More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1967 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1967  glutamine synthetase catalytic region  100 
 
 		 455 aa  887    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.333902  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0315  L-glutamine synthetase  44.93 
 
 		 525 aa  343  2.9999999999999997e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.432555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6502  glutamine synthetase catalytic region  46.14 
 
 		 496 aa  340  2e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.415769  normal  0.198271 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5786  glutamine synthetase catalytic region  45.5 
 
 		 442 aa  305  1.0000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0233  glutamine synthetase, catalytic region  41.61 
 
 		 437 aa  259  9e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0719706  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0243  glutamine synthetase, catalytic region  41.61 
 
 		 437 aa  259  9e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.680627 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0223  glutamine synthetase, catalytic region  41.61 
 
 		 437 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.395034  normal  0.155489 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3319  glutamine synthetase, catalytic region  38.55 
 
 		 453 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.537812  normal  0.0587304 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2754  glutamine synthetase, catalytic region  38.64 
 
 		 450 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2798  glutamine synthetase, catalytic region  38.64 
 
 		 450 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.726045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2784  glutamine synthetase, catalytic region  38.64 
 
 		 450 aa  243  5e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2920  glutamine synthetase, catalytic region  39.05 
 
 		 442 aa  241  2e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0328633 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11906  glutamine synthetase glnA3  37.24 
 
 		 450 aa  237  3e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0173  glutamine synthetase catalytic region  41.22 
 
 		 452 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6309  putative glutamine synthetase  33.18 
 
 		 443 aa  179  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542991  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72690  putative glutamine synthetase  33.71 
 
 		 443 aa  173  5e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0153069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4681  L-glutamine synthetase  28.77 
 
 		 451 aa  172  9e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.455375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0201  glutamine synthetase catalytic region  30.14 
 
 		 448 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0281454  normal  0.125698 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2916  glutamate-ammonia ligase  31.35 
 
 		 469 aa  165  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.20359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4491  glutamine synthetase catalytic region  31.32 
 
 		 444 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0411429  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7851  glutamine synthetase catalytic region  33.64 
 
 		 439 aa  160  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2057  glutamine synthetase, catalytic region  30.73 
 
 		 443 aa  157  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3286  hypothetical protein  30.66 
 
 		 441 aa  149  8e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0169038 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5349  glutamine synthetase catalytic region  28.31 
 
 		 437 aa  147  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.791079 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2273  glutamine synthetase, type I  27.21 
 
 		 443 aa  147  6e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  28.82 
 
 		 444 aa  145  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3759  glutamine synthetase, type I  29.68 
 
 		 444 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000109487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2389  glutamine synthetase, type I  30.51 
 
 		 448 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000201555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3754  glutamine synthetase, type I  26.67 
 
 		 444 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149768  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3549  glutamine synthetase, type I  26.67 
 
 		 444 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3449  glutamine synthetase, type I  26.67 
 
 		 444 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3462  glutamate--ammonia ligase (glutamine synthetase, type I)  26.67 
 
 		 444 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3713  glutamine synthetase, type I  26.67 
 
 		 444 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53476e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3833  glutamine synthetase, type I  26.67 
 
 		 444 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3760  glutamine synthetase, type I  28.75 
 
 		 443 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000185172  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3731  glutamine synthetase, type I  26.44 
 
 		 444 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  28.38 
 
 		 450 aa  139  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2178  glutamine synthetase, type I  26.78 
 
 		 444 aa  139  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.588108  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3469  glutamine synthetase, type I  26.67 
 
 		 444 aa  138  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00616587  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2027  glutamine synthetase, type I  28.07 
 
 		 443 aa  138  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.123659  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1297  L-glutamine synthetase  28.71 
 
 		 443 aa  138  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000250879  normal  0.0655165 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3803  glutamine synthetase, type I  26.67 
 
 		 444 aa  138  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1502  glutamine synthetase, type I  26.67 
 
 		 444 aa  138  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0398754 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3850  Glutamate--ammonia ligase  27.05 
 
 		 453 aa  137  3.0000000000000003e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.274285  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2381  glutamine synthetase, type I  26.44 
 
 		 444 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3702  glutamate--ammonia ligase  28.8 
 
 		 443 aa  137  5e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.928007 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1007  glutamate--ammonia ligase  27.6 
 
 		 442 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000328264  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3524  glutamate--putrescine ligase  27.71 
 
 		 444 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.435958  normal  0.190458 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1901  L-glutamine synthetase  30.11 
 
 		 454 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.643842  normal  0.247036 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2135  glutamine synthetase, type I  30.59 
 
