106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2115 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_2115  HNH endonuclease  100 
 
 
322 aa  631  1e-180  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4128  HNH endonuclease  85.29 
 
 
334 aa  504  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4099  HNH endonuclease  73.28 
 
 
384 aa  498  1e-140  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3987  HNH endonuclease  75.71 
 
 
359 aa  497  1e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4281  HNH endonuclease  79.18 
 
 
357 aa  484  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1760  HNH endonuclease  70.65 
 
 
387 aa  467  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4259  HNH nuclease  72.41 
 
 
346 aa  462  1e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4129  HNH endonuclease  72.18 
 
 
386 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0908  HNH nuclease  48.63 
 
 
370 aa  298  9e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000130016  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0904  HNH nuclease  49.29 
 
 
370 aa  295  9e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.590201  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4185  HNH nuclease  48.43 
 
 
357 aa  293  3e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169167  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1255  HNH nuclease  47.27 
 
 
392 aa  289  5.0000000000000004e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000145383  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3119  HNH nuclease  49.31 
 
 
357 aa  286  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.134297  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3618  HNH nuclease  48.49 
 
 
368 aa  286  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4134  HNH nuclease  48.34 
 
 
361 aa  285  5e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.276334  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3934  HNH nuclease  47.78 
 
 
420 aa  285  8e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1468  HNH nuclease  46.56 
 
 
362 aa  282  5.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.09392  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1150  HNH nuclease  46.54 
 
 
374 aa  281  7.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4158  HNH nuclease  47.5 
 
 
359 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.416299  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4239  HNH endonuclease  47.22 
 
 
372 aa  276  4e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4042  HNH endonuclease  48.43 
 
 
356 aa  274  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00210589  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1563  HNH endonuclease  46.28 
 
 
362 aa  274  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.010402  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4018  HNH endonuclease  45.96 
 
 
357 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3349  HNH endonuclease  47.13 
 
 
368 aa  272  6e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.645482  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4160  HNH nuclease  46.15 
 
 
358 aa  272  6e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.874339  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4076  HNH endonuclease  48.02 
 
 
407 aa  272  7e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.39422  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3430  HNH nuclease  45.29 
 
 
379 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0859  HNH nuclease  48.09 
 
 
370 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0115605  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1342  HNH nuclease  46.88 
 
 
382 aa  266  4e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.435035  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0816  HNH endonuclease  47.16 
 
 
355 aa  264  1e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.266631 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1371  HNH nuclease  47.58 
 
 
373 aa  264  1e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4262  HNH endonuclease  46.94 
 
 
372 aa  260  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3494  HNH nuclease  45.87 
 
 
355 aa  258  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3550  HNH nuclease  45.96 
 
 
416 aa  253  3e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00633328  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2900  HNH endonuclease  46.85 
 
 
336 aa  247  2e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0011728 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4159  HNH endonuclease  44.81 
 
 
334 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.114592  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3020  hypothetical protein  50.99 
 
 
160 aa  146  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.765456  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1700  HNH endonuclease  34.47 
 
 
388 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00106635  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3075  HNH endonuclease  33.62 
 
 
391 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00244275  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4158  HNH endonuclease  34.57 
 
 
388 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0493415 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0411  HNH endonuclease  32.79 
 
 
391 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.732707 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0998  HNH endonuclease  32.66 
 
 
387 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.638291  normal  0.453877 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1449  HNH endonuclease  33.33 
 
 
391 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.964003  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3198  HNH endonuclease  32.76 
 
 
388 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1632  HNH endonuclease  33.33 
 
 
388 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.437118  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3400  HNH endonuclease  32.95 
 
 
390 aa  136  5e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00340791  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1431  HNH endonuclease  33.06 
 
 
388 aa  135  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.535031  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1516  HNH endonuclease  32.76 
 
 
390 aa  135  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000144845  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1468  HNH nuclease  47.71 
 
 
179 aa  126  6e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0419266  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3791  HNH endonuclease  31.58 
 
 
362 aa  109  5e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.352304 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3039  HNH endonuclease  31.65 
 
 
309 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.572998  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1300  HNH endonuclease  30.31 
 
