More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1221 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1221  2-nitropropane dioxygenase NPD  100 
 
 		 347 aa  669    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.665213  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12730  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  62.18 
 
 		 350 aa  377  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2684  2-nitropropane dioxygenase NPD  53.2 
 
 		 344 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2419  2-nitropropane dioxygenase NPD  53.12 
 
 		 338 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.57961  normal  0.818937 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2277  2-nitropropane dioxygenase, NPD  52.51 
 
 		 340 aa  263  4e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.663756 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3779  2-nitropropane dioxygenase NPD  52.15 
 
 		 353 aa  260  3e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4236  2-nitropropane dioxygenase NPD  52.98 
 
 		 344 aa  250  3e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4389  2-nitropropane dioxygenase, NPD  52.96 
 
 		 340 aa  239  6.999999999999999e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.537564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12794  hypothetical protein  48.82 
 
 		 344 aa  233  5e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0084  2-nitropropane dioxygenase NPD  46.93 
 
 		 343 aa  231  1e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00133989  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0098  hypothetical protein  46.93 
 
 		 343 aa  230  3e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5043  2-nitropropane dioxygenase NPD  47.34 
 
 		 345 aa  223  4e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2846  2-nitropropane dioxygenase, NPD  45.07 
 
 		 349 aa  222  6e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0398163  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0597  2-nitropropane dioxygenase NPD  47.74 
 
 		 338 aa  218  8.999999999999998e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0029  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40.17 
 
 		 346 aa  216  5.9999999999999996e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.58495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2068  2-nitropropane dioxygenase NPD  46.04 
 
 		 386 aa  214  1.9999999999999998e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2942  2-nitropropane dioxygenase NPD  44.28 
 
 		 350 aa  212  7e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0489  2-nitropropane dioxygenase, NPD  51.35 
 
 		 340 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.430148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0500  2-nitropropane dioxygenase, NPD  51.35 
 
 		 340 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0511  2-nitropropane dioxygenase, NPD  51.35 
 
 		 340 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0024  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40.18 
 
 		 351 aa  207  3e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00178014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1290  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.57 
 
 		 378 aa  206  4e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.62886  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1088  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.25 
 
 		 363 aa  204  1e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1419  nitropropane dioxygenase  37.46 
 
 		 363 aa  205  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1526  2-nitropropane dioxygenase  37.25 
 
 		 364 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0014  2-nitropropane dioxygenase protein  39 
 
 		 347 aa  203  4e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.859986  hitchhiker  0.00286829 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3501  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40.11 
 
 		 356 aa  203  4e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6375  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.26 
 
 		 353 aa  202  6e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3924  nitropropane dioxygenase  36.89 
 
 		 363 aa  202  8e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5128  2-nitropropane dioxygenase, NPD  42.58 
 
 		 376 aa  202  8e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.241888  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1257  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  36.13 
 
 		 364 aa  202  9e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1457  2-nitropropane dioxygenase  35.85 
 
 		 365 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.907571 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1255  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  36.26 
 
 		 364 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1483  2-nitropropane dioxygenase  35.85 
 
 		 364 aa  199  5e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0919  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.47 
 
 		 355 aa  199  7e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0937  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.47 
 
 		 355 aa  199  7e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1549  2-nitropropane dioxygenase NPD  43.43 
 
 		 366 aa  198  9e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.486705  normal  0.142209 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1283  2-nitropropane dioxygenase  35.57 
 
 		 364 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1385  2-nitropropane dioxygenase  35.57 
 
 		 364 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0279  2-nitropropane dioxygenase NPD  42.9 
 
 		 357 aa  193  5e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0207  2-nitropropane dioxygenase NPD  44.64 
 
 		 356 aa  191  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1908  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.28 
 
 		 350 aa  191  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.430969  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1140  hypothetical protein  36.5 
 
 		 355 aa  188  1e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1135  hypothetical protein  37.76 
 
