129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3987 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_3987  HNH endonuclease  100 
 
 
359 aa  709    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4129  HNH endonuclease  85.52 
 
 
386 aa  578  1e-164  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4099  HNH endonuclease  80.56 
 
 
384 aa  565  1e-160  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4281  HNH endonuclease  81.48 
 
 
357 aa  521  1e-147  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4128  HNH endonuclease  82.18 
 
 
334 aa  502  1e-141  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4259  HNH nuclease  77.3 
 
 
346 aa  500  1e-140  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2115  HNH endonuclease  75.71 
 
 
322 aa  497  1e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1760  HNH endonuclease  73.28 
 
 
387 aa  474  1e-132  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0904  HNH nuclease  51.29 
 
 
370 aa  322  9.000000000000001e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.590201  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0908  HNH nuclease  50.67 
 
 
370 aa  312  3.9999999999999997e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000130016  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1255  HNH nuclease  48.94 
 
 
392 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000145383  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4185  HNH nuclease  51.25 
 
 
357 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169167  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3349  HNH endonuclease  47.87 
 
 
368 aa  305  9.000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.645482  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4018  HNH endonuclease  49.17 
 
 
357 aa  303  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1150  HNH nuclease  48.92 
 
 
374 aa  303  3.0000000000000004e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4134  HNH nuclease  51.11 
 
 
361 aa  299  4e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.276334  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3934  HNH nuclease  49.45 
 
 
420 aa  298  7e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3430  HNH nuclease  48.26 
 
 
379 aa  298  7e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4160  HNH nuclease  47.88 
 
 
358 aa  298  1e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.874339  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4076  HNH endonuclease  48.31 
 
 
407 aa  296  4e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.39422  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1468  HNH nuclease  48.73 
 
 
362 aa  295  8e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.09392  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3618  HNH nuclease  49.46 
 
 
368 aa  293  2e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4158  HNH nuclease  49.03 
 
 
359 aa  294  2e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.416299  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0859  HNH nuclease  50 
 
 
370 aa  291  9e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0115605  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4042  HNH endonuclease  50.28 
 
 
356 aa  291  1e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00210589  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1371  HNH nuclease  48.42 
 
 
373 aa  291  1e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4239  HNH endonuclease  48.1 
 
 
372 aa  291  1e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1563  HNH endonuclease  48.6 
 
 
362 aa  290  2e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.010402  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3119  HNH nuclease  48.36 
 
 
357 aa  291  2e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.134297  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3494  HNH nuclease  49.01 
 
 
355 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3550  HNH nuclease  48.15 
 
 
416 aa  280  4e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00633328  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1342  HNH nuclease  46.93 
 
 
382 aa  272  5.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.435035  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4262  HNH endonuclease  47.7 
 
 
372 aa  265  8e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0816  HNH endonuclease  45.61 
 
 
355 aa  260  2e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.266631 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2900  HNH endonuclease  46.39 
 
 
336 aa  253  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0011728 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4159  HNH endonuclease  46.79 
 
 
334 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.114592  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3020  hypothetical protein  55.86 
 
 
160 aa  155  8e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.765456  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1700  HNH endonuclease  34.83 
 
 
388 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00106635  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3075  HNH endonuclease  35.18 
 
 
391 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00244275  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3400  HNH endonuclease  35 
 
 
390 aa  146  5e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00340791  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0411  HNH endonuclease  34.75 
 
 
391 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.732707 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0998  HNH endonuclease  33.24 
 
 
387 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.638291  normal  0.453877 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1449  HNH endonuclease  34.64 
 
 
391 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.964003  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1431  HNH endonuclease  35.57 
 
 
388 aa  142  7e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.535031  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1632  HNH endonuclease  33.99 
 
 
388 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.437118  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1468  HNH nuclease  47.73 
 
 
179 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0419266  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3198  HNH endonuclease  34.37 
 
 
388 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4158  HNH endonuclease  34.73 
 
 
388 aa  137  4e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0493415 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1516  HNH endonuclease  32.61 
 
 
390 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000144845  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3791  HNH endonuclease  32.62 
 
 
362 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.352304 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0450  HNH endonuclease  33.91 
 
 
390 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.480855 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3850  HNH endonuclease  31.39 
 
