132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3349 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_3349  HNH endonuclease  100 
 
 
368 aa  729    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.645482  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0908  HNH nuclease  82.02 
 
 
370 aa  572  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000130016  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4042  HNH endonuclease  82.25 
 
 
356 aa  561  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00210589  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4185  HNH nuclease  81.41 
 
 
357 aa  563  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169167  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1255  HNH nuclease  78.79 
 
 
392 aa  563  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000145383  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0904  HNH nuclease  79.37 
 
 
370 aa  552  1e-156  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.590201  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4076  HNH endonuclease  83.38 
 
 
407 aa  549  1e-155  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.39422  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3618  HNH nuclease  77.96 
 
 
368 aa  542  1e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1468  HNH nuclease  76.24 
 
 
362 aa  543  1e-153  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.09392  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3430  HNH nuclease  75.53 
 
 
379 aa  535  1e-151  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0859  HNH nuclease  81.74 
 
 
370 aa  531  1e-150  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0115605  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1563  HNH endonuclease  76.24 
 
 
362 aa  533  1e-150  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.010402  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1371  HNH nuclease  76.8 
 
 
373 aa  531  1e-150  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1150  HNH nuclease  73.12 
 
 
374 aa  519  1e-146  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4160  HNH nuclease  74.72 
 
 
358 aa  510  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.874339  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4018  HNH endonuclease  76.49 
 
 
357 aa  508  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3934  HNH nuclease  76.19 
 
 
420 aa  506  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1342  HNH nuclease  76.52 
 
 
382 aa  504  1e-141  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.435035  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4158  HNH nuclease  74.44 
 
 
359 aa  496  1e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.416299  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4134  HNH nuclease  73.24 
 
 
361 aa  493  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.276334  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3119  HNH nuclease  74.15 
 
 
357 aa  490  1e-137  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.134297  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3550  HNH nuclease  74.32 
 
 
416 aa  487  1e-136  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00633328  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3494  HNH nuclease  75 
 
 
355 aa  484  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4159  HNH endonuclease  70.81 
 
 
334 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.114592  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4239  HNH endonuclease  51.06 
 
 
372 aa  323  3e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4259  HNH nuclease  50.84 
 
 
346 aa  316  5e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0816  HNH endonuclease  50.7 
 
 
355 aa  309  5e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.266631 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3987  HNH endonuclease  47.87 
 
 
359 aa  305  9.000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4262  HNH endonuclease  50.53 
 
 
372 aa  302  6.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2900  HNH endonuclease  49.12 
 
 
336 aa  291  2e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0011728 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4281  HNH endonuclease  49.44 
 
 
357 aa  290  4e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4099  HNH endonuclease  48.63 
 
 
384 aa  288  7e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4128  HNH endonuclease  51.42 
 
 
334 aa  286  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4129  HNH endonuclease  48.48 
 
 
386 aa  285  5.999999999999999e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2115  HNH endonuclease  47.13 
 
 
322 aa  272  7e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1760  HNH endonuclease  44.13 
 
 
387 aa  246  3e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3020  hypothetical protein  85.31 
 
 
160 aa  246  4e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.765456  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1468  HNH nuclease  76.4 
 
 
179 aa  243  3e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0419266  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1700  HNH endonuclease  32.96 
 
 
388 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00106635  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3400  HNH endonuclease  31.64 
 
 
390 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00340791  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0998  HNH endonuclease  31.92 
 
 
387 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.638291  normal  0.453877 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1431  HNH endonuclease  32.01 
 
 
388 aa  153  4e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.535031  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1449  HNH endonuclease  33.43 
 
 
391 aa  152  7e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.964003  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3075  HNH endonuclease  32.68 
 
 
391 aa  152  7e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00244275  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1632  HNH endonuclease  31.84 
 
 
388 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.437118  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0411  HNH endonuclease  33.15 
 
 
391 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.732707 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4158  HNH endonuclease  32.39 
 
 
388 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0493415 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3198  HNH endonuclease  33.43 
 
 
388 aa  149  5e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1516  HNH endonuclease  31.82 
 
 
390 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000144845  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3791  HNH endonuclease  30.53 
 
 
362 aa  129  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.352304 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1300  HNH endonuclease  31.86 
 
