138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_4128 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_4128  HNH endonuclease  100 
 
 
334 aa  658    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4281  HNH endonuclease  86.34 
 
 
357 aa  550  1e-155  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2115  HNH endonuclease  85.29 
 
 
322 aa  538  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3987  HNH endonuclease  82.18 
 
 
359 aa  537  1e-151  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4099  HNH endonuclease  76.58 
 
 
384 aa  524  1e-147  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4259  HNH nuclease  78.96 
 
 
346 aa  511  1e-144  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4129  HNH endonuclease  78.85 
 
 
386 aa  506  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1760  HNH endonuclease  71.84 
 
 
387 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0908  HNH nuclease  51.23 
 
 
370 aa  320  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000130016  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4185  HNH nuclease  51.4 
 
 
357 aa  320  3e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169167  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1255  HNH nuclease  50.82 
 
 
392 aa  317  1e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000145383  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4076  HNH endonuclease  52.35 
 
 
407 aa  312  4.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.39422  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1468  HNH nuclease  51.78 
 
 
362 aa  312  4.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.09392  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0904  HNH nuclease  51.7 
 
 
370 aa  311  7.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.590201  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4018  HNH endonuclease  50.56 
 
 
357 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4158  HNH nuclease  50.28 
 
 
359 aa  306  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.416299  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3349  HNH endonuclease  51.42 
 
 
368 aa  306  3e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.645482  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3618  HNH nuclease  50.14 
 
 
368 aa  306  3e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4134  HNH nuclease  51.41 
 
 
361 aa  305  7e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.276334  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1150  HNH nuclease  48.52 
 
 
374 aa  305  9.000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3934  HNH nuclease  50.28 
 
 
420 aa  302  5.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4160  HNH nuclease  49.3 
 
 
358 aa  300  3e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.874339  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1563  HNH endonuclease  48.77 
 
 
362 aa  300  3e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.010402  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4042  HNH endonuclease  52.68 
 
 
356 aa  299  5e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00210589  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3119  HNH nuclease  50.56 
 
 
357 aa  298  1e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.134297  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3430  HNH nuclease  49.6 
 
 
379 aa  298  1e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1371  HNH nuclease  51.82 
 
 
373 aa  293  3e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0859  HNH nuclease  51.35 
 
 
370 aa  292  4e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0115605  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1342  HNH nuclease  49.46 
 
 
382 aa  290  3e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.435035  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4239  HNH endonuclease  47.78 
 
 
372 aa  279  5e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3494  HNH nuclease  49.85 
 
 
355 aa  278  7e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3550  HNH nuclease  47.43 
 
 
416 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00633328  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0816  HNH endonuclease  45.76 
 
 
355 aa  256  3e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.266631 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4262  HNH endonuclease  46.94 
 
 
372 aa  256  4e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4159  HNH endonuclease  48.88 
 
 
334 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.114592  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2900  HNH endonuclease  47.15 
 
 
336 aa  239  4e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0011728 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3020  hypothetical protein  56.16 
 
 
160 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.765456  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1700  HNH endonuclease  34.18 
 
 
388 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00106635  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0998  HNH endonuclease  32.58 
 
 
387 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.638291  normal  0.453877 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3075  HNH endonuclease  33.05 
 
 
391 aa  143  4e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00244275  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1449  HNH endonuclease  33.33 
 
 
391 aa  143  5e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.964003  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3400  HNH endonuclease  33.71 
 
 
390 aa  142  7e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00340791  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1468  HNH nuclease  52.53 
 
 
179 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0419266  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1431  HNH endonuclease  34.17 
 
 
388 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.535031  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4158  HNH endonuclease  35.04 
 
 
388 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0493415 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0411  HNH endonuclease  33.52 
 
 
391 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.732707 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3198  HNH endonuclease  32.66 
 
 
388 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1632  HNH endonuclease  34.18 
 
 
388 aa  136  5e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.437118  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1516  HNH endonuclease  31.48 
 
 
390 aa  132  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000144845  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3791  HNH endonuclease  31.79 
 
 
362 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.352304 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3850  HNH endonuclease  31.48 
 
