208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0876 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0876  HNH nuclease  100 
 
 		 218 aa  426  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1335  HNH endonuclease  40.58 
 
 		 321 aa  73.2  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4158  HNH nuclease  44.83 
 
 		 359 aa  70.9  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.416299  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4134  HNH nuclease  47.13 
 
 		 361 aa  68.9  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.276334  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1686  HNH endonuclease  47.69 
 
 		 163 aa  66.6  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0855  HNH endonuclease  47.37 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000164704  hitchhiker  0.000000000578298 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1080  HNH endonuclease  27.69 
 
 		 228 aa  65.1  0.0000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0178518  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1342  HNH nuclease  47.73 
 
 		 382 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.435035  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4021  HNH endonuclease  44.64 
 
 		 81 aa  63.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209781  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_002936  DET1269  HNH endonuclease domain-containing protein  41.51 
 
 		 232 aa  63.2  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000309683  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0908  HNH nuclease  45.24 
 
 		 370 aa  63.2  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000130016  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3119  HNH nuclease  45.45 
 
 		 357 aa  62.8  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.134297  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4128  HNH endonuclease  51.81 
 
 		 334 aa  62.8  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4561  HNH endonuclease  48.28 
 
 		 81 aa  60.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1468  HNH nuclease  53.97 
 
 		 362 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.09392  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3618  HNH nuclease  43.18 
 
 		 368 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4159  HNH endonuclease  46.59 
 
 		 334 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.114592  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4208  HNH endonuclease  46.67 
 
 		 80 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4247  HNH endonuclease  46.67 
 
 		 80 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000485502  hitchhiker  0.0000000423624 
 
 
-
 
NC_004310  BR1643  HNH endonuclease family protein  48.15 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1591  HNH endonuclease family protein  38.75 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.301685  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4259  HNH nuclease  52.31 
 
 		 346 aa  59.3  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2115  HNH endonuclease  50.6 
 
 		 322 aa  59.3  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4262  HNH endonuclease  41.18 
 
 		 372 aa  59.3  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3846  HNH endonuclease  34.38 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.895408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3553  HNH endonuclease  34.38 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.367592  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1563  HNH endonuclease  44.32 
 
 		 362 aa  59.3  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.010402  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4001  hypothetical protein  47.17 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0904  HNH nuclease  43.33 
 
 		 370 aa  58.5  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.590201  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1272  HNH endonuclease  48.15 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4042  HNH endonuclease  52.38 
 
 		 356 aa  58.2  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00210589  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4239  HNH endonuclease  39.81 
 
 		 372 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1150  HNH nuclease  43.33 
 
 		 374 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3111  HNH endonuclease  47.06 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.599577 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2524  HNH endonuclease  47.17 
 
 		 216 aa  58.2  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.434338 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2814  HNH endonuclease  42.86 
 
 		 177 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0623363 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1371  HNH nuclease  54.39 
 
 		 373 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1760  HNH endonuclease  52.63 
 
 		 387 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0478  HNH endonuclease  45.1 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3934  HNH nuclease  43.18 
 
 		 420 aa  55.8  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0342  HNH endonuclease  45.1 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.440485  normal  0.426528 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4185  HNH nuclease  40.48 
 
 		 357 aa  56.2  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169167  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1468  HNH nuclease  52.63 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0419266  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1700  HNH endonuclease  54.39 
 
 		 388 aa  56.2  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00106635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1255  HNH nuclease  41.67 
 
 		 392 aa  56.2  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000145383  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0558  HNH endonuclease  45.1 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0613  HNH endonuclease  45.1 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3791  HNH endonuclease  52.63 
 
 		 362 aa  55.8  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.352304 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0745  HNH endonuclease  43.14 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4281  HNH endonuclease  55.36 
 
 		 357 aa  55.5  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3490  HNH endonuclease  43.14 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4158  HNH endonuclease  51.72 
 
