More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0112 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_0112  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 		 407 aa  804    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000289227  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2103  sodium:dicarboxylate symporter family protein  38.93 
 
 		 413 aa  295  8e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.151657  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1463  sodium:dicarboxylate symporter family protein  38.68 
 
 		 413 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0518  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family protein  38.68 
 
 		 413 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1845  sodium:dicarboxylate symporter family protein  38.68 
 
 		 413 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0832  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family protein  38.68 
 
 		 413 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0421  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family protein  38.68 
 
 		 413 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2148  sodium:dicarboxylate symporter family protein  38.68 
 
 		 413 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7251  Sodium-dicarboxylate symporter  42.12 
 
 		 402 aa  288  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1555  proton/glutamate symporter family protein  39.75 
 
 		 423 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000396651  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1666  proton/sodium-glutamate symporter  38.67 
 
 		 423 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1613  proton/sodium-glutamate symport protein  38.67 
 
 		 423 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6701  sodium:dicarboxylate symporter  40.05 
 
 		 412 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.85411 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1799  proton/sodium-glutamate symporter  38.67 
 
 		 423 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1846  proton/sodium-glutamate symporter  38.67 
 
 		 423 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00724946 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1664  sodium:dicarboxylate symporter  39.16 
 
 		 423 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3531  proton/sodium-glutamate symporter  38.92 
 
 		 423 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0983  sodium:dicarboxylate symporter  36.63 
 
 		 422 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1810  proton/sodium-glutamate symporter  38.92 
 
 		 423 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1593  proton/glutamate symporter family protein  39.51 
 
 		 423 aa  273  3e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000481335  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1648  proton/sodium-glutamate symport protein  38.42 
 
 		 423 aa  274  3e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0042  glutamate/aspartate:proton symporter  39.32 
 
 		 443 aa  273  3e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192783  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1920  proton/sodium-glutamate symporter  38.92 
 
 		 423 aa  273  3e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1904  sodium:dicarboxylate symporter  38.38 
 
 		 409 aa  272  1e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.374206 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1450  proton/glutamate symporter family protein  39.26 
 
 		 423 aa  271  1e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000273308  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1524  proton/glutamate symporter family protein  39.26 
 
 		 423 aa  271  1e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.0675800000000005e-55 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1487  proton/glutamate symporter family protein  39.26 
 
 		 424 aa  270  2e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000311717  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1315  proton/sodium-glutamate symport protein  39.26 
 
 		 423 aa  270  2e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.63752e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1314  proton/sodium-glutamate symport protein  39.01 
 
 		 423 aa  271  2e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000288738  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3857  proton/glutamate symporter family protein  39.26 
 
 		 424 aa  271  2e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000638682  decreased coverage  0.00000000000134337 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6444  sodium:dicarboxylate symporter  41.34 
 
 		 401 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5578  sodium:dicarboxylate symporter  41.6 
 
 		 401 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5942  sodium:dicarboxylate symporter  41.6 
 
 		 401 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.482098 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1771  sodium:dicarboxylate symporter  38.57 
 
 		 437 aa  270  2.9999999999999997e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.975695  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1153  sodium:dicarboxylate symporter  39.11 
 
 		 423 aa  270  4e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000424647  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72340  glutamate/aspartate:proton symporter  37.71 
 
 		 444 aa  270  4e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0233  proton/glutamate symporter  37.5 
 
 		 443 aa  269  5e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6277  glutamate/aspartate:proton symporter  37.47 
 
 		 444 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0174  glutamate/aspartate:proton symporter  37.74 
 
 		 443 aa  269  7e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3259  sodium:dicarboxylate symporter  38.29 
 
 		 440 aa  269  8e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1355  sodium:dicarboxylate symporter  38.77 
 
 		 424 aa  268  1e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000159183  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0768  sodium:dicarboxylate symporter  38.87 
 
 		 444 aa  268  1e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3671  sodium:dicarboxylate symporter  38.87 
 
 		 444 aa  268  1e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0764  sodium:dicarboxylate symporter  38.29 
 
 		 435 aa  268  1e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3362  sodium:dicarboxylate symporter  38.29 
 
 		 440 aa  268  1e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3480  sodium:dicarboxylate symporter  38.62 
 
 		 444 aa  268  1e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3549  sodium:dicarboxylate symporter  38.87 
 
 		 444 aa  268  2e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6468  sodium:dicarboxylate symporter  36.39 
 
 		 442 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.955844  normal  0.0248013 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5604  sodium:dicarboxylate symporter  36.69 
 
 		 442 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5968  sodium:dicarboxylate symporter  36.69 
 
 		 442 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.431964  hitchhiker  0.00472549 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0862  sodium:dicarboxylate symporter  38.89 
 
