131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3494 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3494  HNH nuclease  100 
 
 
355 aa  696    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3430  HNH nuclease  81.28 
 
 
379 aa  561  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4018  HNH endonuclease  78.53 
 
 
357 aa  504  1e-141  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4160  HNH nuclease  76.9 
 
 
358 aa  503  1e-141  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.874339  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3119  HNH nuclease  78.24 
 
 
357 aa  502  1e-141  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.134297  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3934  HNH nuclease  77.19 
 
 
420 aa  499  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4158  HNH nuclease  76.25 
 
 
359 aa  496  1e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.416299  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3349  HNH endonuclease  75 
 
 
368 aa  490  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.645482  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1150  HNH nuclease  72.47 
 
 
374 aa  490  1e-137  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4134  HNH nuclease  76.59 
 
 
361 aa  481  1e-135  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.276334  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1563  HNH endonuclease  73.78 
 
 
362 aa  475  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.010402  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3550  HNH nuclease  73.5 
 
 
416 aa  472  1e-132  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00633328  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0904  HNH nuclease  70.89 
 
 
370 aa  468  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.590201  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4185  HNH nuclease  74.12 
 
 
357 aa  466  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169167  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1468  HNH nuclease  72.54 
 
 
362 aa  466  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.09392  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1255  HNH nuclease  71.23 
 
 
392 aa  460  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000145383  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0908  HNH nuclease  71.51 
 
 
370 aa  457  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000130016  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1342  HNH nuclease  72.78 
 
 
382 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.435035  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3618  HNH nuclease  69.14 
 
 
368 aa  447  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4076  HNH endonuclease  71.97 
 
 
407 aa  445  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.39422  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0859  HNH nuclease  71.55 
 
 
370 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0115605  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4042  HNH endonuclease  72.46 
 
 
356 aa  445  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00210589  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1371  HNH nuclease  71.43 
 
 
373 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4159  HNH endonuclease  73.23 
 
 
334 aa  429  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.114592  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4239  HNH endonuclease  54.6 
 
 
372 aa  331  1e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2900  HNH endonuclease  53.1 
 
 
336 aa  314  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0011728 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4262  HNH endonuclease  54.39 
 
 
372 aa  312  4.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0816  HNH endonuclease  51.04 
 
 
355 aa  307  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.266631 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4259  HNH nuclease  51.75 
 
 
346 aa  303  4.0000000000000003e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3987  HNH endonuclease  49.01 
 
 
359 aa  287  2e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4129  HNH endonuclease  49.42 
 
 
386 aa  277  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4099  HNH endonuclease  48.69 
 
 
384 aa  277  2e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4281  HNH endonuclease  48.27 
 
 
357 aa  267  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4128  HNH endonuclease  50.15 
 
 
334 aa  261  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2115  HNH endonuclease  46.72 
 
 
322 aa  258  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1760  HNH endonuclease  46.3 
 
 
387 aa  246  6e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1468  HNH nuclease  82.24 
 
 
179 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0419266  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3020  hypothetical protein  76.03 
 
 
160 aa  189  9e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.765456  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1449  HNH endonuclease  33.8 
 
 
391 aa  156  4e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.964003  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3198  HNH endonuclease  34.9 
 
 
388 aa  156  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3400  HNH endonuclease  34.82 
 
 
390 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00340791  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1431  HNH endonuclease  34.65 
 
 
388 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.535031  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1700  HNH endonuclease  32.49 
 
 
388 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00106635  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3075  HNH endonuclease  35.47 
 
 
391 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00244275  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0998  HNH endonuclease  34.73 
 
 
387 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.638291  normal  0.453877 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1632  HNH endonuclease  34.37 
 
 
388 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.437118  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1516  HNH endonuclease  34.72 
 
 
390 aa  149  7e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000144845  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4158  HNH endonuclease  34.17 
 
 
388 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0493415 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3791  HNH endonuclease  32.84 
 
 
362 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.352304 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3850  HNH endonuclease  33.76 
 
 
461 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0451  hypothetical protein  41.43 
 
 
249 aa  123  5e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.446853 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1300  HNH endonuclease  34.19 
 
 
316 aa  119  6e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.409984  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0450  HNH endonuclease  33.88 
 
