211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3348 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_3348  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
265 aa  512  1e-144  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0638  alpha/beta hydrolase fold  48.22 
 
 
293 aa  230  2e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.925346  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3106  alpha/beta hydrolase fold protein  43.85 
 
 
268 aa  192  5e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.251532  normal  0.773597 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22730  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  44.03 
 
 
277 aa  168  9e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1452  hydrolase, alpha/beta fold family  34.39 
 
 
271 aa  168  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000259756 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3846  hydrolase, alpha/beta fold family  33.99 
 
 
271 aa  167  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3592  alpha/beta fold family hydrolase  33.85 
 
 
271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.620275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3877  alpha/beta fold family hydrolase  33.85 
 
 
271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3492  alpha/beta fold family hydrolase  33.85 
 
 
271 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000132504  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3759  hydrolase, alpha/beta fold family  33.85 
 
 
271 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000154361 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3504  alpha/beta fold family hydrolase  33.46 
 
 
271 aa  161  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0369292  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1030  alpha/beta hydrolase fold  32.31 
 
 
272 aa  159  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1903  alpha/beta hydrolase fold protein  40 
 
 
270 aa  156  3e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000527486 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3779  alpha/beta fold family hydrolase  32.68 
 
 
271 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.385884  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0632  putative hydrolse  37.55 
 
 
273 aa  152  5e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0784217  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1973  alpha/beta hydrolase fold  38.46 
 
 
243 aa  150  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0117  alpha/beta hydrolase  29.43 
 
 
276 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0308  alpha/beta fold family hydrolase, putative  28.52 
 
 
272 aa  128  9.000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1827  alpha/beta fold family hydrolase  26.69 
 
 
269 aa  122  5e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03006  alpha/beta hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13070)  31.92 
 
 
321 aa  121  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00486685  normal  0.258218 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18350  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  34.11 
 
 
263 aa  103  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.525496 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1430  biotin biosynthesis protein BioH  22.88 
 
 
239 aa  63.9  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1554  biotin biosynthesis protein BioH  23.16 
 
 
239 aa  60.1  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  27.43 
 
 
339 aa  56.2  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  27.04 
 
 
299 aa  55.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3365  Alpha/beta hydrolase  27.65 
 
 
264 aa  54.3  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  26.12 
 
 
264 aa  53.9  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  26.21 
 
 
256 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5996  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)  26.3 
 
 
260 aa  52.8  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1726  alpha/beta hydrolase fold protein  26.1 
 
 
303 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  27.34 
 
 
276 aa  51.6  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2437  alpha/beta hydrolase fold  30.08 
 
 
251 aa  52  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2969  nucleotide sugar epimerase  32.23 
 
 
618 aa  51.2  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3211  mxaA domain protein  32.23 
 
 
617 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6064  alpha/beta hydrolase fold protein  28.69 
 
 
262 aa  51.2  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25213  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1259  alpha/beta hydrolase fold  25.77 
 
 
284 aa  51.2  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0863  proline iminopeptidase  23.93 
 
 
318 aa  50.4  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1701  alpha/beta hydrolase fold protein  26.1 
 
 
303 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1149  alpha/beta hydrolase fold protein  25.82 
 
 
265 aa  50.4  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  26.15 
 
 
456 aa  50.4  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2925  hypothetical protein  31.4 
 
 
618 aa  50.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.142893  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1704  alpha/beta fold family hydrolase  27.55 
 
 
262 aa  50.1  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000659233  normal  0.0248748 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2383  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  25.76 
 
 
294 aa  49.7  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.38703  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3227  hypothetical protein  31.4 
 
 
618 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0125277  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0855  nucleotide sugar epimerase  31.4 
 
 
618 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.625581  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3193  mxaA domain protein  31.4 
 
 
618 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1140  alpha/beta hydrolase fold  33.04 
 
 
320 aa  49.7  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64719  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1273  Alpha/beta hydrolase fold  29.74 
 
 
258 aa  49.3  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.879726  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1173  proline iminopeptidase, putative  22.43 
 
