothetical protein  33.16 
 
 		 426 aa  75.9  0.0000000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8818  D-aspartate oxidase  28.37 
 
 		 371 aa  72.4  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0276149 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83340  d-amino acid oxidase  25.82 
 
 		 378 aa  72  0.00000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3809  FAD dependent oxidoreductase  26.25 
 
 		 273 aa  68.2  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33517  D-aspartate oxidase  23.12 
 
 		 348 aa  60.8  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0197  glycine oxidase ThiO  31.31 
 
 		 342 aa  55.8  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3888  glycine oxidase ThiO  35.84 
 
 		 385 aa  53.5  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0912  glycine oxidase ThiO  31.1 
 
 		 349 aa  53.5  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.970325  normal  0.149805 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2723  FAD dependent oxidoreductase  29.79 
 
 		 378 aa  53.1  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2170  aromatic-ring hydroxylase  27.35 
 
 		 371 aa  53.1  0.000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4743  FAD dependent oxidoreductase  24.64 
 
 		 382 aa  52.8  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.285459 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2498  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  29.05 
 
 		 355 aa  52  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.373577  normal  0.49294 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  37.04 
 
 		 363 aa  52  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0708  glycine oxidase ThiO  29.79 
 
 		 338 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  28.47 
 
 		 368 aa  50.8  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4229  D-amino-acid dehydrogenase  32.21 
 
 		 415 aa  50.4  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.825619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4390  glycine oxidase ThiO  29.28 
 
 		 361 aa  49.7  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10420  thiamine biosynthesis oxidoreductase thiO  29.88 
 
 		 340 aa  49.3  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.219353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1624  FAD dependent oxidoreductase  29.61 
 
 		 363 aa  49.3  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.909673  hitchhiker  0.0000164974 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1956  oxidoreductase, FAD-binding  29.61 
 
 		 363 aa  49.3  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.034563  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1380  glycine/D-amino acid oxidase family protein  21.52 
 
 		 367 aa  48.5  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0801  glycine oxidase ThiO  31.36 
 
 		 367 aa  48.5  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00611  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  21.52 
 
 		 367 aa  48.5  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.741936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  34.93 
 
 		 375 aa  48.1  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2269  FAD dependent oxidoreductase  29.79 
 
 		 376 aa  47.4  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3748  glycine oxidase ThiO  32.52 
 
 		 342 aa  47.4  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00541  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  23 
 
 		 386 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0136  FAD dependent oxidoreductase  32.43 
 
 		 361 aa  47  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2406  FAD dependent oxidoreductase  37.72 
 
 		 379 aa  46.6  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000101651  normal  0.0131925 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4744  FAD dependent oxidoreductase  28.52 
 
 		 396 aa  46.2  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.732215  hitchhiker  0.0052696 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3234  glycine oxidase ThiO  31.85 
 
 		 372 aa  46.2  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1340  glycine oxidase ThiO  33.81 
 
 		 375 aa  45.8  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07187  FAD dependent oxidoreductase superfamily (AFU_orthologue; AFUA_6G10230)  27.91 
 
 		 264 aa  45.1  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  25.43 
 
 		 369 aa  45.4  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57912  D-amino acid oxidase  24.18 
 
 		 360 aa  45.8  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.687293 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0658  FAD dependent oxidoreductase  30.41 
 
 		 365 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5997  glycine oxidase ThiO  31.4 
 
 		 388 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.217156 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4279  glycine oxidase ThiO  33.72 
 
 		 398 aa  45.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.196313  hitchhiker  0.00513964 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4173  glycine oxidase ThiO  31.4 
 
 		 334 aa  45.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.269428 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1461  FAD dependent oxidoreductase  30.49 
 
 		 379 aa  44.3  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942129  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2715  oxidoreductase, FAD-binding  32.17 
 
 		 361 aa  43.9  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.725073  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5037  FAD dependent oxidoreductase  29.41 
 
 		 360 aa  44.3  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.484973 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0612  FAD dependent oxidoreductase  30.25 
 
 		 365 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1783  FAD dependent oxidoreductase  23.81 
 
 		 381 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.359042  normal  0.766074 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1044  thiamine biosynthesis oxidoreductase ThiO  35.71 
 
 		 391 aa  42.7  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  24.02 
 
 		 369 aa  42.7  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  24.02 
 
 		 369 aa  42.7  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  24.02 
 
 		 369 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0652  FAD dependent oxidoreductase  31.62 
 
 		 365 aa  42.4  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.139028  normal  0.321624 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  24.02 
 
 		 369 aa  42.4  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>