More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3487 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_3487  aldo/keto reductase  100 
 
 
341 aa  676    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2528  aldo/keto reductase  67.64 
 
 
343 aa  484  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0033  aldo/keto reductase  63.27 
 
 
339 aa  411  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0042  aldo/keto reductase  63.27 
 
 
339 aa  411  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00274786 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0023  aldo/keto reductase  62.97 
 
 
339 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0928  aldo/keto reductase  63.44 
 
 
339 aa  407  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.339617  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0867  putative aldo/keto reductase  61.03 
 
 
349 aa  399  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4612  aldo/keto reductase  60.29 
 
 
340 aa  388  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.593922  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1763  aldo/keto reductase  60.77 
 
 
341 aa  380  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6197  aldo/keto reductase  56.34 
 
 
339 aa  365  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135033  normal  0.610455 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3416  aldo/keto reductase  56.77 
 
 
348 aa  366  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2439  putative aldo/keto reductase  58.19 
 
 
341 aa  362  7.0000000000000005e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608138  decreased coverage  0.000840189 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4232  aldo/keto reductase  59.45 
 
 
345 aa  357  1.9999999999999998e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3784  aldo/keto reductase  59.23 
 
 
342 aa  354  1e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00710905  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1556  aldo/keto reductase  54.2 
 
 
349 aa  354  1e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206898  normal  0.568157 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5173  aldo/keto reductase  57.68 
 
 
345 aa  352  5e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5984  aldo/keto reductase  57.06 
 
 
368 aa  352  7e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0432  aldo/keto reductase  58.23 
 
 
343 aa  350  1e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.320892  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3284  aldo/keto reductase  58.75 
 
 
343 aa  351  1e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0266  aldo/keto reductase  57.14 
 
 
344 aa  346  3e-94  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.305848  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2303  aldo/keto reductase  54.78 
 
 
344 aa  344  1e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0585  aldo/keto reductase  54.62 
 
 
344 aa  330  3e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6213  aldo/keto reductase  54.34 
 
 
344 aa  326  4.0000000000000003e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.344018 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3948  aldo/keto reductase  47.31 
 
 
357 aa  286  2.9999999999999996e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3074  aldo/keto reductase  49.53 
 
 
333 aa  283  4.0000000000000003e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00558733  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3193  aldo/keto reductase  50.47 
 
 
333 aa  282  7.000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0477  aldo/keto reductase  46.49 
 
 
348 aa  274  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4219  aldo/keto reductase  48.56 
 
 
325 aa  263  3e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0296  aldo/keto reductase  46.35 
 
 
338 aa  257  2e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0155  aldo/keto reductase  46.86 
 
 
329 aa  251  9.000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  45.25 
 
 
352 aa  251  9.000000000000001e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0968  aldo/keto reductase  45.11 
 
 
349 aa  243  3e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00511053 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1898  aldo/keto reductase  43.53 
 
 
332 aa  242  5e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116625 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0460  aldo/keto reductase  45.17 
 
 
349 aa  242  7.999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02650  aldo/keto reductase  40.63 
 
 
317 aa  242  7.999999999999999e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1764  aldo/keto reductase  45 
 
 
354 aa  242  7.999999999999999e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0505  aldo/keto reductase  44.86 
 
 
349 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0236389 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0554  aldo/keto reductase  43.83 
 
 
341 aa  241  2e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.243293 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1278  aldo/keto reductase  42.9 
 
 
332 aa  240  2e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4128  aldo/keto reductase  43.73 
 
 
313 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3931  aldo/keto reductase  45.83 
 
 
313 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.726041  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2442  aldo/keto reductase  45.86 
 
 
309 aa  240  2e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1004  K+ channel beta subunit  41.67 
 
 
334 aa  238  1e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0098418  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4815  aldo/keto reductase  44.09 
 
 
313 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0950  aldo/keto reductase  43.17 
 
 
334 aa  238  1e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.493854  normal  0.381629 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0948  aldo/keto reductase  44.11 
 
 
333 aa  238  1e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00901952  normal  0.478792 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3087  aldo/keto reductase  44.34 
 
 
333 aa  238  2e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000843919  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1154  oxidoreductase  44.41 
 
 
349 aa  237  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.185514 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1288  aldo/keto reductase  44.41 
 
 
313 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2813  aldo/keto reductase  42.99 
 
