151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0344 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0344  carbonic anhydrase  100 
 
 		 163 aa  332  1e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.677491  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35320  carbonic anhydrase  74.85 
 
 		 163 aa  257  4e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0672264  normal  0.58662 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0216  carbonic anhydrase  47.85 
 
 		 162 aa  178  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.202706  normal  0.234797 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2270  carbonic anhydrase  49.38 
 
 		 163 aa  179  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.397664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2774  carbonic anhydrase  50 
 
 		 162 aa  178  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4424  carbonic anhydrase  50.62 
 
 		 163 aa  178  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3284  carbonic anhydrase  49.69 
 
 		 163 aa  177  4.999999999999999e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3921  carbonic anhydrase  48.77 
 
 		 163 aa  176  9e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.348754  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2353  carbonic anhydrase  50 
 
 		 174 aa  176  9e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.157586  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3995  carbonic anhydrase  48.77 
 
 		 163 aa  176  9e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00734118  normal  0.767989 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3936  carbonic anhydrase  48.77 
 
 		 163 aa  176  9e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.186955 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0861  carbonic anhydrase  50.92 
 
 		 181 aa  175  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.677611 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4469  carbonic anhydrase  50.92 
 
 		 164 aa  170  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2947  carbonic anhydrase  47.53 
 
 		 164 aa  168  4e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.609065  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2645  carbonic anhydrase  51.23 
 
 		 163 aa  167  5e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.334819 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0708  carbonic anhydrase  50.97 
 
 		 205 aa  164  5e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2393  carbonic anhydrase  47.24 
 
 		 164 aa  164  5.9999999999999996e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.442285  normal  0.447491 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11310  hypothetical protein  46.91 
 
 		 163 aa  163  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4355  carbonic anhydrase  46.63 
 
 		 163 aa  155  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5906  carbonic anhydrase  51.47 
 
 		 192 aa  155  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46464  normal  0.626114 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0111  carbonic anhydrase-related protein  41.1 
 
 		 165 aa  130  1.0000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.159855  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1800  hypothetical protein  40.85 
 
 		 165 aa  123  1e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.157179  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1601  carbonic anhydrase  40.24 
 
 		 165 aa  121  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.972482 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4023  carbonic anhydrase  36.42 
 
 		 134 aa  118  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1333  carbonic anhydrase  39.39 
 
 		 165 aa  116  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.454871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1891  carbonic anhydrase  41.29 
 
 		 193 aa  116  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2834  carbonic anhydrase  38.89 
 
 		 198 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.130165  normal  0.144825 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2619  carbonic anhydrase, putative  36.22 
 
 		 192 aa  108  3e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.358215 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0910  carbonic anhydrase  35.71 
 
 		 197 aa  108  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.308845  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1310  carbonic anhydrase  36.59 
 
 		 165 aa  106  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1341  carbonic anhydrase  37.08 
 
 		 193 aa  105  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.587905  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57799  predicted protein  38.89 
 
 		 162 aa  104  4e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.339062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3687  carbonic anhydrase  39.13 
 
 		 141 aa  104  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.127217  normal  0.010333 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0910  carbonic anhydrase, putative  38.12 
 
 		 192 aa  103  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165973  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1431  carbonic anhydrase  36.31 
 
 		 194 aa  101  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.193943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7083  putative carbonate hydratase  37.58 
 
 		 164 aa  100  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1529  carbonic anhydrase  35.98 
 
 		 193 aa  100  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.35811  normal  0.123592 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1027  carbonic anhydrase  42.34 
 
 		 179 aa  96.7  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0168514  normal  0.661784 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3304  carbonic anhydrase  35.58 
 
 		 175 aa  87  9e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3273  carbonic anhydrase  36.91 
 
 		 189 aa  85.9  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.694792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2132  carbonic anhydrase, putative  35.58 
 
 		 167 aa  84.7  6e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2952  carbonic anhydrase  34.56 
 
 		 166 aa  83.6  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.437593  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1672  carbonic anhydrase  36.03 
 
 		 179 aa  80.9  0.000000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0022086 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1375  carbonic anhydrase  30.34 
 
 		 157 aa  80.9  0.000000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.333229  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2390  carbonic anhydrase  35.56 
 
 		 166 aa  80.1  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0603112  normal  0.371663 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0579  carbonic anhydrase  29.66 
 