 		 442 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  26.08 
 
 		 444 aa  134  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0628  glutamine synthetase, type I  30.67 
 
 		 443 aa  134  3.9999999999999996e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0694416  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1181  L-glutamine synthetase  27.13 
 
 		 451 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1252  L-glutamine synthetase  28.24 
 
 		 450 aa  133  6e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  28.07 
 
 		 444 aa  133  9e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5299  glutamine synthetase, putative  27.47 
 
 		 460 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.802661  normal  0.238566 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  29.71 
 
 		 445 aa  132  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0634  glutamine synthetase, type I  27.96 
 
 		 444 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.144254  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1466  glutamine synthetase, type I  26.79 
 
 		 446 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5347  glutamate--putrescine ligase  27.47 
 
 		 460 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107252 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2480  glutamine synthetase, type I  27.74 
 
 		 452 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21290  glutamine synthetase, type I  27.1 
 
 		 441 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0204015  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5208  glutamate--putrescine ligase  27.47 
 
 		 460 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.179896  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2819  glutamine synthetase, type I  29.18 
 
 		 448 aa  131  3e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0453  glutamine synthetase, type I  26.79 
 
 		 446 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0770  glutamine synthetase, type I  27.06 
 
 		 450 aa  130  4.0000000000000003e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127283 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1799  glutamine synthetase, type I  25.75 
 
 		 439 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.743478  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4807  glutamine synthetase, type III  30.6 
 
 		 432 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.602864  normal  0.0371465 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2806  glutamine synthetase, type I  27.33 
 
 		 449 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1297  glutamate--putrescine ligase  29.08 
 
 		 463 aa  130  6e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.770979  normal  0.671991 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0994  glutamine synthetase, type I  28.44 
 
 		 442 aa  130  6e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1939  glutamate--putrescine ligase  29.49 
 
 		 467 aa  130  7.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0199472  normal  0.0178394 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1667  glutamine synthetase, catalytic region  27.25 
 
 		 474 aa  129  8.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2374  glutamine synthetase, type I  26.93 
 
 		 456 aa  129  8.000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.943832  normal  0.417951 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4677  glutamine synthetase family protein  28.06 
 
 		 456 aa  129  9.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5408  L-glutamine synthetase  27.43 
 
 		 458 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.532857  hitchhiker  0.00182517 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2711  glutamine synthetase, type I  28.94 
 
 		 442 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2117  glutamine synthetase, type I  25.75 
 
 		 444 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1603  glutamate--ammonia ligase  28.24 
 
 		 468 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0361504 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04819  Protein fluG [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P38094]  27.88 
 
 		 865 aa  127  3e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.385753  normal  0.68223 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2807  glutamine synthetase, type I  26.95 
 
 		 444 aa  128  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0737852  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4024  Glutamate--putrescine ligase  27.09 
 
 		 471 aa  127  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.283085 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48880  glutamine synthetase  26.56 
 
 		 458 aa  127  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0009  glutamine synthetase, type I  29.58 
 
 		 447 aa  127  3e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1135  glutamate--ammonia ligase  27.97 
 
 		 432 aa  127  5e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.46603 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2270  L-glutamine synthetase  25.06 
 
 		 440 aa  127  5e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.327087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1836  L-glutamine synthetase  29.28 
 
 		 439 aa  127  6e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.406794 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6419  glutamate--putrescine ligase  26.92 
 
 		 444 aa  127  6e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19880  L-glutamine synthetase  28.05 
 
 		 444 aa  127  6e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2566  glutamate--putrescine ligase  28.31 
 
 		 452 aa  126  6e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0174  glutamate--putrescine ligase  26.81 
 
 		 460 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293825 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0384  L-glutamine synthetase  25.87 
 
 		 446 aa  126  8.000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.882152  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1340  Glutamate--putrescine ligase  29.23 
 
 		 464 aa  126  8.000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0456  glutamine synthetase catalytic region  26.02 
 
 		 431 aa  126  9e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000119779 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0110  glutamine synthetase, catalytic region  26.74 
 
 		 458 aa  126  9e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5914  glutamate--ammonia ligase  26.7 
 
 		 444 aa  126  9e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2122  L-glutamine synthetase  27.31 
 
 		 458 aa  125  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0668807  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2099  glutamine synthetase, type I  29.9 
 
 		 447 aa  125  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1689  glutamine synthetase, type I  28.8 
 
 		 441 aa  125  1e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.394056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1739  glutamate--putrescine ligase  29.2 
 
 		 454 aa  126  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000378796 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>