 		 350 aa  187  2e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4328  putative 2-nitropropane dioxygenase  41.36 
 
 		 368 aa  187  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1628  2-nitropropane dioxygenase NPD  43.54 
 
 		 366 aa  185  8e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.879013 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6745  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.91 
 
 		 367 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.566568 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1878  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.96 
 
 		 361 aa  183  3e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.842086 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3136  2-nitropropane dioxygenase, NPD  43.1 
 
 		 351 aa  184  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.278577  normal  0.604759 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0271  2-nitropropane dioxygenase, NPD  43.82 
 
 		 365 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1606  2-nitropropane dioxygenase, NPD  44.29 
 
 		 366 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.433617  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2940  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.86 
 
 		 353 aa  182  6e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.917216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0562  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.83 
 
 		 378 aa  181  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000315665 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2755  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.64 
 
 		 359 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0669905  normal  0.0255247 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3814  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.83 
 
 		 349 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2774  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40.18 
 
 		 344 aa  179  5.999999999999999e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0462503 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6840  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.61 
 
 		 361 aa  179  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.437449  normal  0.0843125 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3888  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.72 
 
 		 349 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0445  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.54 
 
 		 349 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3082  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.19 
 
 		 354 aa  177  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.926981  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4010  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.61 
 
 		 349 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2459  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40.11 
 
 		 353 aa  177  3e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.36207 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7097  2-nitropropane dioxygenase NPD  42.24 
 
 		 366 aa  176  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0476  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.55 
 
 		 353 aa  176  4e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000711  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase (FMN)  35.88 
 
 		 356 aa  176  4e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00491947  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3902  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.32 
 
 		 346 aa  176  5e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.721372  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5538  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.72 
 
 		 364 aa  176  7e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.485511  normal  0.0535988 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0188  2-nitropropane dioxygenase, NPD  43.54 
 
 		 354 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4574  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.41 
 
 		 360 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3371  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.69 
 
 		 354 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.940632  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3542  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.68 
 
 		 361 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0130805 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1318  2-nitropropane dioxygenase NPD  42.94 
 
 		 354 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0817  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.06 
 
 		 356 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0392  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.74 
 
 		 366 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4869  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.76 
 
 		 366 aa  172  9e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.171146 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2147  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.23 
 
 		 354 aa  171  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0471  dioxygenase  36.39 
 
 		 359 aa  171  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2972  oxidoreductase, 2-nitropropane dioxygenase family  36.08 
 
 		 359 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24605  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3247  dioxygenase  41.42 
 
 		 352 aa  171  2e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0319665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3196  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.9 
 
 		 358 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3522  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.51 
 
 		 358 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0118514  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3554  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.53 
 
 		 353 aa  169  5e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0474  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.96 
 
 		 353 aa  168  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3827  hypothetical protein  37.57 
 
 		 361 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.321595 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2656  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.99 
 
 		 352 aa  166  5e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0351221 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4144  2-nitropropane dioxygenase NPD  41.43 
 
 		 366 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0896  hypothetical protein  40.82 
 
 		 351 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.467811  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09580  hypothetical protein  41.35 
 
 		 351 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1943  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.29 
 
 		 361 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2734  putative oxidoreductase protein  35.88 
 
 		 348 aa  164  3e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3310  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.26 
 
 		 350 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1015  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.09 
 
 		 367 aa  162  8.000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3992  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.45 
 
 		 361 aa  162  8.000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4714  putative 2-nitropropane dioxygenase  35.17 
 
 		 358 aa  162  9e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1940  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.23 
 
 		 348 aa  161  1e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0127053 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3832  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  42.35 
 
 		 366 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4565  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.87 
 
 		 381 aa  160  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.190968 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2091  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.8 
 
 		 362 aa  160  3e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4738  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.54 
 
 		 350 aa  160  4e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.217628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0052  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  42.06 
 
 		 366 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>