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for query gene BMAA1463 on replicon NC_006349
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



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Organism name

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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008835  BMA10229_2148  sodium:dicarboxylate symporter family protein  100 
 
 
413 aa  804    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1463  sodium:dicarboxylate symporter family protein  100 
 
 
413 aa  804    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0421  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family protein  99.76 
 
 
413 aa  801    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1845  sodium:dicarboxylate symporter family protein  99.76 
 
 
413 aa  801    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0518  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family protein  99.76 
 
 
413 aa  801    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2103  sodium:dicarboxylate symporter family protein  97.82 
 
 
413 aa  788    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.151657  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0832  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family protein  100 
 
 
413 aa  804    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7251  Sodium-dicarboxylate symporter  67.83 
 
 
402 aa  498  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6701  sodium:dicarboxylate symporter  65.45 
 
 
412 aa  498  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.85411 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6444  sodium:dicarboxylate symporter  67.25 
 
 
401 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5578  sodium:dicarboxylate symporter  66.75 
 
 
401 aa  477  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5942  sodium:dicarboxylate symporter  66.75 
 
 
401 aa  477  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.482098 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0112  sodium:dicarboxylate symporter  38.68 
 
 
407 aa  281  1e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000289227  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1771  sodium:dicarboxylate symporter  31.7 
 
 
437 aa  208  1e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.975695  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2768  proton/glutamate symporter  35.28 
 
 
430 aa  206  5e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1780  sodium:dicarboxylate symporter  32.25 
 
 
435 aa  203  4e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1380  sodium:dicarboxylate symporter  30.94 
 
 
436 aa  200  3e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0746  dicarboxylate/amino acid:cation family protein  32.92 
 
 
426 aa  200  3e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.579753 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0826  transporter, dicarboxylate/amino acid:cation family  32.76 
 
 
426 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1450  proton/glutamate symporter family protein  31.26 
 
 
423 aa  199  6e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000273308  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0756  proton/sodium-glutamate symporter  30.5 
 
 
421 aa  199  6e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0642378  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1524  proton/glutamate symporter family protein  31.26 
 
 
423 aa  199  6e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.0675800000000005e-55 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1315  proton/sodium-glutamate symport protein  31.03 
 
 
423 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.63752e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2725  sodium:dicarboxylate symporter  33.01 
 
 
429 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.074747  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1355  sodium:dicarboxylate symporter  30.55 
 
 
424 aa  197  3e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000159183  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1555  proton/glutamate symporter family protein  31.03 
 
 
423 aa  197  3e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000396651  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1487  proton/glutamate symporter family protein  31.03 
 
 
424 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000311717  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1206  sodium:dicarboxylate symporter  32.06 
 
 
421 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.350362  normal  0.678051 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0137  glutamate/aspartate:proton symporter  31.72 
 
 
442 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.926861 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1314  proton/sodium-glutamate symport protein  31.03 
 
 
423 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000288738  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1153  sodium:dicarboxylate symporter  30.39 
 
 
423 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000424647  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3857  proton/glutamate symporter family protein  31.03 
 
 
424 aa  196  6e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000638682  decreased coverage  0.00000000000134337 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1593  proton/glutamate symporter family protein  31.03 
 
 
423 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000481335  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6277  glutamate/aspartate:proton symporter  30.51 
 
 
444 aa  196  9e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1613  proton/sodium-glutamate symport protein  30.96 
 
 
423 aa  194  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1664  sodium:dicarboxylate symporter  31.2 
 
 
423 aa  194  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1846  proton/sodium-glutamate symporter  30.96 
 
 
423 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00724946 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1648  proton/sodium-glutamate symport protein  30.96 
 
 
423 aa  194  3e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1810  proton/sodium-glutamate symporter  30.96 
 
 
423 aa  194  3e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3531  proton/sodium-glutamate symporter  30.96 
 
 
423 aa  194  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72340  glutamate/aspartate:proton symporter  30.27 
 
 
444 aa  194  3e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0983  sodium:dicarboxylate symporter  28.99 
 
 
422 aa  194  3e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1920  proton/sodium-glutamate symporter  30.96 
 
 
423 aa  193  4e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0616  sodium:dicarboxylate symporter  32.59 
 
 
413 aa  193  4e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1666  proton/sodium-glutamate symporter  30.71 
 
 
423 aa  193  5e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1799  proton/sodium-glutamate symporter  30.71 
 
 
423 aa  193  5e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4598  glutamate/aspartate:proton symporter  31.31 
 
 
437 aa  192  7e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5583  glutamate/aspartate:proton symporter  31.31 
 
 
437 aa  192  7e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3950  glutamate/aspartate:proton symporter  31.31 
 
 
437 aa  192  7e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4540  glutamate/aspartate:proton symporter  31.31 
 
 
437 aa  192  7e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0922  proton/glutamate symporter  32.32 
 