 
461 aa  105  7e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3039  HNH endonuclease  32.41 
 
 
309 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.572998  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0450  HNH endonuclease  32.04 
 
 
390 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.480855 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1300  HNH endonuclease  30 
 
 
316 aa  96.3  6e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.409984  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2146  hypothetical protein  32.66 
 
 
414 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.585384  normal  0.0437716 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1332  HNH endonuclease  33.33 
 
 
264 aa  87.4  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.146487  normal  0.232691 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0344  HNH endonuclease  40.68 
 
 
188 aa  82.8  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.557879  normal  0.69024 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2410  HNH endonuclease  36.8 
 
 
176 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.618861  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3022  HNH endonuclease  36.3 
 
 
308 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0451  hypothetical protein  37.72 
 
 
249 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.446853 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3738  hypothetical protein  36.11 
 
 
308 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.381114  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1335  HNH endonuclease  30.63 
 
 
321 aa  64.7  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6399  stress protein  41.1 
 
 
560 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266447  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0876  HNH nuclease  56.25 
 
 
218 aa  60.5  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0855  HNH endonuclease  34.26 
 
 
230 aa  58.5  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000164704  hitchhiker  0.000000000578298 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0461  HNH endonuclease  41.43 
 
 
206 aa  58.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0161278  hitchhiker  0.0046419 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1080  HNH endonuclease  35.63 
 
 
228 aa  56.6  0.0000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0178518  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1269  HNH endonuclease domain-containing protein  40.91 
 
 
232 aa  55.8  0.0000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000309683  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1013  HNH endonuclease  37.35 
 
 
189 aa  55.5  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0063565 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3843  HNH endonuclease  37.8 
 
 
196 aa  55.1  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2814  HNH endonuclease  39.44 
 
 
177 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0623363 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4001  hypothetical protein  36.71 
 
 
185 aa  53.5  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1643  HNH endonuclease family protein  43.94 
 
 
190 aa  53.1  0.000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3553  HNH endonuclease  37.97 
 
 
185 aa  53.1  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.367592  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3846  HNH endonuclease  37.97 
 
 
185 aa  53.1  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.895408  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1591  HNH endonuclease family protein  43.94 
 
 
190 aa  53.1  0.000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.301685  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4081  HNH endonuclease  39.39 
 
 
169 aa  52.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2524  HNH endonuclease  36.71 
 
 
216 aa  52  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.434338 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3103  HNH endonuclease  38.37 
 
 
189 aa  52  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.220092 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1272  HNH endonuclease  43.94 
 
 
190 aa  51.2  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1633  HNH endonuclease  34.18 
 
 
186 aa  51.6  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3111  HNH endonuclease  37.35 
 
 
188 aa  50.4  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.599577 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0845  HNH endonuclease  31.87 
 
 
240 aa  50.1  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3201  HNH endonuclease  36.25 
 
 
186 aa  49.7  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.177111  normal  0.769466 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1048  HNH endonuclease  46.03 
 
 
211 aa  49.7  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0558  HNH endonuclease  34.25 
 
 
185 aa  49.3  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0478  HNH endonuclease  35.62 
 
 
185 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1686  HNH endonuclease  37.04 
 
 
163 aa  48.9  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0342  HNH endonuclease  35.62 
 
 
185 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.440485  normal  0.426528 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0613  HNH endonuclease  35.62 
 
 
185 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3490  HNH endonuclease  34.25 
 
 
185 aa  48.1  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3083  HNH endonuclease  39.24 
 
 
188 aa  48.1  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.342454  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1131  putative HNH endonuclease  34.21 
 
 
185 aa  47.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0860  HNH endonuclease  39.73 
 
 
168 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0745  HNH endonuclease  34.25 
 
 
191 aa  47.4  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4201  HNH endonuclease  35.51 
 
 
213 aa  47.8  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00342669 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2497  HNH endonuclease  35.21 
 
 
170 aa  47  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4561  HNH endonuclease  40.91 
 
 
81 aa  46.6  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3024  HNH endonuclease  38.36 
 
 
185 aa  47  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3060  HNH endonuclease  36.14 
 
 
183 aa  47  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.137861  normal  0.0666766 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>