 		 449 aa  266  4e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0137  glutamate/aspartate:proton symporter  37.62 
 
 		 442 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.926861 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2768  proton/glutamate symporter  37.82 
 
 		 430 aa  264  2e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6252  sodium:dicarboxylate symporter  35.01 
 
 		 442 aa  263  4e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  normal  0.842573 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0922  proton/glutamate symporter  38.29 
 
 		 424 aa  263  6e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0775  sodium:dicarboxylate symporter  37.22 
 
 		 432 aa  262  1e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0743  sodium:dicarboxylate symporter  38.27 
 
 		 433 aa  260  2e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0008  sodium:dicarboxylate symporter  40.15 
 
 		 439 aa  261  2e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0863  sodium:dicarboxylate symporter  36.23 
 
 		 443 aa  261  2e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5090  glutamate/aspartate:proton symporter  37.86 
 
 		 442 aa  257  3e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.293053  normal  0.123213 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1290  sodium:dicarboxylate symporter  36.96 
 
 		 443 aa  256  6e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0153  glutamate/aspartate:proton symporter  37.62 
 
 		 442 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.886104 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0155  glutamate/aspartate:proton symporter  37.62 
 
 		 442 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0616  sodium:dicarboxylate symporter  38.31 
 
 		 413 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1395  glutamate/aspartate:proton symporter  36.93 
 
 		 438 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2469  sodium:dicarboxylate symporter  38.34 
 
 		 421 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3086  Sodium/dicarboxylate symporter  36.01 
 
 		 434 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1793  glutamate/aspartate:proton symporter  36.93 
 
 		 438 aa  252  9.000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2071  sodium:dicarboxylate symporter  39.36 
 
 		 431 aa  251  2e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.840626  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1976  proton/sodium-glutamate symport protein  36.25 
 
 		 426 aa  250  3e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.809578  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1780  sodium:dicarboxylate symporter  37.25 
 
 		 435 aa  250  3e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1380  sodium:dicarboxylate symporter  37.81 
 
 		 436 aa  250  3e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4649  sodium:dicarboxylate symporter  37.19 
 
 		 437 aa  250  4e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2493  sodium:dicarboxylate symporter family protein  36.01 
 
 		 470 aa  249  4e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0585635  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0756  proton/sodium-glutamate symporter  35.52 
 
 		 421 aa  249  5e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0642378  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3205  sodium:dicarboxylate symporter  35.52 
 
 		 435 aa  249  7e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5060  sodium:dicarboxylate symporter  35.52 
 
 		 434 aa  249  8e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.154454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2242  Sodium:dicarboxylate symporter  35.48 
 
 		 419 aa  246  4e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03949  glutamate/aspartate:proton symporter  36.41 
 
 		 437 aa  246  6e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4322  glutamate/aspartate:proton symporter  36.41 
 
 		 437 aa  246  6e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4633  glutamate/aspartate:proton symporter  36.41 
 
 		 437 aa  246  6e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03909  hypothetical protein  36.41 
 
 		 437 aa  246  6e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3950  glutamate/aspartate:proton symporter  36.41 
 
 		 437 aa  246  6.999999999999999e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4598  glutamate/aspartate:proton symporter  36.41 
 
 		 437 aa  246  6.999999999999999e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5583  glutamate/aspartate:proton symporter  36.41 
 
 		 437 aa  246  6.999999999999999e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1379  C4-dicarboxylate transporter DctA  39.15 
 
 		 420 aa  246  6.999999999999999e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4540  glutamate/aspartate:proton symporter  36.41 
 
 		 437 aa  246  6.999999999999999e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3915  sodium:dicarboxylate symporter  36.41 
 
 		 437 aa  245  8e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1622  sodium:dicarboxylate symporter  35.27 
 
 		 475 aa  245  9.999999999999999e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.347157 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1845  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family protein  36.01 
 
 		 435 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.243591  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4537  glutamate/aspartate:proton symporter  35.82 
 
 		 436 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.94288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4628  glutamate/aspartate:proton symporter  35.82 
 
 		 436 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.740703 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1226  sodium:dicarboxylate symporter family protein  36.01 
 
 		 435 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0369  sodium:dicarboxylate symporter family protein  36.01 
 
 		 435 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1998  sodium:dicarboxylate symporter family protein  36.01 
 
 		 472 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236105  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1712  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family protein  36.01 
 
 		 435 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0449078  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4628  glutamate/aspartate:proton symporter  35.82 
 
 		 436 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1832  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family protein  36.01 
 
 		 435 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4543  glutamate/aspartate:proton symporter  35.82 
 
 		 436 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.707717  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0792  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family protein  36.01 
 
 		 435 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0606773  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>