 
424 aa  191  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4628  glutamate/aspartate:proton symporter  30.99 
 
 
436 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.740703 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0480  Sodium:dicarboxylate symporter  32.69 
 
 
433 aa  192  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.908174  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4677  glutamate/aspartate:proton symporter  30.99 
 
 
436 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.844872  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1265  sodium:dicarboxylate symporter  32.92 
 
 
433 aa  192  1e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.623713  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4628  glutamate/aspartate:proton symporter  30.99 
 
 
436 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4537  glutamate/aspartate:proton symporter  30.99 
 
 
436 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.94288  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4543  glutamate/aspartate:proton symporter  30.99 
 
 
436 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.707717  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6139  sodium:dicarboxylate symporter  32.36 
 
 
438 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6468  sodium:dicarboxylate symporter  31.14 
 
 
442 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.955844  normal  0.0248013 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3915  sodium:dicarboxylate symporter  31.31 
 
 
437 aa  191  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2416  sodium:dicarboxylate symporter  33 
 
 
438 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.236956  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0042  glutamate/aspartate:proton symporter  31.48 
 
 
443 aa  191  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192783  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5604  sodium:dicarboxylate symporter  31.14 
 
 
442 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5968  sodium:dicarboxylate symporter  31.14 
 
 
442 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.431964  hitchhiker  0.00472549 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1855  sodium:dicarboxylate symporter  32.26 
 
 
414 aa  191  2.9999999999999997e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0008  sodium:dicarboxylate symporter  32.3 
 
 
439 aa  190  2.9999999999999997e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0764  sodium:dicarboxylate symporter  32.41 
 
 
435 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03949  glutamate/aspartate:proton symporter  31.37 
 
 
437 aa  190  4e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03909  hypothetical protein  31.37 
 
 
437 aa  190  4e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4633  glutamate/aspartate:proton symporter  31.37 
 
 
437 aa  190  4e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4322  glutamate/aspartate:proton symporter  31.37 
 
 
437 aa  190  4e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3259  sodium:dicarboxylate symporter  32.41 
 
 
440 aa  190  4e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3362  sodium:dicarboxylate symporter  32.41 
 
 
440 aa  190  4e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6252  sodium:dicarboxylate symporter  31.14 
 
 
442 aa  189  7e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  normal  0.842573 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0743  sodium:dicarboxylate symporter  32.33 
 
 
433 aa  189  8e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1976  proton/sodium-glutamate symport protein  30.24 
 
 
426 aa  188  1e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.809578  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4649  sodium:dicarboxylate symporter  32.65 
 
 
437 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0863  sodium:dicarboxylate symporter  31.51 
 
 
443 aa  188  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0233  proton/glutamate symporter  31.49 
 
 
443 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0174  glutamate/aspartate:proton symporter  31.25 
 
 
443 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0768  sodium:dicarboxylate symporter  31.23 
 
 
444 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3549  sodium:dicarboxylate symporter  31.23 
 
 
444 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5090  glutamate/aspartate:proton symporter  32.2 
 
 
442 aa  187  4e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.293053  normal  0.123213 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3671  sodium:dicarboxylate symporter  31.23 
 
 
444 aa  187  4e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0775  sodium:dicarboxylate symporter  31.91 
 
 
432 aa  186  7e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5422  sodium:dicarboxylate symporter  31.66 
 
 
427 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.747833  normal  0.94668 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1957  putative glutamate symport transmembrane protein  33.09 
 
 
428 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0662435  normal  0.97409 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0742  proton/sodium-glutamate symport protein  29.95 
 
 
421 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000616985  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0862  sodium:dicarboxylate symporter  31.59 
 
 
449 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0155  glutamate/aspartate:proton symporter  31.72 
 
 
442 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3480  sodium:dicarboxylate symporter  30.73 
 
 
444 aa  182  7e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0153  glutamate/aspartate:proton symporter  31.48 
 
 
442 aa  182  7e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.886104 
 
 
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NC_011894  Mnod_2071  sodium:dicarboxylate symporter  33.09 
 
 
446 aa  182  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.941586  n/a   
 
 
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NC_010002  Daci_4295  sodium:dicarboxylate symporter  30.95 
 
 
490 aa  182  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.19773  normal 
 
 
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NC_007908  Rfer_3455  sodium:dicarboxylate symporter  29.13 
 
 
433 aa  181  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0277  glutamate/aspartate:proton symporter  32.13 
 
 
437 aa  181  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.689217 
 
 
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NC_008392  Bamb_6427  sodium:dicarboxylate symporter  31.39 
 
 
439 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.428964 
 
 
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NC_010552  BamMC406_3205  sodium:dicarboxylate symporter  30.07 
 
 
435 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_008391  Bamb_5060  sodium:dicarboxylate symporter  30.07 
 
 
434 aa  180  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.154454  normal 
 
 
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