106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_4185 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_4185  HNH nuclease  100 
 
 
357 aa  710    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169167  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4042  HNH endonuclease  85.99 
 
 
356 aa  592  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00210589  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1255  HNH nuclease  83.01 
 
 
392 aa  590  1e-167  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000145383  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0908  HNH nuclease  81.82 
 
 
370 aa  582  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000130016  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3349  HNH endonuclease  81.41 
 
 
368 aa  572  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.645482  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0904  HNH nuclease  81.14 
 
 
370 aa  562  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.590201  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3618  HNH nuclease  81.87 
 
 
368 aa  561  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4076  HNH endonuclease  84.23 
 
 
407 aa  563  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.39422  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1468  HNH nuclease  78.89 
 
 
362 aa  541  1e-153  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.09392  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4160  HNH nuclease  79.67 
 
 
358 aa  542  1e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.874339  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0859  HNH nuclease  82.42 
 
 
370 aa  540  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0115605  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1563  HNH endonuclease  80 
 
 
362 aa  539  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.010402  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3934  HNH nuclease  77.56 
 
 
420 aa  529  1e-149  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1371  HNH nuclease  80.29 
 
 
373 aa  528  1e-149  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3430  HNH nuclease  76.14 
 
 
379 aa  526  1e-148  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4018  HNH endonuclease  76.58 
 
 
357 aa  523  1e-147  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1150  HNH nuclease  72.7 
 
 
374 aa  514  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1342  HNH nuclease  77.62 
 
 
382 aa  513  1e-144  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.435035  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4158  HNH nuclease  76.27 
 
 
359 aa  512  1e-144  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.416299  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4134  HNH nuclease  74.66 
 
 
361 aa  507  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.276334  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3119  HNH nuclease  75.28 
 
 
357 aa  497  1e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.134297  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3550  HNH nuclease  76.88 
 
 
416 aa  489  1e-137  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00633328  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3494  HNH nuclease  73.82 
 
 
355 aa  468  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4159  HNH endonuclease  72.46 
 
 
334 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.114592  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4259  HNH nuclease  53.61 
 
 
346 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4239  HNH endonuclease  54.42 
 
 
372 aa  332  8e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0816  HNH endonuclease  53.07 
 
 
355 aa  318  6e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.266631 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3987  HNH endonuclease  51.53 
 
 
359 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4099  HNH endonuclease  49.87 
 
 
384 aa  311  1e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4262  HNH endonuclease  52.25 
 
 
372 aa  304  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4128  HNH endonuclease  52.79 
 
 
334 aa  304  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2900  HNH endonuclease  52.98 
 
 
336 aa  303  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0011728 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4281  HNH endonuclease  51.52 
 
 
357 aa  303  3.0000000000000004e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2115  HNH endonuclease  49.29 
 
 
322 aa  296  3e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4129  HNH endonuclease  50.27 
 
 
386 aa  289  4e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1760  HNH endonuclease  46.09 
 
 
387 aa  272  6e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3020  hypothetical protein  91.55 
 
 
160 aa  266  5.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.765456  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1468  HNH nuclease  82.24 
 
 
179 aa  236  4e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0419266  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1700  HNH endonuclease  33.61 
 
 
388 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00106635  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1516  HNH endonuclease  34.6 
 
 
390 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000144845  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3075  HNH endonuclease  33.8 
 
 
391 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00244275  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3400  HNH endonuclease  33.24 
 
 
390 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00340791  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0998  HNH endonuclease  32.87 
 
 
387 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.638291  normal  0.453877 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1449  HNH endonuclease  34.26 
 
 
391 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.964003  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0411  HNH endonuclease  34.07 
 
 
391 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.732707 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1431  HNH endonuclease  32.67 
 
 
388 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.535031  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4158  HNH endonuclease  32.95 
 
 
388 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0493415 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3198  HNH endonuclease  32.04 
 
 
388 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1632  HNH endonuclease  32.96 
 
 
388 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.437118  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3791  HNH endonuclease  33.23 
 
 
362 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.352304 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0451  hypothetical protein  43.41 
 
 
249 aa  123  6e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.446853 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3850  HNH endonuclease  33.01 
 