 
316 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.409984  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0450  HNH endonuclease  33.45 
 
 
390 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.480855 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3850  HNH endonuclease  31.02 
 
 
461 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2146  hypothetical protein  31.1 
 
 
414 aa  97.1  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.585384  normal  0.0437716 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1332  HNH endonuclease  42.11 
 
 
264 aa  94  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.146487  normal  0.232691 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0344  HNH endonuclease  46.96 
 
 
188 aa  92.8  8e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.557879  normal  0.69024 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3022  HNH endonuclease  33.6 
 
 
308 aa  67  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0451  hypothetical protein  35.6 
 
 
249 aa  66.2  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.446853 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2410  HNH endonuclease  33.6 
 
 
176 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.618861  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3738  hypothetical protein  33.33 
 
 
308 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.381114  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6399  stress protein  42.47 
 
 
560 aa  59.3  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266447  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1335  HNH endonuclease  29.73 
 
 
321 aa  59.3  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0461  HNH endonuclease  45.31 
 
 
206 aa  58.9  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0161278  hitchhiker  0.0046419 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0876  HNH nuclease  54.69 
 
 
218 aa  57.8  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2814  HNH endonuclease  37.65 
 
 
177 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0623363 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0855  HNH endonuclease  32.11 
 
 
230 aa  52.8  0.000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000164704  hitchhiker  0.000000000578298 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1080  HNH endonuclease  35.63 
 
 
228 aa  52.8  0.000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0178518  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1269  HNH endonuclease domain-containing protein  40.91 
 
 
232 aa  52  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000309683  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1686  HNH endonuclease  34.62 
 
 
163 aa  52  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4081  HNH endonuclease  36.84 
 
 
169 aa  49.3  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3157  HNH endonuclease  29.47 
 
 
441 aa  48.5  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000184807  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23331  HNH endonuclease family protein  35.37 
 
 
189 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2524  HNH endonuclease  34.07 
 
 
216 aa  47.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.434338 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1013  HNH endonuclease  34.12 
 
 
189 aa  47.8  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0063565 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4001  hypothetical protein  34.12 
 
 
185 aa  47.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0845  HNH endonuclease  29.67 
 
 
240 aa  47.8  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5662  HNH endonuclease  39.29 
 
 
171 aa  46.6  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3083  HNH endonuclease  36.26 
 
 
188 aa  46.2  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.342454  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01520  HNH endonuclease  33.33 
 
 
504 aa  46.2  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1985  HNH nuclease  35.37 
 
 
174 aa  46.2  0.0008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.110291  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1643  HNH endonuclease family protein  39.39 
 
 
190 aa  45.4  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2144  HNH endonuclease  29.8 
 
 
189 aa  45.4  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1591  HNH endonuclease family protein  39.39 
 
 
190 aa  45.4  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.301685  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3843  HNH endonuclease  32.94 
 
 
196 aa  45.4  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3553  HNH endonuclease  34.12 
 
 
185 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.367592  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3846  HNH endonuclease  34.12 
 
 
185 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.895408  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4561  HNH endonuclease  40.91 
 
 
81 aa  44.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3308  HNH endonuclease  37.65 
 
 
211 aa  44.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.329837  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4021  HNH endonuclease  35.71 
 
 
81 aa  44.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209781  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0579  HNH endonuclease  46 
 
 
123 aa  44.7  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0365156  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1687  putative HNH endonuclease  33.33 
 
 
198 aa  44.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00321972  normal  0.0401015 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4342  HNH endonuclease  37.8 
 
 
182 aa  44.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.64843 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3111  HNH endonuclease  35.44 
 
 
188 aa  44.3  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.599577 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3201  HNH endonuclease  36.11 
 
 
186 aa  44.3  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.177111  normal  0.769466 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2497  HNH endonuclease  37.31 
 
 
170 aa  43.9  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3103  HNH endonuclease  32.94 
 
 
189 aa  43.9  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.220092 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1790  HNH endonuclease  40.28 
 
 
387 aa  43.9  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.445453  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1272  HNH endonuclease  39.39 
 
 
190 aa  43.5  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4208  HNH endonuclease  37.5 
 
 
80 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>