 
316 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.409984  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3850  HNH endonuclease  32.26 
 
 
461 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0451  hypothetical protein  40.8 
 
 
249 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.446853 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0450  HNH endonuclease  31.71 
 
 
390 aa  113  6e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.480855 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3039  HNH endonuclease  30.72 
 
 
309 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.572998  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2146  hypothetical protein  31.74 
 
 
414 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.585384  normal  0.0437716 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1332  HNH endonuclease  35.58 
 
 
264 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.146487  normal  0.232691 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0344  HNH endonuclease  45.92 
 
 
188 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.557879  normal  0.69024 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3022  HNH endonuclease  36.67 
 
 
308 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2410  HNH endonuclease  38.83 
 
 
176 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.618861  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3738  hypothetical protein  34.26 
 
 
308 aa  66.2  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.381114  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6399  stress protein  42.86 
 
 
560 aa  63.5  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266447  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1335  HNH endonuclease  29.53 
 
 
321 aa  62.8  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0461  HNH endonuclease  39.71 
 
 
206 aa  60.1  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0161278  hitchhiker  0.0046419 
 
 
-
 
NC_002936  DET1269  HNH endonuclease domain-containing protein  34.38 
 
 
232 aa  53.9  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000309683  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1080  HNH endonuclease  33.82 
 
 
228 aa  53.9  0.000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0178518  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0876  HNH nuclease  41.18 
 
 
218 aa  52.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2814  HNH endonuclease  39.19 
 
 
177 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0623363 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4081  HNH endonuclease  45.45 
 
 
169 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0855  HNH endonuclease  33.82 
 
 
230 aa  50.4  0.00005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000164704  hitchhiker  0.000000000578298 
 
 
-
 
NC_004310  BR1643  HNH endonuclease family protein  36.92 
 
 
190 aa  49.3  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1591  HNH endonuclease family protein  35.29 
 
 
190 aa  49.3  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.301685  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4460  HNH endonuclease  31.82 
 
 
181 aa  48.5  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.282325  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3479  HNH endonuclease  33.33 
 
 
169 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0281943  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3490  HNH endonuclease  34.78 
 
 
185 aa  48.1  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0745  HNH endonuclease  35.29 
 
 
191 aa  48.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0040  hypothetical protein  25.75 
 
 
436 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.480541 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1272  HNH endonuclease  36.92 
 
 
190 aa  47.4  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4001  hypothetical protein  32.39 
 
 
185 aa  47.4  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2350  HNH endonuclease  32.84 
 
 
188 aa  47.4  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.459711  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1633  HNH endonuclease  30.99 
 
 
186 aa  47  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3201  HNH endonuclease  34.78 
 
 
186 aa  47.4  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.177111  normal  0.769466 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1013  HNH endonuclease  34.67 
 
 
189 aa  47  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0063565 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1131  putative HNH endonuclease  33.33 
 
 
185 aa  46.6  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0070  HNH endonuclease  29.73 
 
 
174 aa  47  0.0006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.856435  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7339  HNH endonuclease  40.32 
 
 
180 aa  46.6  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539168  hitchhiker  0.000174655 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5662  HNH endonuclease  33.93 
 
 
171 aa  46.6  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4342  HNH endonuclease  39.39 
 
 
182 aa  46.2  0.0009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.64843 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1985  HNH nuclease  35.82 
 
 
174 aa  45.8  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.110291  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1582  HNH endonuclease  37.7 
 
 
167 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23331  HNH endonuclease family protein  34.92 
 
 
189 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0579  HNH endonuclease  50 
 
 
123 aa  45.4  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0365156  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1327  HNH endonuclease  36.23 
 
 
186 aa  45.8  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.102116  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2524  HNH endonuclease  32.39 
 
 
216 aa  45.4  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.434338 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1954  HNH endonuclease  36.11 
 
 
197 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.843087  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3843  HNH endonuclease  34.25 
 
 
196 aa  45.8  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3846  HNH endonuclease  30.99 
 
 
185 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.895408  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3241  HNH endonuclease  34.85 
 
 
186 aa  45.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.118071  normal  0.690575 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3553  HNH endonuclease  30.99 
 
 
185 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.367592  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5301  HNH endonuclease  39.39 
 
 
182 aa  45.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.480344  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>