39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0207 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_0207  methane/phenol/toluene hydroxylase  100 
 
 		 331 aa  682    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3362  phenol 2-monooxygenase  77.64 
 
 		 331 aa  550  1e-155  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2795  methane/phenol/toluene hydroxylase  77.88 
 
 		 331 aa  550  1e-155  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.31371 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4630  Phenol 2-monooxygenase  73.35 
 
 		 335 aa  509  1e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3554  Phenol 2-monooxygenase  73.35 
 
 		 335 aa  509  1e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5681  methane/phenol/toluene hydroxylase  70.96 
 
 		 335 aa  494  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1330  methane/phenol/toluene hydroxylase  67.48 
 
 		 331 aa  490  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.835749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2970  methane/phenol/toluene hydroxylase  65.45 
 
 		 331 aa  461  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.493963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3115  Phenol 2-monooxygenase  59.19 
 
 		 327 aa  422  1e-117  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30750  Multi-component phenol hydoxylase, beta subunit; LapL  56.67 
 
 		 330 aa  384  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2284  phenol hydrolase beta subunit  53.75 
 
 		 332 aa  358  9e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3796  methane/phenol/toluene hydroxylase  49.7 
 
 		 329 aa  346  4e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0518853  hitchhiker  0.00260519 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1786  methane/phenol/toluene hydroxylase  48.04 
 
 		 331 aa  334  1e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1700  methane/phenol/toluene hydroxylase  48.33 
 
 		 340 aa  330  3e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3308  phenol hydrolase beta subunit  46.93 
 
 		 331 aa  312  4.999999999999999e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3310  phenol 2-monooxygenase  46.08 
 
 		 331 aa  296  3e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08850  Phenol hydroxylase subunit P1  47.75 
 
 		 332 aa  294  2e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0524  Phenol 2-monooxygenase  36.71 
 
 		 342 aa  181  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1379  methane/phenol/toluene hydroxylase  23.9 
 
 		 351 aa  63.2  0.000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.633988  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1594  putative methane/phenol/toluene hydroxylase (monooxygenase)  23.25 
 
 		 341 aa  62.8  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392332  normal  0.716705 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2794  putative monooxygenase beta subunit  22.18 
 
 		 352 aa  60.8  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1506  methane/phenol/toluene hydroxylase  22.18 
 
 		 352 aa  60.8  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.324746 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5675  methane/phenol/toluene hydroxylase  24.71 
 
 		 332 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4636  methane/phenol/toluene hydroxylase  22.4 
 
 		 329 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4809  methane monooxygenase  22.3 
 
 		 349 aa  58.5  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3560  methane/phenol/toluene hydroxylase  22.4 
 
 		 329 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0952  propane monoxygenase hydroxylase small subunit  23.86 
 
 		 365 aa  54.7  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.932834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0818  toluene monooxygenase beta subunit  27.23 
 
 		 328 aa  55.1  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2543  toluene monooxygenase beta subunit  24.12 
 
 		 328 aa  52  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.634156 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3395  methane/phenol/toluene hydroxylase  21.96 
 
 		 361 aa  51.2  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.354278  normal  0.089822 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3816  methane/phenol/toluene hydroxylase  24.03 
 
 		 328 aa  50.8  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126401  normal  0.061114 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4409  methane/phenol/toluene hydroxylase  23.93 
 
 		 361 aa  50.4  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.738489 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1649  methane/phenol/toluene hydroxylase  21.93 
 
 		 357 aa  50.1  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3632  putative methane/phenol/toluene monooxygenase (A subunit, beta chain)  22.65 
 
 		 364 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.564213 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1263  Methane monooxygenase  22.52 
 
 		 391 aa  47.4  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1312  methane/phenol/toluene hydroxylase  23.63 
 
 		 328 aa  47.8  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.180258 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2518  methane/phenol/toluene hydroxylase  23.26 
 
 		 367 aa  44.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.692881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0215  methane/phenol/toluene hydroxylase  24.33 
 
 		 341 aa  43.5  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.248758 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3553  methane/phenol/toluene hydroxylase  22.76 
 
 		 368 aa  42.7  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.401099  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>