More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0817 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0817  Magnesium chelatase  100 
 
 
607 aa  1135    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.19805  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5368  Sigma 54 interacting domain protein  34.78 
 
 
614 aa  269  1e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03742  chelatase protein  34.65 
 
 
637 aa  244  3.9999999999999997e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.84057 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0291  magnesium chelatase, ChlI subunit  30.87 
 
 
680 aa  237  4e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.129294 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2117  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  37.59 
 
 
622 aa  234  3e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0165109 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2054  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  37.59 
 
 
622 aa  234  3e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.457872  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2071  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  37.59 
 
 
622 aa  234  3e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498251  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2772  magnesium chelatase  45.87 
 
 
333 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2302  magnesium chelatase  36.1 
 
 
638 aa  229  1e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2423  magnesium chelatase  48.4 
 
 
340 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.536796  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3380  magnesium chelatase  31.45 
 
 
594 aa  226  7e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.193165 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1277  Magnesium chelatase  32.62 
 
 
650 aa  226  9e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.951784  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3506  magnesium chelatase  49.63 
 
 
337 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0248743  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2270  magnesium chelatase  44.58 
 
 
337 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4585  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  44.63 
 
 
335 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0751  magnesium chelatase subunit D/I family protein  41.22 
 
 
309 aa  208  2e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.426772  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4481  Magnesium chelatase  39.71 
 
 
314 aa  206  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.925614  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3097  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  43.77 
 
 
333 aa  204  5e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1020  cobaltochelatase subunit  32.57 
 
 
653 aa  202  1.9999999999999998e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.816011  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2088  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  30.43 
 
 
600 aa  198  3e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25990  putative magnesium chelatase  48.86 
 
 
337 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0838506  normal  0.479332 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0750  magnesium chelatase subunit D/I family protein  25.55 
 
 
643 aa  195  2e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3014  magnesium chelatase, ChlI subunit  47.41 
 
 
344 aa  193  9e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.397275  normal  0.647492 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2350  magnesium chelatase, ChlI subunit  47.39 
 
 
566 aa  192  1e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.252625  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3148  magnesium chelatase, subunit ChII, putative  44.12 
 
 
342 aa  192  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.210132  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0713  magnesium chelatase ATPase subunit I  40.76 
 
 
362 aa  191  2e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2221  putative magnesium chelatase  55.15 
 
 
336 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0556  Magnesium chelatase  39.23 
 
 
346 aa  188  2e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1952  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  39.81 
 
 
362 aa  188  3e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0857411  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1700  Sigma 54 interacting domain protein  48.07 
 
 
618 aa  188  3e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.808868  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0276  magnesium chelatase, ChlI subunit  28.47 
 
 
619 aa  186  8e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0650073  normal  0.0615582 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0497  magnesium chelatase  37.46 
 
 
346 aa  186  9e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0414874  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3280  magnesium chelatase ATPase subunit I  37.85 
 
 
373 aa  186  1.0000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0159  Magnesium chelatase  35.34 
 
 
705 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11601  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  39.17 
 
 
362 aa  186  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11611  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  39.17 
 
 
362 aa  186  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11461  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  38.54 
 
 
362 aa  184  3e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.134782  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2083  magnesium chelatase  37.97 
 
 
337 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1066  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  38.85 
 
 
362 aa  183  7e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1645  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  47.73 
 
 
357 aa  183  7e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000343633  normal  0.0310882 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3097  magnesium chelatase  39.23 
 
 
364 aa  183  8.000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.822319  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0648  magnesium chelatase ATPase subunit I  38.7 
 
 
357 aa  183  9.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1519  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  37.27 
 
 
374 aa  182  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0208517  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2505  magnesium chelatase ATPase subunit I  39.23 
 
 
337 aa  182  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.57993  normal  0.244137 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2433  magnesium chelatase ATPase subunit I  39.55 
 
 
337 aa  182  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2299  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  45.12 
 
 
788 aa  182  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.291711  normal  0.0239656 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2728  magnesium chelatase ATPase subunit I  39.55 
 
 
337 aa  182  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.111269 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2274  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  31.77 
 
 
677 aa  181  2.9999999999999997e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11361  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  39.56 
 
 
362 aa  181  4e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.810628 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3151  magnesium chelatase  50 
 
 
342 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0698  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  39.24 
 
 
362 aa  180  5.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15321  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  39.24 
 