 
461 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1300  HNH endonuclease  32.33 
 
 
316 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.409984  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2146  hypothetical protein  33.89 
 
 
414 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.585384  normal  0.0437716 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0450  HNH endonuclease  32.31 
 
 
390 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.480855 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3039  HNH endonuclease  31.41 
 
 
309 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.572998  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1332  HNH endonuclease  38.41 
 
 
264 aa  97.4  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.146487  normal  0.232691 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0344  HNH endonuclease  43.65 
 
 
188 aa  90.5  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.557879  normal  0.69024 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3022  HNH endonuclease  37.5 
 
 
308 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2410  HNH endonuclease  38.32 
 
 
176 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.618861  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3738  hypothetical protein  40.7 
 
 
308 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.381114  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1335  HNH endonuclease  34.31 
 
 
321 aa  62  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6399  stress protein  41.79 
 
 
560 aa  60.8  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266447  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0461  HNH endonuclease  41.18 
 
 
206 aa  59.3  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0161278  hitchhiker  0.0046419 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1080  HNH endonuclease  32.95 
 
 
228 aa  58.2  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0178518  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1269  HNH endonuclease domain-containing protein  38.71 
 
 
232 aa  55.5  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000309683  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2814  HNH endonuclease  42.25 
 
 
177 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0623363 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4081  HNH endonuclease  43.94 
 
 
169 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0876  HNH nuclease  40.48 
 
 
218 aa  54.3  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0855  HNH endonuclease  36.23 
 
 
230 aa  52.8  0.000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000164704  hitchhiker  0.000000000578298 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1013  HNH endonuclease  32.1 
 
 
189 aa  49.3  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0063565 
 
 
-
 
NC_004310  BR1643  HNH endonuclease family protein  36.36 
 
 
190 aa  48.5  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1591  HNH endonuclease family protein  36.36 
 
 
190 aa  48.5  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.301685  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5662  HNH endonuclease  37.5 
 
 
171 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3479  HNH endonuclease  36.92 
 
 
169 aa  48.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0281943  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3843  HNH endonuclease  32.5 
 
 
196 aa  47  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4001  hypothetical protein  31.17 
 
 
185 aa  47.4  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4460  HNH endonuclease  29.13 
 
 
181 aa  46.6  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.282325  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3157  HNH endonuclease  25.14 
 
 
441 aa  47  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000184807  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1272  HNH endonuclease  36.36 
 
 
190 aa  46.6  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3201  HNH endonuclease  26.92 
 
 
186 aa  46.6  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.177111  normal  0.769466 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3103  HNH endonuclease  33.33 
 
 
189 aa  46.6  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.220092 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0579  HNH endonuclease  48.08 
 
 
123 aa  45.4  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0365156  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2350  HNH endonuclease  30.26 
 
 
188 aa  45.8  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.459711  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2524  HNH endonuclease  31.58 
 
 
216 aa  45.8  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.434338 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0745  HNH endonuclease  37.14 
 
 
191 aa  45.1  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0007  HNH endonuclease  43.14 
 
 
162 aa  44.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0478  HNH endonuclease  35.62 
 
 
185 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3308  HNH endonuclease  32.89 
 
 
211 aa  45.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.329837  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0613  HNH endonuclease  37.14 
 
 
185 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3490  HNH endonuclease  35.62 
 
 
185 aa  45.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3083  HNH endonuclease  30 
 
 
188 aa  45.1  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.342454  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3553  HNH endonuclease  30.26 
 
 
185 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.367592  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3846  HNH endonuclease  30.26 
 
 
185 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.895408  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1966  HNH endonuclease  30.77 
 
 
198 aa  44.7  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00730089  normal  0.446836 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0342  HNH endonuclease  35.62 
 
 
185 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.440485  normal  0.426528 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3024  HNH endonuclease  29.58 
 
 
185 aa  44.3  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7339  HNH endonuclease  36.36 
 
 
180 aa  43.9  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539168  hitchhiker  0.000174655 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1583  HNH endonuclease  43.14 
 
 
166 aa  43.9  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2202  HNH nuclease  38.81 
 
 
165 aa  43.5  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.815076 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>