 
278 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0896  MxaA domain-containing protein  31.4 
 
 
627 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0954  MxaA domain-containing protein  31.4 
 
 
627 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1230  alpha/beta hydrolase fold  28.29 
 
 
261 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  32.82 
 
 
264 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6602  alpha/beta hydrolase fold  28.29 
 
 
261 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472817  normal  0.1504 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5106  alpha/beta hydrolase fold protein  36.44 
 
 
287 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0636822  normal  0.0262926 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5882  alpha/beta hydrolase fold  30.11 
 
 
273 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5296  alpha/beta hydrolase fold protein  27.03 
 
 
251 aa  48.5  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 
289 aa  47.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  31.13 
 
 
269 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2493  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  28.09 
 
 
252 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.220295  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5301  putative oxidoreductase protein  29.37 
 
 
258 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0102616  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0178  alpha/beta hydrolase fold protein  36.36 
 
 
264 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  25.18 
 
 
277 aa  47.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1703  alpha/beta hydrolase fold  36.44 
 
 
284 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198775  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  29.37 
 
 
273 aa  47  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2063  esterase, putative  22.26 
 
 
291 aa  47  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.12276  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5078  proline iminopeptidase  24.83 
 
 
323 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1130  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  27.03 
 
 
295 aa  47  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2556  alpha/beta hydrolase fold  24.38 
 
 
291 aa  47  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0513  Alpha/beta hydrolase  27.56 
 
 
229 aa  47  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000581936  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3779  cyclic nucleotide-binding protein  24.71 
 
 
453 aa  47  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0440455  normal  0.0476196 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  25.29 
 
 
323 aa  47  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4289  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 
264 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0263366 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5259  alpha/beta hydrolase fold  29.86 
 
 
288 aa  46.6  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.956924  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3011  alpha/beta hydrolase fold  24.04 
 
 
300 aa  46.6  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245192  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  26.8 
 
 
311 aa  46.6  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 
266 aa  46.6  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4195  alpha/beta hydrolase fold protein  25.17 
 
 
308 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2045  mxaA domain protein  30.08 
 
 
618 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3414  alpha/beta hydrolase fold protein  35.77 
 
 
294 aa  45.8  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2759  alpha/beta hydrolase fold  27.44 
 
 
272 aa  46.2  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0191279  normal  0.157036 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2835  alpha/beta hydrolase fold protein  36.45 
 
 
294 aa  45.8  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2426  alpha/beta hydrolase fold protein  27.82 
 
 
267 aa  45.8  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.423437  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4158  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 
264 aa  46.2  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3896  alpha/beta hydrolase fold protein  29.3 
 
 
263 aa  45.8  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.407554  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1759  Alpha/beta hydrolase fold hydrolase or acyltransferase  25.77 
 
 
265 aa  45.8  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11889  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03993  putative bioH protein  25.5 
 
 
269 aa  45.8  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.39714  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2536  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  27.72 
 
 
252 aa  45.8  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0401993  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1210  alpha/beta hydrolase fold  27.51 
 
 
284 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.297219  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1735  alpha/beta hydrolase fold protein  28.85 
 
 
261 aa  45.8  0.0007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1227  alpha/beta hydrolase fold  27.51 
 
 
284 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0156  bioH protein  35.78 
 
 
256 aa  45.8  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  23.69 
 
 
300 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1929  3-Oxoadipate enol-lactonase  22.97 
 
 
300 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878211  normal  0.500669 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4699  alpha/beta hydrolase fold  33.09 
 
 
327 aa  45.8  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3663  alpha/beta hydrolase fold  33.09 
 
 
327 aa  45.8  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.378837  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2548  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  27.38 
 
 
252 aa  45.8  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.13969  normal  0.758429 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  27.8 
 
 
314 aa  45.8  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.143754 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3098  alpha/beta fold family hydrolase  23.59 
 
 
300 aa  45.4  0.0009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.833481  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3343  alpha/beta fold family hydrolase  23.59 
 
 
300 aa  45.4  0.0009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>