 		 150 aa  79  0.00000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0544  carbonic anhydrase  28.97 
 
 		 150 aa  78.6  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0618446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0294  carbonic anhydrase  30.34 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.202596  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6172  carbonic anhydrase  31.79 
 
 		 180 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0885188  decreased coverage  0.000818733 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2168  carbonic anhydrase  30.82 
 
 		 185 aa  73.9  0.0000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0207  carbonic anhydrase  28.3 
 
 		 172 aa  73.6  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.329295  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2322  carbonic anhydrase  30.22 
 
 		 180 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2767  carbonic anhydrase  31.43 
 
 		 182 aa  71.6  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1887  carbonic anhydrase  30.43 
 
 		 180 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0609  carbonic anhydrase  29.45 
 
 		 150 aa  71.6  0.000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1464  carbonic anhydrase  26.58 
 
 		 180 aa  70.5  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4373  carbonic anhydrase  32.16 
 
 		 180 aa  69.3  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0784956 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2031  carbonic anhydrase  33.33 
 
 		 291 aa  69.3  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0949457  normal  0.0961352 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2035  carbonic anhydrase  42.68 
 
 		 90 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0774  carbonic anhydrase  31.52 
 
 		 181 aa  67.8  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1166  carbonic anhydrase  29.65 
 
 		 180 aa  64.7  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.991497 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4628  carbonic anhydrase  26.37 
 
 		 187 aa  64.3  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3320  carbonic anhydrase  28.26 
 
 		 180 aa  63.9  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0321  putative carbonic anhydrase, prokaryotic type  28.65 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1668  carbonic anhydrase  32.48 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4919  putative carbonic anhydrase, prokaryotic type  25.27 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4948  carbonic anhydrase  25.27 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4689  carbonic anhydrase  25.27 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4527  carbonic anhydrase; carbonate dehydratase  25.27 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4546  carbonic anhydrase; carbonate dehydratase  25.27 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4933  putative carbonic anhydrase, prokaryotic type  25.27 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4912  putative carbonic anhydrase, prokaryotic type  25.27 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5049  carbonic anhydrase  25.27 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0410  carbonic anhydrase  24.53 
 
 		 186 aa  62.8  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4730  carbonic anhydrase  31.14 
 
 		 184 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.840642  normal  0.685326 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3463  carbonic anhydrase  24.73 
 
 		 187 aa  62  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1125  carbonic anhydrase  27.65 
 
 		 180 aa  61.6  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1254  carbonic anhydrase  27.65 
 
 		 180 aa  61.2  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000271417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1186  carbonic anhydrase  27.65 
 
 		 180 aa  61.2  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0414  carbonic anhydrase  25.47 
 
 		 190 aa  60.5  0.000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0809  carbonic anhydrase, putative  28.26 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.914808  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4911  carbonic anhydrase  26.37 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0014  carbonate dehydratase  27.5 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0397  carbonic anhydrase  28.48 
 
 		 190 aa  57.8  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2003  carbonic anhydrase  28.48 
 
 		 256 aa  53.1  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000744018  normal  0.230248 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4620  carbonic anhydrase  29.61 
 
 		 234 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1700  carbonic anhydrase  29.6 
 
 		 237 aa  52.8  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2753  carbonic anhydrase  32.45 
 
 		 236 aa  52  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2034  carbonic anhydrase  31.31 
 
 		 109 aa  50.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0752  hypothetical protein  34.43 
 
 		 768 aa  50.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0734  hypothetical protein  34.43 
 
 		 768 aa  50.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2275  carbonic anhydrase  28.37 
 
 		 231 aa  50.4  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0800  carbonic anhydrase  32.23 
 
 		 221 aa  50.1  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000181873  normal  0.299491 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7305  carbonic anhydrase  27.92 
 
 		 234 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6172  putative carbonic anhydrase  26.14 
 
 		 246 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.114722 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0405  carbonic anhydrase  30.63 
 
 		 215 aa  49.3  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.481966  normal  0.0139247 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0790  carbonic anhydrase  28.74 
 
 		 234 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.518522 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1182  carbonic anhydrase  38.03 
 
 		 204 aa  48.9  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0271788  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5352  carbonic anhydrase  32 
 
 		 245 aa  48.5  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.541632  normal  0.601447 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6530  Carbonate dehydratase  25.9 
 
 		 221 aa  48.5  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.460093  normal  0.148465 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>