 
362 aa  180  5.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0454  magnesium chelatase ATPase subunit I  37.97 
 
 
358 aa  179  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0229  magnesium chelatase  36.42 
 
 
637 aa  179  1e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0467  magnesium chelatase ATPase subunit I  37.97 
 
 
358 aa  179  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.571149  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0583  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  38.08 
 
 
364 aa  177  3e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00224642  normal  0.0296662 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0970  magnesium chelatase ATPase subunit I  36.92 
 
 
369 aa  178  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.726798  normal  0.50852 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3622  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  37.42 
 
 
405 aa  178  3e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3502  magnesium chelatase subunit I  37.82 
 
 
334 aa  177  3e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.602006  normal  0.630421 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0498  magnesium chelatase  33.28 
 
 
612 aa  178  3e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.141561  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5002  Magnesium chelatase  48.7 
 
 
358 aa  178  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00344317  hitchhiker  0.0000241174 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0375  magnesium chelatase  36.1 
 
 
637 aa  177  4e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.165558  normal  0.638672 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13860  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  41.73 
 
 
351 aa  177  4e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1208  magnesium chelatase  38.68 
 
 
372 aa  177  4e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0449  magnesium chelatase  39.12 
 
 
669 aa  176  9e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0156382  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17760  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  42.63 
 
 
674 aa  175  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.715479 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0125  magnesium chelatase  33.76 
 
 
356 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00707202  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4050  magnesium chelatase  43.48 
 
 
626 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0485  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  40.95 
 
 
394 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0861468  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1620  magnesium chelatase ATPase subunit D  31.63 
 
 
621 aa  173  7.999999999999999e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4158  magnesium chelatase  41.61 
 
 
776 aa  172  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0127951  normal  0.72272 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1420  magnesium chelatase  40.19 
 
 
364 aa  172  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79128  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1577  magnesium chelatase  42.64 
 
 
360 aa  172  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275464  normal  0.343579 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6039  Magnesium chelatase  35.22 
 
 
719 aa  171  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1047  magnesium chelatase ATPase subunit D  29.43 
 
 
618 aa  171  3e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1021  Magnesium chelatase  38.06 
 
 
347 aa  171  4e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1178  magnesium chelatase, ChlI subunit  46.84 
 
 
358 aa  171  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1658  magnesium chelatase  46.84 
 
 
358 aa  171  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1558  magnesium chelatase  44.41 
 
 
364 aa  170  8e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1835  magnesium chelatase ATPase subunit I  40.31 
 
 
336 aa  170  9e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.053644 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5745  magnesium chelatase  47.49 
 
 
386 aa  169  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000475709 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0636  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  40.26 
 
 
616 aa  169  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.122113  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2134  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  50.73 
 
 
674 aa  168  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.118601  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1622  magnesium chelatase ATPase subunit I  38.72 
 
 
341 aa  168  2.9999999999999998e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0108  magnesium chelatase  33.01 
 
 
356 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.013372  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12865  magnesium chelatase  45.79 
 
 
629 aa  167  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.498334  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3731  magnesium chelatase ATPase subunit I  39.6 
 
 
368 aa  167  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.786606  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2068  magnesium chelatase ATPase subunit I  39.18 
 
 
341 aa  167  6.9999999999999995e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.876863 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1910  Magnesium chelatase  39.23 
 
 
660 aa  166  9e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1776  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  34.52 
 
 
688 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119495  Magnesium-protoporyphyrin IX chelatase subunit chlI  36.68 
 
 
397 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0612628  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0785  magnesium chelatase ATPase subunit I  36.14 
 
 
384 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.98065  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08951  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  39.49 
 
 
363 aa  165  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.469371 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1632  magnesium chelatase  47.27 
 
 
358 aa  165  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0600916 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1631  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  36.79 
 
 
386 aa  164  3e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.374894  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1262  magnesium chelatase  34.35 
 
 
345 aa  164  6e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.885997  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1796  magnesium chelatase ATPase subunit I  35.87 
 
 
391 aa  163  8.000000000000001e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1693  magnesium chelatase ATPase subunit I  39.37 
 
 
340 aa  163  9e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.578375  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2406  magnesium-chelatase subunit D/I family protein  60.56 
 
 
416 aa  162  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0736001  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2084  magnesium chelatase  29.85 
 
 
617 aa  163  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.191813  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>