 		 388 aa  55.5  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0493415 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3843  HNH endonuclease  45.28 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4076  HNH endonuclease  41.67 
 
 		 407 aa  55.5  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.39422  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6399  stress protein  44.23 
 
 		 560 aa  55.1  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266447  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0344  HNH endonuclease  52.63 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.557879  normal  0.69024 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0411  HNH endonuclease  52.63 
 
 		 391 aa  55.5  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.732707 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1449  HNH endonuclease  52.63 
 
 		 391 aa  55.1  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.964003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3039  HNH endonuclease  52.63 
 
 		 309 aa  55.5  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.572998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3400  HNH endonuclease  52.63 
 
 		 390 aa  55.1  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00340791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1431  HNH endonuclease  52.63 
 
 		 388 aa  55.1  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.535031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1516  HNH endonuclease  52.63 
 
 		 390 aa  55.1  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000144845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3494  HNH nuclease  50.88 
 
 		 355 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3349  HNH endonuclease  41.18 
 
 		 368 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.645482  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4129  HNH endonuclease  52.63 
 
 		 386 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4160  HNH nuclease  40 
 
 		 358 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.874339  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1131  putative HNH endonuclease  45.1 
 
 		 185 aa  54.7  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1300  HNH endonuclease  52.63 
 
 		 316 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.409984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1332  HNH endonuclease  52.63 
 
 		 264 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.146487  normal  0.232691 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1632  HNH endonuclease  52.63 
 
 		 388 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.437118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3198  HNH endonuclease  50 
 
 		 388 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3850  HNH endonuclease  52.63 
 
 		 461 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3550  HNH nuclease  49.12 
 
 		 416 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00633328  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4099  HNH endonuclease  52.63 
 
 		 384 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3024  HNH endonuclease  45.28 
 
 		 185 aa  53.9  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1013  HNH endonuclease  42.86 
 
 		 189 aa  53.5  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0063565 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0931  HNH endonuclease  45 
 
 		 174 aa  53.1  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.432363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0859  HNH nuclease  50.88 
 
 		 370 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0115605  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4018  HNH endonuclease  41.18 
 
 		 357 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0998  HNH endonuclease  50.88 
 
 		 387 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.638291  normal  0.453877 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3103  HNH endonuclease  31.25 
 
 		 189 aa  52.8  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.220092 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3987  HNH endonuclease  50.88 
 
 		 359 aa  52.8  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0461  HNH endonuclease  27.91 
 
 		 206 aa  52.8  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0161278  hitchhiker  0.0046419 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0007  HNH endonuclease  48.98 
 
 		 162 aa  52.8  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1633  HNH endonuclease  41.51 
 
 		 186 aa  52.8  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2729  restriction endonuclease  46 
 
 		 194 aa  52.4  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0771488  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3083  HNH endonuclease  47.06 
 
 		 188 aa  52.4  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.342454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1387  HNH endonuclease  46 
 
 		 194 aa  52.4  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.322582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3430  HNH nuclease  42.35 
 
 		 379 aa  52  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0816  HNH endonuclease  36.36 
 
 		 355 aa  52  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.266631 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2900  HNH endonuclease  45.16 
 
 		 336 aa  51.6  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0011728 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0841  HNH endonuclease  34.41 
 
 		 234 aa  51.6  0.000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0960  HNH endonuclease  40 
 
 		 189 aa  51.6  0.000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.639629  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1434  HNH endonuclease  39.68 
 
 		 185 aa  50.8  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.212887  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3201  HNH endonuclease  43.4 
 
 		 186 aa  51.2  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.177111  normal  0.769466 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14600  predicted protein  35.51 
 
 		 145 aa  51.2  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3075  HNH endonuclease  50.88 
 
 		 391 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00244275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0579  HNH endonuclease  52.17 
 
 		 123 aa  50.4  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0365156  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0845  HNH endonuclease  35.71 
 
 		 240 aa  50.8  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5432  HNH endonuclease  45.9 
 
 		 174 aa  50.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0404895 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>