 
390 aa  119  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.480855 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2146  hypothetical protein  32.91 
 
 
414 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.585384  normal  0.0437716 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0411  HNH endonuclease  41.45 
 
 
391 aa  106  6e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.732707 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3039  HNH endonuclease  39.88 
 
 
309 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.572998  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1332  HNH endonuclease  36.59 
 
 
264 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.146487  normal  0.232691 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0344  HNH endonuclease  41.73 
 
 
188 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.557879  normal  0.69024 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3022  HNH endonuclease  40.78 
 
 
308 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2410  HNH endonuclease  38.83 
 
 
176 aa  73.9  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.618861  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3738  hypothetical protein  37.86 
 
 
308 aa  73.9  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.381114  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6399  stress protein  46.03 
 
 
560 aa  64.3  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266447  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1335  HNH endonuclease  36.76 
 
 
321 aa  62  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0461  HNH endonuclease  38.24 
 
 
206 aa  59.7  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0161278  hitchhiker  0.0046419 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2814  HNH endonuclease  36.26 
 
 
177 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0623363 
 
 
-
 
NC_002936  DET1269  HNH endonuclease domain-containing protein  37.1 
 
 
232 aa  57  0.0000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000309683  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0855  HNH endonuclease  21.37 
 
 
230 aa  56.6  0.0000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000164704  hitchhiker  0.000000000578298 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4081  HNH endonuclease  36.25 
 
 
169 aa  56.2  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1080  HNH endonuclease  34.38 
 
 
228 aa  54.7  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0178518  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4460  HNH endonuclease  37.08 
 
 
181 aa  54.7  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.282325  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0876  HNH nuclease  50.88 
 
 
218 aa  53.5  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3479  HNH endonuclease  36.23 
 
 
169 aa  53.1  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0281943  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1013  HNH endonuclease  31.31 
 
 
189 aa  52  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0063565 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5662  HNH endonuclease  39.62 
 
 
171 aa  51.6  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0007  HNH endonuclease  35.11 
 
 
162 aa  51.6  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2350  HNH endonuclease  32.95 
 
 
188 aa  50.1  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.459711  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3103  HNH endonuclease  31.31 
 
 
189 aa  50.1  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.220092 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0346  HNH nuclease  34.57 
 
 
174 aa  48.1  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4001  hypothetical protein  30.3 
 
 
185 aa  48.5  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3201  HNH endonuclease  34.62 
 
 
186 aa  48.5  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.177111  normal  0.769466 
 
 
-
 
NC_004310  BR1643  HNH endonuclease family protein  32.18 
 
 
190 aa  47.8  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1583  HNH endonuclease  43.14 
 
 
166 aa  47.8  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1591  HNH endonuclease family protein  32.18 
 
 
190 aa  47.4  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.301685  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3846  HNH endonuclease  30.3 
 
 
185 aa  47.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.895408  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3553  HNH endonuclease  30.3 
 
 
185 aa  47.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.367592  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2202  HNH nuclease  37.8 
 
 
165 aa  47.4  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.815076 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3843  HNH endonuclease  31.25 
 
 
196 aa  47.4  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1537  HNH endonuclease  36.71 
 
 
178 aa  47  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1582  HNH endonuclease  34.94 
 
 
167 aa  47  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2524  HNH endonuclease  31.31 
 
 
216 aa  47  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.434338 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0579  HNH endonuclease  48.08 
 
 
123 aa  47  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0365156  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0860  HNH endonuclease  35 
 
 
168 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1954  HNH endonuclease  34.38 
 
 
197 aa  46.6  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.843087  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1985  HNH nuclease  36.25 
 
 
174 aa  46.6  0.0007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.110291  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1327  HNH endonuclease  34.78 
 
 
186 aa  46.6  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.102116  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23331  HNH endonuclease family protein  35 
 
 
189 aa  46.2  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3111  HNH endonuclease  34.09 
 
 
188 aa  46.2  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.599577 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3157  HNH endonuclease  26.51 
 
 
441 aa  45.4  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000184807  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2129  HNH endonuclease  31.58 
 
 
139 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.830228 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3241  HNH endonuclease  34.94 
 
 
186 aa  45.8  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.118071  normal  0.690575 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>