 
461 aa  102  8e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1300  HNH endonuclease  32.31 
 
 
316 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.409984  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2146  hypothetical protein  32.99 
 
 
414 aa  96.3  8e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.585384  normal  0.0437716 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3039  HNH endonuclease  36.7 
 
 
309 aa  90.5  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.572998  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0344  HNH endonuclease  42.37 
 
 
188 aa  87.4  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.557879  normal  0.69024 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1332  HNH endonuclease  36.46 
 
 
264 aa  87  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.146487  normal  0.232691 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3022  HNH endonuclease  35.47 
 
 
308 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2410  HNH endonuclease  38.4 
 
 
176 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.618861  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3738  hypothetical protein  37.96 
 
 
308 aa  70.1  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.381114  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0461  HNH endonuclease  44.12 
 
 
206 aa  64.3  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0161278  hitchhiker  0.0046419 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0451  hypothetical protein  33.33 
 
 
249 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.446853 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2814  HNH endonuclease  39.08 
 
 
177 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0623363 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6399  stress protein  40.79 
 
 
560 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266447  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1335  HNH endonuclease  31.82 
 
 
321 aa  56.6  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0855  HNH endonuclease  40.58 
 
 
230 aa  55.1  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000164704  hitchhiker  0.000000000578298 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4081  HNH endonuclease  39.19 
 
 
169 aa  53.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1643  HNH endonuclease family protein  41.54 
 
 
190 aa  52.8  0.000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1591  HNH endonuclease family protein  41.54 
 
 
190 aa  52.8  0.000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.301685  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1269  HNH endonuclease domain-containing protein  40.32 
 
 
232 aa  52.8  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000309683  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3201  HNH endonuclease  36.59 
 
 
186 aa  52.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.177111  normal  0.769466 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0876  HNH nuclease  50.88 
 
 
218 aa  52  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2524  HNH endonuclease  30.46 
 
 
216 aa  51.6  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.434338 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4001  hypothetical protein  38.03 
 
 
185 aa  52  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1013  HNH endonuclease  37.33 
 
 
189 aa  51.6  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0063565 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1272  HNH endonuclease  41.54 
 
 
190 aa  51.2  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1080  HNH endonuclease  38.71 
 
 
228 aa  50.4  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0178518  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4460  HNH endonuclease  37.8 
 
 
181 aa  50.4  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.282325  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1686  HNH endonuclease  31.68 
 
 
163 aa  50.1  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3843  HNH endonuclease  35.14 
 
 
196 aa  50.1  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3846  HNH endonuclease  36.62 
 
 
185 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.895408  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3553  HNH endonuclease  36.62 
 
 
185 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.367592  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3103  HNH endonuclease  35.06 
 
 
189 aa  48.1  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.220092 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3083  HNH endonuclease  38.03 
 
 
188 aa  47.8  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.342454  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23331  HNH endonuclease family protein  38.24 
 
 
189 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5662  HNH endonuclease  38.18 
 
 
171 aa  47.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3308  HNH endonuclease  36.62 
 
 
211 aa  47  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.329837  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2497  HNH endonuclease  35.82 
 
 
170 aa  46.6  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1633  HNH endonuclease  32.39 
 
 
186 aa  47  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1583  HNH endonuclease  39.44 
 
 
166 aa  46.6  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1985  HNH nuclease  32.17 
 
 
174 aa  46.2  0.0009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.110291  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3111  HNH endonuclease  37.33 
 
 
188 aa  45.8  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.599577 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1687  putative HNH endonuclease  32.58 
 
 
198 aa  46.2  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00321972  normal  0.0401015 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4342  HNH endonuclease  36.9 
 
 
182 aa  46.2  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.64843 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0007  HNH endonuclease  33.58 
 
 
162 aa  45.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0342  HNH endonuclease  33.85 
 
 
185 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.440485  normal  0.426528 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4201  HNH endonuclease  38.16 
 
 
213 aa  45.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00342669 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2144  HNH endonuclease  29.56 
 
 
189 aa  45.4  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3024  HNH endonuclease  36.92 
 
 
185 aa  45.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1582  HNH endonuclease  37.21 
 
 
167 aa  45.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.485926 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>