 
349 aa  236  5.0000000000000005e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00980112  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3181  aldo/keto reductase  45.08 
 
 
322 aa  236  6e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.231147  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5452  aldo/keto reductase  44.2 
 
 
350 aa  236  6e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.447923  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1811  aldo/keto reductase  39.74 
 
 
316 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6593  aldo/keto reductase  40.24 
 
 
338 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0931  putative oxidoreductase (aldo/keto reductase)  43.96 
 
 
336 aa  233  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.936106 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5694  aldo/keto reductase  43.77 
 
 
351 aa  232  6e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6058  aldo/keto reductase  43.77 
 
 
351 aa  232  6e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0839954  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4145  aldo/keto reductase  44.06 
 
 
332 aa  231  1e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.128845 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0110  aldo/keto reductase  40.48 
 
 
325 aa  231  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.199403 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4757  aldo/keto reductase  42.37 
 
 
358 aa  231  1e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.468668  normal  0.0354493 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4281  aldo/keto reductase  46.08 
 
 
317 aa  231  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.198466  hitchhiker  0.0048015 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1306  aldo/keto reductase  42.5 
 
 
346 aa  230  2e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4531  aldo/keto reductase  43.12 
 
 
349 aa  230  3e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.773631 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0195  aldo/keto reductase  41.9 
 
 
338 aa  230  3e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4663  aldo/keto reductase  43.12 
 
 
349 aa  230  3e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4309  aldo/keto reductase  41.96 
 
 
344 aa  229  3e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17774  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1049  aldo/keto reductase  40.18 
 
 
323 aa  229  4e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3824  aldo/keto reductase  44.69 
 
 
339 aa  229  6e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1656  aldo/keto reductase  42.99 
 
 
328 aa  227  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.702563 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2804  aldo/keto reductase  39.68 
 
 
315 aa  228  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6543  aldo/keto reductase  43.47 
 
 
351 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.204351 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3155  aldo/keto reductase  42.32 
 
 
353 aa  227  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4382  aldo/keto reductase  42.9 
 
 
340 aa  227  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3763  aldo/keto reductase  40.41 
 
 
355 aa  227  3e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.866751  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0108  aldo/keto reductase  44.06 
 
 
345 aa  226  3e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0196191  hitchhiker  0.00894917 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0283  aldo/keto reductase  38.73 
 
 
315 aa  226  3e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5958  aldo/keto reductase  42.86 
 
 
370 aa  226  6e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3201  putative oxidoreductase  44.27 
 
 
339 aa  225  7e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.448174  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3940  aldo/keto reductase  44.27 
 
 
339 aa  225  7e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.336434  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4161  aldo/keto reductase  40.69 
 
 
344 aa  224  1e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1794  aldo/keto reductase  42.54 
 
 
324 aa  224  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.81315 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3852  aldo/keto reductase  40.69 
 
 
389 aa  224  2e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.697779  normal  0.307754 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6622  aldo/keto reductase  39.63 
 
 
358 aa  223  3e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.171856 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6263  aldo/keto reductase  43.16 
 
 
351 aa  223  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6537  aldo/keto reductase  43.03 
 
 
335 aa  223  4e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5658  aldo/keto reductase  42.33 
 
 
343 aa  223  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590758  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5670  aldo/keto reductase  41.84 
 
 
343 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300824  normal  0.0449862 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0722  aldo/keto reductase  43.67 
 
 
338 aa  222  6e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.798606  normal  0.462105 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0072  aldo/keto reductase  40.67 
 
 
342 aa  222  6e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12040  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  44.88 
 
 
343 aa  222  7e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4156  aldo/keto reductase  41.64 
 
 
335 aa  222  8e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0249282  normal  0.138418 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0603  aldo/keto reductase  41.01 
 
 
345 aa  221  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.512451  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2739  aldo/keto reductase  40.81 
 
 
352 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.8158 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0735  aldo/keto reductase  43.35 
 
 
338 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6594  aldo/keto reductase  42.33 
 
 
343 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688437  hitchhiker  0.0000922081 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0693  aldo/keto reductase  43.04 
 
 
338 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2484  aldo/keto reductase  40.19 
 
 
352 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.797379  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2653  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  40.56 
 
 
332 aa  220  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.481202  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4856  aldo/keto reductase  41.14 
 
 
343 aa  220  3e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2358  aldo/keto reductase  41.25 
 
 
331 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0956157 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>